Tracer a partir d'un fichier .txt complexe

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Bonjour,

Je travaille actuellement sur un logiciel qui résout l’équation du transfert radiatif. En sortie, le logiciel me donne un fichier texte avec différentes quantités radiométriques et leurs valeurs du style :

42   0.30   0.25     1.2772E+00     1.7468E+00     3.0240E+00     6.3859E-01     1.1611E+00   0.5000   0.6647   0.1728     5.5000E-01
K-functions (units of 1/meter) at  490.0 nm (these are accurate local values only when zupper and zlower are closely spaced)
zupper    zlower       z      Kou(z)    Kod(z)    Ko(z)     Ku(z)     Kd(z)    Knet(z)    KLu(z)
0.000     0.010     0.005  -0.40211   0.30020   0.03711  -0.30866   0.28133   0.81322  -0.17571
0.013     0.022     0.018  -0.40968   0.29653   0.03052  -0.31067   0.28061   0.82122  -0.17567
0.025     0.035     0.030  -0.41768   0.29295   0.02379  -0.31270   0.27988   0.82946  -0.17563
0.037     0.048     0.042  -0.42620   0.28942   0.01687  -0.31477   0.27916   0.83793  -0.17557
0.050     0.060     0.055  -0.43535   0.28594   0.00970  -0.31687   0.27843   0.84666  -0.17551
0.062     0.072     0.068  -0.44527   0.28245   0.00219  -0.31902   0.27769   0.85565  -0.17544
0.075     0.085     0.080  -0.45611   0.27895  -0.00573  -0.32123   0.27694   0.86492  -0.17537
0.087     0.097     0.092  -0.46808   0.27540  -0.01417  -0.32350   0.27617   0.87449  -0.17528
0.100     0.110     0.105  -0.48139   0.27176  -0.02325  -0.32586   0.27538   0.88436  -0.17519
0.113     0.122     0.117  -0.49633   0.26801  -0.03312  -0.32832   0.27457   0.89456  -0.17509
0.125     0.135     0.130  -0.51324   0.26408  -0.04395  -0.33089   0.27372   0.90511  -0.17498
0.138     0.148     0.143  -0.53253   0.25994  -0.05596  -0.33360   0.27283   0.91604  -0.17486
0.150     0.160     0.155  -0.55469   0.25552  -0.06940  -0.33649   0.27189   0.92738  -0.17473
0.163     0.173     0.168  -0.58032   0.25074  -0.08458  -0.33958   0.27089   0.93917  -0.17459
0.175     0.185     0.180  -0.61014   0.24553  -0.10190  -0.34291   0.26981   0.95144  -0.17443
0.188     0.198     0.193  -0.64502   0.23976  -0.12181  -0.34654   0.26864   0.96424  -0.17425
0.200     0.210     0.205  -0.68599   0.23332  -0.14487  -0.35053   0.26736   0.97764  -0.17406
0.212     0.223     0.217  -0.73430   0.22603  -0.17177  -0.35495   0.26594   0.99170  -0.17384
0.225     0.235     0.230  -0.79144   0.21771  -0.20333  -0.35989   0.26436   1.00652  -0.17360
0.237     0.247     0.242  -0.85917   0.20811  -0.24055  -0.36547   0.26256   1.02219  -0.17333
0.240     0.250     0.245  -0.87417   0.20601  -0.24878  -0.36667   0.26218   1.02543  -0.17327
Radiances Just Above the Water Surface (at z = a) (units of W/m^2 sr nm) at  490.0 nm

J'aimerai donc tracer la valeur Kd en fonction de z (la profondeur), or je ne vois pas comment procéder. J'ai essaye de créer un tableau pour chaque ligne sans succes. J'ai essaye d'utiliser la commande np.loadtxt sans succes car impossible de sélectionner la bonne ligne et la bonne colonne. Pour l'instant mon code ressemble a cela, il m'a permis d'aligner les valeurs..

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
f = open('Pbref0.55_ws0.0_rss0.09_sza40_wl4.txt','r')
lines = f.readlines()
f.close()
f = open('Pbref0.55_ws0.0_rss0.09_sza40_wl4.txt','w')
for line in lines:
    if line!= 0:
        line = line.lstrip()
        f.write(line)
f.close()
 
with open('Pbref0.55_ws0.0_rss0.09_sza40_wl4.txt') as f:
    print(f.read())

Si quelqu'un aurait une piste pour recuperer ses valeurs dans mon fichier qui comporte environ 400 lignes.

Merci beaucoup.

05/09/2018, 15h13
lg_53

np.loadtxt est un bon début.
Dans ton fichier tu as un tableau de valeur, et c'est à priori seulement cela qui t'intéresse.
Les 3 premières lignes et la dernière ligne ne te sont pas utiles.

Pour ignorer les premières lignes, la documentation dit très bien comment faire :
https://docs.scipy.org/doc/numpy-1.1...y.loadtxt.html
avec un argument qui se nomme skiprows. Maintenant, toi ton problème c'est que tu veux aussi oublier la dernière ligne. Cependant là la documentation ne nous laisse pas non plus sur notre fin :

Citation:

Notes

This function aims to be a fast reader for simply formatted files. The genfromtxt function provides more sophisticated handling of, e.g., lines with missing values.
05/09/2018, 15h51
lulubellule

Oui, effectivement, j'ai essaye de me servir de np.loadtxt mais elle ne reconnait pas mes lignes d’intérêts, j'entends par la que quand je parcours mon fichier .txt avec np.loadtxt, a la ligne 324 elle reconnait la ligne qui commence par K-functions puis si je saute une ligne donc a la 325 elle reconnaitra la ligne qui commence par radiance. Je n'arrive pas a isoler mes lignes d'interets qui sont les valeurs.
05/09/2018, 16h09
lg_53

Citation:

Envoyé par lulubellule

puis si je saute une ligne donc a la 325 elle reconnaitra la ligne qui commence par radiance. Je n'arrive pas a isoler mes lignes d'interets qui sont les valeurs.

Regardez mieux la Note que je vous ai extraite de la documentation sur mon post précédent. Cette note vous indique que np.loadtxt est fait pour des fichiers dont le format est simple. Pour des formats plus compliqués, on vous renvoie vers une autre fonction.

Allez, un peu de lecture, il faut se la coltiner, je ne vous donnerais pas la réponse toute cuite.
05/09/2018, 17h21
Julien N

Salut,

Juste une précision. Les données sont-elles toujours rangées de la même façon? Je veux dire, est-ce que le nombre de lignes à ignorer en début et fin de fichier est constant? y'a-t-il un seul tableau à extraire, ou plusieurs au sein d'un même fichier?

Julien