[Python3.x] Lire un fichier par ftp

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12/10/2018, 15h33
Supernatural

[Python3.x] Lire un fichier par ftp

Bonjour,

Je voudrais savoir s'il est possible de lire un fichier par ftp sans le copier?

Merci
12/10/2018, 15h58
tyrtamos

Bonjour,

Il faudra, bien entendu, que le contenu du fichier ftp soit téléchargé! Le seule chose qu'on peut essayer d'éviter, c'est l'enregistrement sur disque.

On devrait pouvoir le faire avec un fichier virtuel du module "io" (Python 3). Pour un fichier texte, la classe "StringIo" devrait convenir. Pour un fichier binaire, voir les autres classes de ce module. Avec Python 2, StringIo était un module.
12/10/2018, 16h59
wiztricks

Salut,

Citation:

Envoyé par Supernatural

Je voudrais savoir s'il est possible de lire un fichier par ftp sans le copier?

La réponse sera oui au sens où vous n'êtes pas obligé de créer une copie locale du fichier (en gardant tout en mémoire). Mais je serais curieux de savoir quel problème cherchez vous à résoudre.

- W

Bonjour,

Comme je n'avais jamais fait ça, et que je suis curieux, j'ai essayé:

On ne détaillera pas ici l'ouverture et la fermeture de la connexion FTP
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 from io import BytesIO # ouvre la connexion FTP => ftp # adresse du fichier sur le serveur FTP fichierftp = "adresse/du/fichier/sur/le/serveur/FTP" # ouvre un fichier virtuel en mémoire flocal = BytesIO() # télécharge le fichier sous forme binaire (donc => bytes): ftp.retrbinary('RETR ' + fichierftp, flocal.write) # convertit les bytes en strings (il faut connaître l'encodage) texte = str(flocal.getvalue(), encoding='utf-8') # affiche les lignes de texte for ligne in texte.splitlines(): print(ligne) # ferme le fichier virtuel flocal.close() # ferme la connexion FTP
Bien sûr, s'il faut afficher le fichier texte dans un éditeur de texte de l'OS, il y a un petit problème: les éditeurs demandent en général un fichier sur disque. On pourrait peut-être passer par un copier-coller, mais il y a une autre possibilité tout de même: utiliser une bibliothèque graphique: en accédant à un éditeur directement par son code, on pourrait lui donner une chaine de caractères à afficher. Mais ça complique sérieusement le développement...

15/10/2018, 08h09
Supernatural

Bonjour,

Je souhaite juste lire un fichier par ftp (sans le télécharger, ni rien d'autre... juste ouvrir, lire puis fermer) et stocker ses données dans un array pour les traiter, ça n'a pas l'air trè compliqué mais ça m'occupe...
15/10/2018, 09h37
tyrtamos

Bonjour,

Citation:

Envoyé par Supernatural

Je souhaite juste lire un fichier par ftp (sans le télécharger, ni rien d'autre... juste ouvrir, lire puis fermer) et stocker ses données dans un array pour les traiter...

Je pensais avoir répondu à cette question, aussi, j'insiste: tu ne peux pas visualiser le contenu du fichier sans le télécharger! et encore moins récupérer ses données dans un array. Tu peux juste éviter son enregistrement sur disque local: il reste alors en mémoire pour traitement. Si c'est pour aller plus vite, peut-être qu'un disque virtuel en RAM serait plus adapté?
15/10/2018, 09h43
Supernatural

Juste pour ma culture personnelle, pourquoi je ne peux pas par ftp ouvrir un fichier, le lire ligne par ligne (en parallele stocker chaque ligne lue dans un array), ensuite fermer le fichier?
Dans un autre language de programmation, j'arrive à faire cela sans avoir à le télécharger ou stocker quelque part... sauf si c'est moi qui ne comprend rien à la philosophie ftp.
15/10/2018, 10h07
wiztricks

Citation:

Envoyé par Supernatural

j'arrive à faire cela sans avoir à le télécharger ou stocker quelque part... sauf si c'est moi qui ne comprend rien à la philosophie ftp.

FTP est un protocole Internet et ce qu'il fait (ou pas) n'a rien à voir avec le langage de programmation.
Maintenant, rien n'empêche de coder une fonctionnalité pour rendre transparent le chargement d'un tableau à partir d'un téléchargement distant fait via FTP. Par exemple avec numpy, vous avez la fonctionnalité de DataSource.

- W

Code:

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from io import BytesIO 
 
# ouvre la connexion FTP => ftp
 
# adresse du fichier sur le serveur FTP
fichierftp = "adresse/du/fichier/sur/le/serveur/FTP"
 
# ouvre un fichier virtuel en mémoire
flocal = BytesIO()
 
# télécharge le fichier sous forme binaire (donc => bytes):
ftp.retrbinary('RETR ' + fichierftp, flocal.write)
 
# convertit les bytes en strings (il faut connaître l'encodage)
texte = str(flocal.getvalue(), encoding='utf-8')
 
# affiche les lignes de texte
for ligne in texte.splitlines():
    print(ligne)
 
# ferme le fichier virtuel
flocal.close()
 
# ferme la connexion FTP

Si je comprend bien, flocal est un fichier virtuel? il n'est écrit nul par c'est ça?

Citation:

Envoyé par Supernatural

...pourquoi je ne peux pas par ftp ouvrir un fichier, le lire ligne par ligne (en parallele stocker chaque ligne lue dans un array), ensuite fermer le fichier?...

Là, tu précises ton problème: tu veux lire et traiter ligne par ligne un fichier texte. Ça, ce sera plus simple:
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 def traiteligne(ligne): ligne = ligne.rstrip() # pour retirer la fin de ligne print(ligne) # ouvre la connexion FTP => ftp # adresse du fichier sur le serveur FTP fichierftp = "/chemin/tonfichiertexte.txt" # télécharge le fichier texte ligne par ligne: ftp.retrlines('RETR ' + fichierftp, traiteligne) # ferme la connexion FTP
On utilise retrlines du module ftplib, qui TELECHARGERA ligne par ligne et enverra chaque ligne comme argument de la fonction "traiteligne" qui pourra afficher, stocker dans un tableau, etc...

A voir comment on traite les pb d'encodage (je n'ai plus le temps maintenant: dis si tu as ce pb)

J'ai essayé ta fonction qui marche bien pour le moment :mrgreen:

Par contre j'ai ce défaut là au bout de 2 minutes: (fermeture automatique de la connexion ftp?):

Code:

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ftp.retrbinary('RETR ' + self.tree.item(curItem)['values'][2], LOCAL_FILE.write)
  File "C:\Python_3.7\lib\ftplib.py", line 441, in retrbinary
    self.voidcmd('TYPE I')
  File "C:\Python_3.7\lib\ftplib.py", line 278, in voidcmd
    return self.voidresp()
  File "C:\Python_3.7\lib\ftplib.py", line 251, in voidresp
    resp = self.getresp()
  File "C:\Python_3.7\lib\ftplib.py", line 244, in getresp
    raise error_temp(resp)
ftplib.error_temp: 421 Timeout (120 seconds): closing control connection.

Ci-joint mon code complet:

Code:

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from configparser import ConfigParser
import tkinter as tk
from tkinter import *
from tkinter import ttk
from tkinter.ttk import *
from tkinter import font
from tkinter import Listbox
import ftplib
import os
from datetime import datetime, timedelta
from pytz import timezone
import string
import array
from io import BytesIO
import numpy
 
 
#Application parameters 
#FTP parametrers
CFG_FILE             = ConfigParser()
CFG_FILE.optionxform = str
CFG_FILE.read('ini/application.ini')
print(os.getlogin()+' connected')
APPLICATION_NAME     = CFG_FILE.get('APPLICATION_PARAMETERS', 'APPLICATION_NAME')
LINE_NAME            = CFG_FILE.options('NETWORK_PARAMETERS')
NUMBER_OF_LINE       = len(LINE_NAME)
global FTP_USER, FTP_PASSWORD, DELTA_TIME, Cell_folder
FTP_USER             = CFG_FILE.get('SECRET', 'USER')
FTP_PASSWORD         = CFG_FILE.get('SECRET', 'PASSWORD')
DELTA_TIME           = CFG_FILE.get('FTP_PARAMETERS', 'DeltaTime')
 
class Application(ttk.Frame):
 
    def __init__(self, main_window):
        super().__init__(main_window)
        main_window.title(APPLICATION_NAME)
        main_window.iconbitmap(r'ini/graph_icon.ico')
        main_window.geometry('1200x700')
        Mainfont          = font.Font(main_window, family='Courier new', size='10')
 
        self.LabelOfLine  = ttk.Label(main_window, text="Select a line:", font=Mainfont)
        self.LabelOfLine.place(x=5, y=10)
 
        self.Combo_line   = ttk.Combobox(values=LINE_NAME, state="readonly", font=Mainfont)
        self.Combo_line.place(x=5, y=30)
        self.Combo_line.bind('<<ComboboxSelected>>', self.FTP_GET_folder)
 
        self.LabelOfLine  = ttk.Label(main_window, text="Select a cell:", font=Mainfont)
        self.LabelOfLine.place(x=5, y=60)
 
        self.Cell_listbox = Listbox(main_window, font=Mainfont, height=16, width=22)
        self.Cell_listbox.place(x=5, y=80)
        self.Cell_listbox.bind('<Double-1>', self.FTP_GET_FilesIntoFolder)
 
        self.LabelOfFile  = ttk.Label(main_window, text="Select a file:", font=Mainfont)
        self.LabelOfFile.place(x=200, y=60)
 
        self.tree         = ttk.Treeview(main_window)
        style             = ttk.Style()
        style.configure("Treeview.Heading", font=('Courier new', 10))
        style.configure("Treeview", font=('Courier new', 10))
        self.tree["columns"] = ("one","three", "four")
        self.tree.column("#0", width=230, minwidth=0, stretch=tk.NO)
        self.tree.column("one", width=190, minwidth=0, stretch=tk.NO)
        #self.tree.column("two", width=400, minwidth=200)
        self.tree.column("three", width=100, minwidth=0, stretch=tk.NO)
        self.tree.column("four", width=400, minwidth=0, stretch=tk.NO)
 
        self.tree.heading("#0",text="Nom",anchor=tk.W)
        self.tree.heading("one", text="Date",anchor=tk.W)
        #self.tree.heading("two", text="Type",anchor=tk.W)
        self.tree.heading("three", text="Taille",anchor=tk.W)
        self.tree.heading("four", text="Chemin",anchor=tk.W)
        self.tree.place(x=200, y=80, height=275 , width=930)
        self.tree.bind('<Double-1>', self.FTP_OpenSelectedFile)
 
        self.place(width=300, height=200)
 
        self.NumberOfFile      = StringVar()                #Doesn't operate... why i don't know yet
        self.NumberOfFile      = ('DEFAULT_NUMBER_OF_FILE')
        self.LabelNumberOfFile = ttk.Label(main_window, text=self.NumberOfFile, font=Mainfont)
        self.LabelNumberOfFile.place(x=200, y=30)
 
    def FTP_GET_folder(self, event):
        global SELECTED_LINE, SERVER_NAME, ftp
        SELECTED_LINE               = self.Combo_line.get()
        print('Line '+SELECTED_LINE+' selected')
 
        FTP_PARAMETERS              = CFG_FILE.get('NETWORK_PARAMETERS', SELECTED_LINE)
        SERVER_NAME, PORT, FTP_PATH = FTP_PARAMETERS.split(";")
 
        ftp = ftplib.FTP()
        ftp.connect(SERVER_NAME, int(PORT))
        ftp.login(FTP_USER, FTP_PASSWORD)
 
        Names      = ftp.nlst(FTP_PATH)
        CurrentDir = ftp.pwd()
        SubDirs    = []
 
        for name in Names:
            chemin = name    
            okdir  = self.GET_Only_directories(ftp, chemin)
            if okdir:
                SubDirs.append(name)
 
        self.Cell_listbox.delete(0, END)
 
        for SubDir in SubDirs:
            SubDirSplit      = SubDir.split("/")
            LenOfSubDirSplit = len(SubDirSplit)      
            self.Cell_listbox.insert(END, SubDirSplit[LenOfSubDirSplit-1])
 
        #ftp.close()
 
    def GET_Only_directories(self, ftp, chemin):
        CurrentDir = ftp.pwd()
        try:
            ftp.cwd(chemin)
            ftp.cwd(CurrentDir)
            return True
        except Exception:
            return False
 
    def FTP_GET_FilesIntoFolder(self, event):
        global FTP_PATH, Cell_folder
        try:
            index       = self.Cell_listbox.curselection()[0]
            Cell_folder = self.Cell_listbox.get(index)
            print('Cell '+Cell_folder+' selected')
 
            for i in self.tree.get_children():
                self.tree.delete(i)
 
            FTP_PARAMETERS              = CFG_FILE.get('NETWORK_PARAMETERS', SELECTED_LINE)
            SERVER_NAME, PORT, FTP_PATH = FTP_PARAMETERS.split(";")
            ftp                         = ftplib.FTP()
            ftp.connect(SERVER_NAME, int(PORT))
            ftp.login(FTP_USER, FTP_PASSWORD)
 
            ftp.cwd(FTP_PATH+Cell_folder)
            files         = []
            iFile         = 0
            FilteredFiles = [] 
            files         = ftp.nlst()
 
            #Here the exclude files
            for file in files:
                if file.split('.')[-1]   == 'txt':
                    continue
                elif file.split('.')[-1] == 'io':
                    continue
                else:
                    FilteredFiles.append(file)
 
            #Here all files with filters
            for i in FilteredFiles:
                self.DT_convertion(ftp, i)
                self.tree.insert('', 'end', text=i, values=(self.DT_convertion(ftp, i), ftp.size(i), FTP_PATH+Cell_folder+'/'+i))
                iFile +=1
 
            if iFile==1:
                print('One file found')            
                self.NumberOfFile.set("One file found")                 #Doesn't operate... why i don't know yet
            elif iFile>1:
                print(iFile, 'files found')
                self.NumberOfFile.set(str(iFile) + " files found")      #Doesn't operate... why i don't know yet
            else:
                print('No file found')
                self.NumberOfFile.set("No file found")                  #Doesn't operate... why i don't know yet
 
            return True
        except Exception:
            return False
 
    #Here date time of file according local (set in config file)
    def DT_convertion(self, ftp, i):
        utc_dt   = ftp.sendcmd('MDTM '+i)[4:]
        a, m, j  = int(utc_dt[:4]), int(utc_dt[4:6]), int(utc_dt[6:8])
        h, mn, s = int(utc_dt[8:10]), int(utc_dt[10:12]), int(utc_dt[12:])
        local_dt = datetime(a, m, j, h, mn, s)
        local_dt = local_dt+timedelta(hours=int(DELTA_TIME))
        return local_dt.isoformat(sep=' ')
 
    #Here opening of selected file in ListView
    def FTP_OpenSelectedFile(self, event):
        curItem = self.tree.focus()
 
        LOCAL_FILE = BytesIO()
        ftp.retrbinary('RETR ' + self.tree.item(curItem)['values'][2], LOCAL_FILE.write)
 
        TEXT = str(LOCAL_FILE.getvalue(), encoding='utf-8')
        FILE_CONTENT = []
        iLine = 0
        for LINE in TEXT.splitlines():
            #print(LINE)
            FILE_CONTENT.append(LINE.replace("'", "").strip())
            iLine+=1
 
        # ferme le fichier virtuel
        LOCAL_FILE.close()
 
        #Search of the empty line--------------------
        COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY=0
        #print(iLine)
 
        for READ_ROW in FILE_CONTENT:
            if READ_ROW.strip() != "" :
                COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY+=1
            else:
                break
 
        #Search of the mm;kN line--------------------
        STANDARD_CURVE_INDEX = []
        CALIBRATION_CURVE    = []
        START_OF_DATA_CURVE  = 1
 
        for READ_ROW in FILE_CONTENT:
            if READ_ROW.strip() != "mm;kN":
                START_OF_DATA_CURVE+=1
            elif READ_ROW.strip() != "mm;kN;kN":
                START_OF_DATA_CURVE+=1
            else:
                break
 
        print(START_OF_DATA_CURVE)
 
        #print(COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY)
        #End of search-------------------------------
 
        #Get Header of curve file
        #Character remplacement----------------------
        a=0
        while a <= COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY:
            print(FILE_CONTENT[a].replace(";", ""))
 
            a+=1
 
        #Do not delete below:
        #Character substitution
 
        DATA_CURVE = []
 
  #      print(COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY)
   #     print(iLine)
        for i in range(COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY, iLine):
            print(FILE_CONTENT[i])
 
main_window = tk.Tk()
app = Application(main_window)
app.mainloop()

15/10/2018, 16h47
wiztricks

Citation:

Envoyé par Supernatural

Par contre j'ai ce défaut là au bout de 2 minutes: (fermeture automatique de la connexion ftp?):

Je ne sais pas ce que font les traitements entre 2 lectures ftp, mais côté "timeout", le serveur a aussi son mot à dire donc, il va falloir accélérer un peu.

- W
16/10/2018, 11h36
Supernatural

En gros:
-FTP_GET_folder(): Liste les sous-dossiers d'un dossier selon choix ComboBox,
-FTP_GET_FilesIntoFolder(): Liste des fichiers contenus dans le dossier sélectionné dans la ListBox,
-FTP_OpenSelectedFile(): Ouvre le fichier sélectionné dans la ListView...

Pour en revenir à mon problème de timeout, c'est effectivement bizarre... c'est surtout balot si au bout de 2 minutes si je laisse mon application ouverte je sois obligé de refaire une sélection ComboBox, etc...
16/10/2018, 12h07
wiztricks

Citation:

Envoyé par Supernatural

Pour en revenir à mon problème de timeout, c'est effectivement bizarre... c'est surtout balot si au bout de 2 minutes si je laisse mon application ouverte je sois obligé de refaire une sélection ComboBox, etc...

C'est de la programmation réseau: ce n'est pas fiable, donc çà peut partir en erreur qu'il faut gérer en les attrapant et mettant en face un mécanisme de reprise pour que ce soit transparent.

- W
16/10/2018, 12h39
Supernatural

ok, mais alors là ce n'est pas gagné... je pense que dans mon code ci-dessus la connexion est sûrement améliorable, mais vu que je débute en python c'est pas chose aisée pour moi...
16/10/2018, 15h02
tyrtamos
Bonjour,

Je viens d'essayer un truc: j'ai créé un gros fichier texte de 4Go avec 100.000 lignes au hasard, je l'ai mis sur mon serveur FTP, et je l'ai relu ligne par ligne avec ftp.retrlines: aucun problème, les 100.000 lignes sont lues sans erreur.

J'ai ensuite ajouté sleep(0.1) dans la fonction qui traite chaque ligne pour simuler une charge de traitement. Cela ralentit sérieusement la lecture, mais ça ne donne aucune erreur. Idem si je monte à sleep(1) (=1 seconde entre chaque ligne!).

Ce n'est donc pas le code Python qui pose problème, mais la partie réseau.

Je te propose quelque chose pour avancer: ajoute la ligne suivante avant ftp.retrlines:

Code:

ftp.set_debuglevel(2)

Avec ce code, les lignes spécifiques au protocole FTP seront ajoutées aux lignes du fichier. L'intéret est que lorqu'il y aura une erreur, on verra ce que le protocole FTP renverra, et donc la cause de l'erreur. Par exemple, avec une simulation d'une erreur de timout, les dernières lignes renvoyées chez moi sont:
Code:

1 2 3 4 *cmd* 'QUIT' *put* 'QUIT\r\n' *get* '450 Transfer aborted. Link to file server lost\n' *resp* '450 Transfer aborted. Link to file server lost'
Et les codes FTP renvoyés entre 400 et 499 sont bien des problèmes de temporisation (exception ftplib.error_temp).

Voici le résultat:

Code:

1
2
3
4
*cmd* 'TYPE I'
*put* 'TYPE I\r\n'
*get* '421 Timeout (120 seconds): closing control connection.\n'
*resp* '421 Timeout (120 seconds): closing control connection.'

C'est grave Docteur?

16/10/2018, 16h11
tyrtamos

Comme c'est manifestement un timeout, tu peux essayer d'en mettre un comme argument à ftplib.FTP():

Code:

ftp = ftplib.FTP(timeout=1200) # soit 20 minutes

Peut-être que, sans ça, ton serveur n'accepte pas qu'un fichier soit ouvert plus de 2 minutes.
16/10/2018, 16h15
Supernatural

Ok je vais essayer ça
16/10/2018, 16h32
Supernatural

Bon même punition, je pense que ça dois provenir de mon code alors...
17/10/2018, 06h52
tyrtamos

Bonjour,

Si ton serveur ne supporte pas qu'une lecture dure plus de 2 mn, peut-être peux-tu revenir à la solution que je t'ai proposée avant avec io.BytesIO pour retrouver tout ton fichier en mémoire RAM, et pouvoir en reprendre chaque ligne pour traitement?

Ceci, bien sûr, si la taille du fichier reste compatible avec la taille mémoire RAM de ton PC. Si ce n'est pas le cas, le téléchargement sur disque parait inévitable...

J'utilise ta fonction justement...

Code:

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64
#Here opening of selected file in ListView
    def FTP_OpenSelectedFile(self, event):
        curItem = self.tree.focus()
 
        LOCAL_FILE = BytesIO()
        ftp.set_debuglevel(2)
        ftp.retrbinary('RETR ' + self.tree.item(curItem)['values'][2], LOCAL_FILE.write)
 
        TEXT = str(LOCAL_FILE.getvalue(), encoding='utf-8')
        FILE_CONTENT = []
        iLine = 0
        for LINE in TEXT.splitlines():
            #print(LINE)
            FILE_CONTENT.append(LINE.replace("'", "").strip())
            iLine+=1
 
        # ferme le fichier virtuel
        LOCAL_FILE.close()
 
        #Search of the empty line--------------------
        COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY=0
        #print(iLine)
 
        for READ_ROW in FILE_CONTENT:
            if READ_ROW.strip() != "" :
                COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY+=1
            else:
                break
 
        #Search of the mm;kN line--------------------
        STANDARD_CURVE_INDEX = []
        CALIBRATION_CURVE    = []
        START_OF_DATA_CURVE  = 1
 
        for READ_ROW in FILE_CONTENT:
            if READ_ROW.strip() != "mm;kN":
                START_OF_DATA_CURVE+=1
            elif READ_ROW.strip() != "mm;kN;kN":
                START_OF_DATA_CURVE+=1
            else:
                break
 
        print(START_OF_DATA_CURVE)
 
        #print(COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY)
        #End of search-------------------------------
 
        #Get Header of curve file
        #Character remplacement----------------------
        a=0
        while a <= COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY:
            print(FILE_CONTENT[a].replace(";", ""))
 
            a+=1
 
        #Do not delete below:
        #Character substitution
 
        DATA_CURVE = []
 
        #print(COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY)
        #print(iLine)
        for i in range(COUNT_LINE_BEFORE_EMPTY, iLine):
            print(FILE_CONTENT[i])

17/10/2018, 09h00
Supernatural

Citation:

Envoyé par tyrtamos

Si ton serveur ne supporte pas qu'une lecture dure plus de 2 mn...

J'ai la même application qui tourne (développée sous AutoIt) et je n'ai pas se soucis...

C'est pour ça que je pense plus à un problème de code qu'autre chose...
19/10/2018, 11h20
Supernatural

Je pense que j'ai résolu mon problème de timeout. Un problème de codage car je ne fermais pas ma connexion ftp...

Merci pour votre aide.