Une macro pour une compilation de sélection ?

Version imprimable

28/03/2019, 17h30
frederic444

Une macro pour une compilation de sélection ?

Bonjour,

J'ai un projet important à réaliser et je suis bien motivé pour apprendre tout sur ImageJ et la programmation Java nécessaire avec, bien que je parte de 0.

Avant de me rendre compte que ce n'est pas possible, pourriez-me confirmer la possibilité de réaliser l'automatisation suivante
+ éventuellement quelques pistes si c'est possible, mais déjà la réponse à la faisabilité me donnerait espoir ;) (photoshop étant vraiment trop lourd malgré une macro qui automatise les opérations suivantes) :

Objectif : Création d'une image à partir de N images distinctes (N=4592 la plupart du temps), tel que l'image finale soit constituée de :

- 1ère colonne de pixel de l'image n°1
- la 2ème colonne de pixel de l'image n°2
-...
- 4592ème colonne de pixel de l'image n°4592

Chaque colonne serait copier successivement les unes à côté des autres pour constitué l'ensemble de l'image finale

Merci d'avance pour vos retours.
Fred

Bonjour,

Oui, c'est possible et facile à réaliser avec le langage macro de ImageJ. Tu as toutes les fonctions macro disponible ici (https://imagej.nih.gov/ij/developer/...functions.html).
Pour ta macro, tu pourrais créer une image vide (si tu connais la taille finale de ton image à créer), puis faire une boucle "for" pour ouvrir tes images les unes après les autres. Dans cette boucle "for", rajouter une deuxième boucle "for" qui lirais les pixels et les ecrirait dans l'image vide.

Voila grossièrement ce que ça pourrait donner.
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 newImage(title, type, width, height, depth); for (i=0; i<nombre d'images dans le dossier 4592; i++) { open image for(y=0; y<nombre de pixel dans la colonne; y++) { selectionner image ouverte valeurPixel = get pixel (i; y) selectionner image vide setPixel (i; y; valeurPixel) } close Image }
Je peux t'aider si tu bloques.

29/03/2019, 10h21
frederic444

Bonjour,

Déjà, merci pour la bonne nouvelle Tchoukatroc !

Merci pour les pistes, voire le début de solution, je me penche dessus ce we.

Fred

PS : C'est globalement la macro que j'avais faite pour photoshop, mais avec la possibilité de copier une colonne entière directement (et non pas pixel par pixel) mais l'impossibilité dramatique d'aller directement à la colonne i, mais par incrémentation depuis la première colonne
29/03/2019, 10h33
Tchoukatroc

Tu pourrais aussi faire une région de 1 pixel de large et n pixels de haut (makeRectangle(x, y, largeur, hauteur), et faire un copier coller de la colonne. Tu peux bouger ta région avec Roi.move(x, y). Cette méthode serait surement plus rapide que de récupérer la valeur pixel par pixel.
Tu peux aussi utiliser la fonction SetBatchMode() si tu veux gagner en vitesse d’exécution de la macro.

Bon, après essais, bricolages et recherches, je m'en suis sorti en faisant comme ça :

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
 
 
newImage("Coueron", "RGB", 4592, 3064, 1);
imageTitle=getTitle()
dir = getDirectory( "Choose the Directory" ); 
list = getFileList( dir );                                                // je comprend pas bien la manip encore, mais ca marche
i=0;
setBatchMode(true);
while (i<=4591)
{
	open( dir + list[i]);
	makeRectangle(i,0,1,3064);
	run("Copy");
	selectWindow(imageTitle);
	run("Paste");                                         // là, le pbme, c'est qu'il colle automatiquement au centre de l'image, 
	run("Copy");                                         //donc je recopie 
        setSelectionLocation(i, 0);                     //pr le repositionner... car je n'ai pas réussis à maîtriser roi.move aussi;)
	run("Paste");
	selectWindow(list[i]);
	run("Close");
 
i=i+1;
}
setBatchMode(false);
 
open( dir + list[2296]);                                // là je remet pour finir, la colonne du milieu polluée par ts les coller successifs de la boucle
	makeRectangle(i,0,1,3064);
	run("Copy");
	selectWindow(imageTitle);
	run("Paste");
	selectWindow(list[i]);
	run("Close");
 
showMessage("Over", "<html>"
     +"<h1><font color=red><i>Compilation terminéeFin</i></h1>");

je sais pas si c'est opti du point de vue du code, mais ça fait le taf...faut que je vérifie aussi si ya pas de pertes de qualité d'images

Merci pr ton lead!!
Fred

Et comme ça, est ce que la macro fonctionne?

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
 
 
newImage("Coueron", "RGB", 4592, 3064, 1);
imageTitle=getTitle()
dir = getDirectory( "Choose the Directory" ); 
list = getFileList( dir );                                                // je comprend pas bien la manip encore, mais ca marche
i=0;
setBatchMode(true);
while (i<=4591)
{
	open( dir + list[i]);
	makeRectangle(i,0,1,3064);
	run("Copy");
	selectWindow(imageTitle);
	makeRectangle(i,0,1,3064);
	run("Paste");                                         // là, le pbme, c'est qu'il colle automatiquement au centre de l'image, 
	selectWindow(list[i]);
	run("Close");
 
i=i+1;
}
setBatchMode(false);
 
showMessage("Over", "<html>"
     +"<h1><font color=red><i>Compilation terminéeFin</i></h1>");

01/04/2019, 20h45
frederic444

J'avais essayé ça, mais ca ne marche pas. mais pas de probleme, la reprise finale fait le taf.

Par contre, sais-tu a tout hasard comment (si c'est possible) diminuer la perte de qualité.
J'importe du jpg, j'exporte l'image final en jpg, et je divise par 4 la qualité ?
03/04/2019, 13h33
Tchoukatroc

Pourrais-tu envoyer une de tes images, ou un lien vers l'une d'elle, pour que je puisse regarder
03/04/2019, 19h40
frederic444

1 pièce(s) jointe(s)

Lien pr récup une photo type : https://wetransfer.com/downloads/6b7...3173454/de2754

Mais j'ai le sentiment que je ne pourrais pas éviter cette grosse dégradation de qualité avec imagej ...^^
retour à la cas départ!
04/04/2019, 09h35
Tchoukatroc

Je ne comprend pas que tu aies une dégradation de l'image en faisant juste un copier-coller, c'est bizarre. ImageJ est sensé copier la valeur des pixels et la coller dans une autre image. As-tu comparé la valeur des pixels entre une des image originales et la copie. Si tu ouvre une image et que tu places la souris sur l'image, il y aura la position XY du pixel pointé par la souris, + sa valeur. Est-ce que cette valeur change sur la copie?
Sinon, as-tu vérifié les ajustements de contrastes, qui pourrait écraser la dynamique de ton image, ils sont peut-être différents sur la copie. C'est dans Image-> adjust -> brightness/contrast. Dans ce menu (fonction set), tu peux appliquer les réglages d'une image sur les autres images ouvertes. Tu pourrais essayer d'appliquer les réglages de l'un de tes originaux sur ta copie.
08/04/2019, 14h16
frederic444

1 pièce(s) jointe(s)

Après vérif :
- J'ai effectivement un changement de valeurs ds chaque pixel (un 58,62,65 se transforme par exemple en 28,44,44; ou encore 52,84,135 devient 57,88, 143) Ca implique une genre d’aplatissement, diminution contraste couleur.
- Ci contre un zoom (macro a gauche, originales à droite)
- ajustement contraste... identiques

Qd j'ouvre l'image résultant de la macro sur photoshop, je vois bien que la résolution initiale de 180pixel/pouce est diminué à 72pixel/pouce... je pense en fin de compte que c'est pas le bon logiciel pr traiter cette qualité (?)

Pièce jointe 464848