ouvrir un fichier .ent

Bonjour,

J'aimerais ouvrir un fichier .ent, c'est le format utilisé pour décrire les protéines (PDB: Protein Data Bank).
Il s'agit d'un simple fichier texte, qu'on peut ouvrir avec n'importe quel éditeur de textes mais pourtant la commande ifstream de <fstream> ne marche pas avec ce format .ent .
Ca marche pourtant bien si je convertis le fichier en fichier .txt, seulement je vais utiliser une base de données d'environ 100 000 fichiers (protéines) donc ça m'arrangerait particulièrement d'avoir une commande qui marche en C++ (ou en C)

Voilà les commandes avec lesquelles j'essaie d'ouvrir le fichier:

Code:

---

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18

#include <iostream> #include <string> #include <fstream>   using namespace std;   int main(){ ifstream fichier("d12asa_.ent", ios::in);   if (fichier){ cout << "fichier ouvert avec succès" << endl; fichier.close(); } else cerr << "Impossible d'ouvrir le fichier !" << endl;   return 0; }

---

Merci beaucoup de votre aide!

Salut,

Avant de commencer, je vais me permettre deux petites remarques rapides:
1- la directive using namespace std; ne devrait plus être utilisée depuis près de vingt ans. Tu devrais t'habituer à utiliser les noms pleinement qualifiés (ex: std::cout, std::cin, std::string, std::ifstream, ... ) à la place

2- A partir du moment où tu utilises la classe std::ifstream il est tout à fait normal que tu veux ouvrir un fichier en mode lecture seule, (ifstream == InputFileStream )... l'utilisation de ios::in n'est donc absolument pas nécessaire.

Maintenant, pour répondre à ta question :

Il n'y a que quatre raisons qui peuvent empêcher une application d'ouvrir un fichier:

1. tu n'as pas les droits d'accès au dossier dans lequel se trouve le fichier (ou sur le fichier lui-même)
2. tu as indiqué un mon de fichier incorrect
3. le fichier n'existe purement et simplement pas ou
4. le chemin d'accès au fichier ne correspond pas

Quand tu écris "simplement" le nom de fichier "tel quel" (par exemle d12asa_.ent") l'application recherche le fichier correspondant directement dans le dossier à partir duquel elle est exécutée. Et, bien sur, si le fichier ne se trouve pas dans ce dossier particulier, l'application n'arrivera pas à l'ouvrir ;)

Les trois premiers cas sont "relativement" facile à résoudre: il faut t'assurer que tu dispose bel et bien des droits suffisants pour aller ouvrir le fichier et que le fichier existe dans le dossier dans lequel il est sensé se trouver.

Le dernier point est parfois un peu plus compliqué à résoudre, car il est parfois difficile de déterminer à partir de quel dossier l'application est exécutée, surtout lorsqu'on essaye de l'exécuter au travers d'un EDI ou qu'on l'exécute au travers d'un raccourcis sous windows.

Mais une solution "simple" (si le fichier qu'on essaye d'ouvrir se trouve dans le même dossier que l'application qui essaye de l'ouvrir) peut être de lancer un "invite de commande", de naviguer (à l'aide de la commande cd) jusqu'au dossier dans lequel se trouvent l'application et le fichier, puis de lancer l'application directement en ligne de commande ;)

Peut-on imaginer (surtout sous Windows ?) que le fichier est déjà ouvert par un autre programme ?