Problème pour "parser" un fichier xml

Version imprimable

Bonjour,

Je galère avec xml.etree.ElementTree pour récupérer les données dont j'ai besoin.

Voici le code que je teste

Code:

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#!/usr/bin/python3
# -*-coding:utf-8 -*
 
import xml.etree.ElementTree as ET
 
tree = ET.parse("fichier.xml")
namespace = {"gpx": "http://www.topografix.com/GPX/1/1"} 
for elem in tree.findall('gpx:trkpt', namespace):
    altitude = elem.find('ele')
    heure = elem.find('time')
    lat = elem.get('lat')
    lon = elem.get('lon')
    #print(lat, lon)
    print(lat, lon, heure, altitude)

et le fichier que j'essaie de "parser"

Code:

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<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<gpx
  version="1.1"
  creator="Runkeeper - http://www.runkeeper.com"
  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
  xmlns="http://www.topografix.com/GPX/1/1"
  xsi:schemaLocation="http://www.topografix.com/GPX/1/1 http://www.topografix.com/GPX/1/1/gpx.xsd"
  xmlns:gpxtpx="http://www.garmin.com/xmlschemas/TrackPointExtension/v1">
  <name><![CDATA[Running 28/8/18 4:07 pm]]></name>
  <time>2018-08-28T16:07:08Z</time>
<trkpt lat="48.801130000" lon="2.432096000"><ele>40.0</ele><time>2018-08-28T16:07:08Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>93</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.801182000" lon="2.432334000"><ele>40.0</ele><time>2018-08-28T16:07:18Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>101</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.801259000" lon="2.432525000"><ele>40.0</ele><time>2018-08-28T16:07:28Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>111</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.801390000" lon="2.432719000"><ele>40.9</ele><time>2018-08-28T16:07:38Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>124</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.801501000" lon="2.433018000"><ele>41.7</ele><time>2018-08-28T16:07:48Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>129</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.801564000" lon="2.433322000"><ele>42.8</ele><time>2018-08-28T16:07:58Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>130</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.801625000" lon="2.433611000"><ele>43.5</ele><time>2018-08-28T16:08:08Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>134</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.801701000" lon="2.433925000"><ele>44.0</ele><time>2018-08-28T16:08:18Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>135</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.801876000" lon="2.434104000"><ele>45.4</ele><time>2018-08-28T16:08:28Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>135</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.802111000" lon="2.434184000"><ele>45.4</ele><time>2018-08-28T16:08:38Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>136</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.802352000" lon="2.434208000"><ele>44.1</ele><time>2018-08-28T16:08:48Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>138</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.802568000" lon="2.434170000"><ele>42.5</ele><time>2018-08-28T16:08:58Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>140</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.802742000" lon="2.434340000"><ele>41.4</ele><time>2018-08-28T16:09:08Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>139</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.802849000" lon="2.434383000"><ele>41.0</ele><time>2018-08-28T16:09:18Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>139</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.802973000" lon="2.434583000"><ele>40.2</ele><time>2018-08-28T16:09:28Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>138</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.803103000" lon="2.434905000"><ele>39.6</ele><time>2018-08-28T16:09:38Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>136</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.803234000" lon="2.435194000"><ele>38.6</ele><time>2018-08-28T16:09:48Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>136</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.803377000" lon="2.435457000"><ele>38.5</ele><time>2018-08-28T16:09:58Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>138</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.803513000" lon="2.435729000"><ele>38.3</ele><time>2018-08-28T16:10:08Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>138</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.803662000" lon="2.435998000"><ele>38.0</ele><time>2018-08-28T16:10:18Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>142</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="48.803792000" lon="2.436322000"><ele>38.8</ele><time>2018-08-28T16:10:28Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>142</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
</gpx>

Ce sont les lignes altitude = elem.find('ele') et heure = elem.find('time') qui me renvoient du "None" et si je code altitude = elem.find('ele').text j'obtiens un plantage.
Je ne sais pas si c'est encore un problème de namespace ...
Bref si quelqu'un a une idée pour que je puisse récupérer les valeurs en question

Merci

05/09/2018, 13h42
Bktero
Bonjour,

'ele' et 'time' ne font pas partie directement de l’élément gpx, ce sont des enfants. On peut les obtenir comme ceci :
Code:

1 2 altitude = elem[0].text heure = elem[1].text
Bon, ce qui m'ennuie ce sont les index qui obligent à garantir l'ordre... J'ai pas trouvé mieux pour le moment :aie:
05/09/2018, 13h43
wiztricks

Salut,

Citation:

Envoyé par xxxl76

Je ne sais pas si c'est encore un problème de namespace ...

C'est pas si compliqué de tester avec ou sans namespace...

- W
05/09/2018, 13h45
VinsS

Salut,

Regarde si ceci peut t'aider: https://bazaar.launchpad.net/~vincen...geolocation.py

Le parser de fichier gpx est définit à la ligne 523.

Le code utilise plutôt xml.sax parce que les fichiers .gpx peuvent être particulièrement lourd. Il m'est arrivé d'en avoir qui étaient impossibles à charger en mémoire.

Comme ceci :

Code:

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import xml.etree.ElementTree as ET
 
tree = ET.parse("fichier.xml")
namespace = {"gpx": "http://www.topografix.com/GPX/1/1"}
 
for elem in tree.findall('gpx:trkpt', namespace):
    lat = elem.get('lat')
    lon = elem.get('lon')
    altitude = elem.find('gpx:ele', namespace).text
    heure = elem.find('gpx:time', namespace).text
 
    print(lat, lon, heure, altitude)

Ce qui renvoi :

48.801130000 2.432096000 2018-08-28T16:07:08Z 40.0
48.801182000 2.432334000 2018-08-28T16:07:18Z 40.0
48.801259000 2.432525000 2018-08-28T16:07:28Z 40.0
48.801390000 2.432719000 2018-08-28T16:07:38Z 40.9
48.801501000 2.433018000 2018-08-28T16:07:48Z 41.7
48.801564000 2.433322000 2018-08-28T16:07:58Z 42.8
48.801625000 2.433611000 2018-08-28T16:08:08Z 43.5
48.801701000 2.433925000 2018-08-28T16:08:18Z 44.0
48.801876000 2.434104000 2018-08-28T16:08:28Z 45.4
48.802111000 2.434184000 2018-08-28T16:08:38Z 45.4
48.802352000 2.434208000 2018-08-28T16:08:48Z 44.1
48.802568000 2.434170000 2018-08-28T16:08:58Z 42.5
48.802742000 2.434340000 2018-08-28T16:09:08Z 41.4
48.802849000 2.434383000 2018-08-28T16:09:18Z 41.0
48.802973000 2.434583000 2018-08-28T16:09:28Z 40.2
48.803103000 2.434905000 2018-08-28T16:09:38Z 39.6
48.803234000 2.435194000 2018-08-28T16:09:48Z 38.6
48.803377000 2.435457000 2018-08-28T16:09:58Z 38.5
48.803513000 2.435729000 2018-08-28T16:10:08Z 38.3
48.803662000 2.435998000 2018-08-28T16:10:18Z 38.0
48.803792000 2.436322000 2018-08-28T16:10:28Z 38.8

Voir ici : Parsing XML with Namespaces

05/09/2018, 14h27
xxxl76
Merci à tous pour vos retours.
La solution de Jerome est parfaite.
J'avais testé un truc de ce genre mais sans trop comprendre (altitude = elem.find('trkpt:ele', namespace).text)

J'ai vraiment du mal avec cette structure et le fonctionnement du parser, car ensuite pour récupérer les valeurs de la balise <gpxtpx:hr>, il faut lui donner tout le chemin ?
J'ai essayé avec
- elem.find('gpx:hr', namespace).text
- elem.find('gpx:gpxtpx:hr', namespace).text
- elem.find('gpx:extensions:gpxtpx:hr', namespace).text
mais sans succès
05/09/2018, 14h32
Bktero

Code:

altitude = elem.find('gpx:ele', namespace).text

Rah ! Il me manquait le gpx:...

Je :plusser: !

Citation:

Envoyé par xxxl76

mais sans succès

Comme ceci :

Code:

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import xml.etree.ElementTree as ET
 
tree = ET.parse("fichier.xml")
namespaces = {"gpx": "http://www.topografix.com/GPX/1/1",
              "gpxtpx": "http://www.garmin.com/xmlschemas/TrackPointExtension/v1"}
 
for elem in tree.findall('gpx:trkpt', namespaces):
 
    lat = elem.get('lat')
    lon = elem.get('lon')
 
    altitude = elem.find('gpx:ele', namespaces).text
    heure = elem.find('gpx:time', namespaces).text
 
    for subelem in elem.find('gpx:extensions', namespaces):
        hr = subelem.find('gpxtpx:hr', namespaces).text
 
    print(lat, lon, heure, altitude, hr)

Ce qui renvoi :

48.801130000 2.432096000 2018-08-28T16:07:08Z 40.0 93
48.801182000 2.432334000 2018-08-28T16:07:18Z 40.0 101
48.801259000 2.432525000 2018-08-28T16:07:28Z 40.0 111
48.801390000 2.432719000 2018-08-28T16:07:38Z 40.9 124
48.801501000 2.433018000 2018-08-28T16:07:48Z 41.7 129
48.801564000 2.433322000 2018-08-28T16:07:58Z 42.8 130
48.801625000 2.433611000 2018-08-28T16:08:08Z 43.5 134
48.801701000 2.433925000 2018-08-28T16:08:18Z 44.0 135
48.801876000 2.434104000 2018-08-28T16:08:28Z 45.4 135
48.802111000 2.434184000 2018-08-28T16:08:38Z 45.4 136
48.802352000 2.434208000 2018-08-28T16:08:48Z 44.1 138
48.802568000 2.434170000 2018-08-28T16:08:58Z 42.5 140
48.802742000 2.434340000 2018-08-28T16:09:08Z 41.4 139
48.802849000 2.434383000 2018-08-28T16:09:18Z 41.0 139
48.802973000 2.434583000 2018-08-28T16:09:28Z 40.2 138
48.803103000 2.434905000 2018-08-28T16:09:38Z 39.6 136
48.803234000 2.435194000 2018-08-28T16:09:48Z 38.6 136
48.803377000 2.435457000 2018-08-28T16:09:58Z 38.5 138
48.803513000 2.435729000 2018-08-28T16:10:08Z 38.3 138
48.803662000 2.435998000 2018-08-28T16:10:18Z 38.0 142
48.803792000 2.436322000 2018-08-28T16:10:28Z 38.8 142

05/09/2018, 15h23
xxxl76

Merci beaucoup Jérôme pour ton aide
C'est pas le genre de solution que l'on trouve par hasard.
05/09/2018, 15h28
xxxl76

Peux tu m'expliquer à quoi sert la ligne ?

Code:

ext = elem.find('gpx:extensions', namespaces)
05/09/2018, 16h05
Jerome Briot

Citation:

Envoyé par xxxl76

Peux tu m'expliquer à quoi sert la ligne ?

Code:

ext = elem.find('gpx:extensions', namespaces)

À rien… c'était pour voir si tu suivais :mouarf:

Bonjour,

Me revoilà.
En fait je croyais pouvoir venir à bout de mon programme avec les éléments que j'avais mais ce fichier xml est trop fort pour moi.
Donc, j'avais un peu simplifié le fichier de départ, mais du coup si je reprends la vraie structure du fichier, je n'arrive pas à nouveau pas à le parser.
J'ai voulu appliquer la même méthode que pour récupérer le rythme cardiaque pour gérer cette arborescence supplémentaire mais sans succès.

Voici la vraie structure du fichier

Code:

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<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<gpx
  version="1.1"
  creator="Runkeeper - http://www.runkeeper.com"
  xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
  xmlns="http://www.topografix.com/GPX/1/1"
  xsi:schemaLocation="http://www.topografix.com/GPX/1/1 http://www.topografix.com/GPX/1/1/gpx.xsd"
  xmlns:gpxtpx="http://www.garmin.com/xmlschemas/TrackPointExtension/v1">
<trk>
  <name><![CDATA[Running 21/8/18 5:17 pm]]></name>
  <time>2018-08-21T17:17:34Z</time>
<trkseg>
<trkpt lat="35.332348000" lon="25.298450000"><ele>4.7</ele><time>2018-08-21T17:17:34Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>93</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332364000" lon="25.298455000"><ele>4.6</ele><time>2018-08-21T17:17:35Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>94</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332381000" lon="25.298462000"><ele>4.5</ele><time>2018-08-21T17:17:36Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>96</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332399000" lon="25.298471000"><ele>4.4</ele><time>2018-08-21T17:17:37Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>97</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332417000" lon="25.298482000"><ele>4.4</ele><time>2018-08-21T17:17:38Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>97</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332436000" lon="25.298494000"><ele>4.4</ele><time>2018-08-21T17:17:39Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>95</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332456000" lon="25.298508000"><ele>4.3</ele><time>2018-08-21T17:17:40Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>96</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332476000" lon="25.298524000"><ele>4.2</ele><time>2018-08-21T17:17:41Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>97</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332496000" lon="25.298540000"><ele>4.1</ele><time>2018-08-21T17:17:42Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>98</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332517000" lon="25.298557000"><ele>4.0</ele><time>2018-08-21T17:17:43Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>99</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332538000" lon="25.298576000"><ele>4.0</ele><time>2018-08-21T17:17:44Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>101</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332559000" lon="25.298594000"><ele>4.0</ele><time>2018-08-21T17:17:45Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>102</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332580000" lon="25.298614000"><ele>4.0</ele><time>2018-08-21T17:17:46Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>102</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332602000" lon="25.298633000"><ele>4.0</ele><time>2018-08-21T17:17:47Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>104</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332623000" lon="25.298653000"><ele>4.0</ele><time>2018-08-21T17:17:48Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>104</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332644000" lon="25.298672000"><ele>4.0</ele><time>2018-08-21T17:17:49Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>105</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
<trkpt lat="35.332665000" lon="25.298692000"><ele>4.0</ele><time>2018-08-21T17:17:50Z</time><extensions><gpxtpx:TrackPointExtension><gpxtpx:hr>106</gpxtpx:hr></gpxtpx:TrackPointExtension></extensions></trkpt>
</trkseg>
</trk>
</gpx>

Et en partant de ce code, je n'arrive pas à faire fonctionner le script quand les balises <trk> et <trkseg> sont présentes

Code:

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import xml.etree.ElementTree as ET
 
tree = ET.parse("fichier.xml")
namespaces = {"gpx": "http://www.topografix.com/GPX/1/1",
              "gpxtpx": "http://www.garmin.com/xmlschemas/TrackPointExtension/v1"}
 
for elem in tree.findall('gpx:trkpt', namespaces):
 
    lat = elem.get('lat')
    lon = elem.get('lon')
 
    altitude = elem.find('gpx:ele', namespaces).text
    heure = elem.find('gpx:time', namespaces).text
 
    for subelem in elem.find('gpx:extensions', namespaces):
        hr = subelem.find('gpxtpx:hr', namespaces).text
 
    print(lat, lon, heure, altitude, hr)

10/09/2018, 15h52
wiztricks

Salut,

Citation:

Envoyé par xxxl76

Et en partant de ce code, je n'arrive pas à faire fonctionner le script quand les balises <trk> et <trkseg> sont présentes

Relisez la documentation: findall ne cherche que dans les enfants directs du noeud.
Si vous voulez aller récupérer les noeuds qui commencent par trkpt beaucoup plus bas, il faut parcourir l'arbre à la main ou utiliser une expression XPath dur genre: tree.findall('.//gpx:trkpt', ns).

- W

Citation:

Envoyé par wiztricks

utiliser une expression XPath dur genre: tree.findall('.//gpx:trkpt', ns)

Ou en conservant les groupements parents/enfants :

Code:

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import xml.etree.ElementTree as ET
 
tree = ET.parse("fichier.xml")
namespaces = {"gpx": "http://www.topografix.com/GPX/1/1",
              "gpxtpx": "http://www.garmin.com/xmlschemas/TrackPointExtension/v1"}
 
for trk in tree.findall('gpx:trk', namespaces):
 
    for trkseg in trk.findall('gpx:trkseg', namespaces):
 
        for trkpt in trkseg.findall('gpx:trkpt', namespaces):
 
            lat = trkpt.get('lat')
            lon = trkpt.get('lon')
 
            altitude = trkpt.find('gpx:ele', namespaces).text
            heure = trkpt.find('gpx:time', namespaces).text
 
            for extensions in trkpt.find('gpx:extensions', namespaces):
                hr = extensions.find('gpxtpx:hr', namespaces).text
 
            print(lat, lon, heure, altitude, hr)

11/09/2018, 10h28
xxxl76

Merci pour vos retours

J'ai essayé hier avec la méthode de Wiztricks, ça fonctionne, mais ça a des impacts dans l'algo du programme, et j'ai pas encore tout analysé, mais certains fichiers ne passent plus alors qu'ils ne semblent pas avoir une structure différente.

Je vais essayer aujourd'hui si j'ai le temps la méthode de Jérôme et je vous tiens au courant. (je suis curieux car j'avais essayé un truc dans ce genre)

A suivre ...
15/09/2018, 11h09
xxxl76

C'est parfait !!!

C'est exactement e que je voulais.
J'ai pu finir mon programme sans modifier l'architecture.

Maintenant étape suivante, création de courbes de tendance avec MatPlotLib

Merci de votre aide