problème dictionnaire python3 débutant
Bonjour,
actuellement débutant en python3 j'aurais besoin d'aide pour un exercice.
En effet j'ai un fichier "gène csv" avec dedans des lignes d'espèces avec un gène précis.
Un petit exemple pour mieux voir :
Code:
1 2 3 4 5 6
| sacs chro SUSAZ_00115 complement(15609..16733) cysteine desulfurase Genes.78052
sacs chro SUSAZ_00120 complement(16720..18426) AMP-dependent synthetase K01895 Genes.23416
sacs chro SUSAZ_00125 complement(18438..18914) nucleotide binding protein PINc K07060 Genes.790508
sacs chro SUSAZ_00130 complement(18904..19650) inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase K00858 Genes.275996
sacs chro SUSAZ_00135 complement(19659..19943) hypothetical protein Genes.791779
sacs chro SUSAZ_00140 20092..21093 ferredoxin--NADP reductase K00384 Genes.145309 |
Sacs est une espèces parmi les 2800, j'aimerai faire un dictionnaire de type set avec en clef le nom de l'espèce (ici sacs, mais les autres espèces aussi) et en valeur leurs gène (ici Genes.78052 , Genes.23416 etc etc)
De ce style là : dico[sacs]= 'Genes.145309', 'Genes.791779' ...
Hors je ne comprends pas cela veut pas et j'ai beau chercher sur internet je ne trouve pas de solution :/ Votre aide sera la bienvenue.
Je vous montre mon script actuel :
Code:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13
| import re
from collections import defaultdict
dicoesp= defaultdict(set) #dictionnaire d'espece
with open('genes.csv', 'r') as F1:
for ligne in F1:
lignepropre=ligne.rstrip('\n')
lignesplit=lignepropre.split('\t')
#print(lignesplit[0])
#print(lignesplit[-1])
a=lignesplit[0]
b=lignesplit[-1]
dicoesp[a]={b}
print(dicoesp['sacs']) |
#pour essayer avec une seule espèce et voir si cela marché, pour l'instant cela m'affiche rien de concluant
Merci d'avance :)