Lister fichiers par leurs versions en BASH

Version imprimable

Bonjour

Est ce que quelqu'un aurait une idée de comment trier des fichiers en fonction de leur version :

Input
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 AB-00017938-1_r264.mol2 AB-00058387-1_r271.mol2 AB-00024683-6_r265.mol2 Fr-PPIchem_05919-1_r266.mol2 Fr-PPIchem_09462-1_r263.mol2 AB-00047041-1_r267.mol2 AB-00060649-2_r268.mol2 AB-00067275-1_r269.mol2 AB-00027368-10_r270.mol2
Output
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 Fr-PPIchem_09462-1_r263.mol2 AB-00017938-1_r264.mol2 AB-00024683-6_r265.mol2 Fr-PPIchem_05919-1_r266.mol2 AB-00047041-1_r267.mol2 AB-00060649-2_r268.mol2 AB-00067275-1_r269.mol2 AB-00027368-10_r270.mol2 AB-00058387-1_r271.mol2
J'ai essai avec un

Code:

ls -R -t

mais cela ne fonctionne pas correctement

Merci beaucoup

07/04/2020, 18h01
disedorgue

Non, pas possible avec ls seul, voici une potentiel solution mais sur chaine pas sur numeric (et spécifique gawk) ...

Code:

printf "%s\n" * | gawk -F '_' 'BEGIN{PROCINFO["sorted_in"]="@val_str_asc"}{A[$0]=$NF}END{for (i in A) print i}'
07/04/2020, 18h16
judkil

Merci beaucoup mais je ne possède pas gawk. Effet l'idée serait de lister en fonction du " r*** " ou en regardant la fin. Le

Code:

ls -R -t

le fait presque mais il manque un petit truk
07/04/2020, 19h03
disedorgue

Le faire presque ça ne veut rien dire, le -t de ls c'est pour le time du fichier, il n'a rien à voir avec le nom du fichier.

Voici une autre solution:

Code:

printf '%s\n' * | sed 's/.*_r$[0-9]\+$\.mol2/\1 &/' | sort -n -k1 | sed 's/^[0-9]\+ //'

Et même si on ne doit pas utiliser ls dans du scripting, tu peux remplacer le printf '%s\n' * par ls -1 ou juste ls si sa sortie n'est pas lié directement au terminal.
07/04/2020, 19h06
N_BaH

Citation:

il manque un petit truk

au moins un : que tu lises le man pour com/ap-prendre ce que signifient les options que tu utilises.

mais de toutes façons, comme l'a dit disedorgue, ls n'est pas du tout la solution.

Bonjour :coucou:

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
$ while read ligne;do num="${ligne##*r}";echo "$ligne:${num%.mol2}";done < fichier.txt | sort -t: +1n | sed 's/:[^:]*$//'
Fr-PPIchem_09462-1_r263.mol2
AB-00017938-1_r264.mol2
AB-00024683-6_r265.mol2
Fr-PPIchem_05919-1_r266.mol2
AB-00047041-1_r267.mol2
AB-00060649-2_r268.mol2
AB-00067275-1_r269.mol2
AB-00027368-10_r270.mol2
AB-00058387-1_r271.mol2

07/04/2020, 22h37
judkil

Il s'agit d'une liste de fichiers avec l'extension .mol2, je dois prendre leur nom depuis un répertoire. Ce n'est pas un fichier qui contient une liste de noms.
07/04/2020, 22h52
N_BaH

à un moment, tu ponds une ligne de code ?

je veux dire une ligne de code sérieuse, pas un vague ls inadéquat.
07/04/2020, 22h55
disedorgue

ça tombe bien, la solution que je donne traite une liste de fichiers....
07/04/2020, 23h00
judkil

Je ne vois pas à quel moment l'on rentre le nom du répertoire.

Sinon merci beaucoup, la solution de disedorgue de 19h03 marche très bien !
07/04/2020, 23h24
disedorgue

par exemple:

Code:

printf "%s\n" /home/judkil/*.mol2 | sed .....

ou si tu es déjà dans le répertoire:

Code:

printf "%s\n" *.mol2 | sed ....

allez, un peu de bash pour la route :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 #!/bin/bash re='.*_r([^.]*).*' for f in * do [[ $f =~ $re ]] && fls[${BASH_REMATCH[1]}]=$f || >&2 echo "\"$f\" ne correspond pas au motif \"$re\"" done printf '%s\n' "${fls[@]}"
on suppose que le script est exécuté dans le répertoire où sont les fichiers.