ValueError: nan is not in list
Je souhaite extraire des données sur les nouveaux cas de COVID en Belgique par région à partir d'un fichier csv de Sciensano (anciennement institut de santé publique).
Ce csv à la structure suivante :
DATE PROVINCE REGION AGEGROUP SEX CASES
2020-03-01 Brussels Brussels 10-19 M 1
2020-03-01 Brussels Brussels 10-19 F 1
2020-03-01 Brussels Brussels 20-29 M 1
Le problème est qu'il y a des données manquantes avec la valeur NaN. Lorsque je cherche l'index de la position d'une valeur de la colonne REGION (lignes 24 à 33), l'erreur ValueError: nan is not in list s'affiche.
Voici le code :
Code:
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import pandas as pd
import io
import requests
import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
from datetime import date, timedelta
url_CC = "https://epistat.sciensano.be/Data/COVID19BE_CASES_AGESEX.csv"
s_CC = requests.get(url_CC).content
df_CC = pd.read_csv(io.StringIO(s_CC.decode('iso_8859_1')))
df_CC['REGION'] = df_CC['REGION'].astype(str)
liste_dates = df_CC['DATE'].values
liste_dates= liste_dates.astype(str)
liste_dates = list(set(liste_dates))
liste_dates.sort()
len_liste_dates = len(liste_dates)
Bruxelles_CC=[0 for i in range(len_liste_dates)]
Wallonie_CC=[0 for i in range(len_liste_dates)]
Flandre_CC=[0 for i in range(len_liste_dates)]
for i in range(0,len(df_CC)):
if df_CC.iloc[i,2] == "Brussels":
position = liste_dates.index(df_CC.iloc[i,0])
Bruxelles_CC[position]=Bruxelles_CC[position] + df_CC.iloc[i,5]
if df_CC.iloc[i,2] == "Flanders":
position = liste_dates.index(df_CC.iloc[i,0])
Flandre_CC[position]=Flandre_CC[position] + df_CC.iloc[i,5]
if df_CC.iloc[i,2] == "Wallonia":
position = liste_dates.index(df_CC.iloc[i,0])
Wallonie_CC[position]=Wallonie_CC[position] + df_CC.iloc[i,5]
Bruxelles_cumul_CC=np.cumsum(Bruxelles_CC)
Flandre_cumul_CC=np.cumsum(Flandre_CC)
Wallonie_cumul_CC=np.cumsum(Wallonie_CC)
Belgique_cumul_CC = list(map(sum, zip(Bruxelles_cumul_CC,Wallonie_cumul_CC,Flandre_cumul_CC))) |
Comment peut-on résoudre cette erreur ?
