Fonction MATLAB sous python

Bonjour à tous,
Je souhaiterai faire une boucle sous python me permettant d'appeler 2 fonctions Python et 1 fonction Matlab de ce genre :

Loop (avec variation de i)

Fonction Matlab (dans cette fonction se trouve le i )
Fonction Python
Fonction Python

end loop


Fonction matlab :

Code:

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fid = fopen('frrr.csv', 'wt');   fprintf(fid, 'Km_g3p_DXS, Km_pyr_DXS, Km_dxp_DXS\n'); fprintf(fid, '%f, ', ParamSets(i,1:end-1)); fprintf(fid, '%f', ParamSets(i,end));   fclose(fid);

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Mon problème est que je n'arrive pas à appeler une fonction Matlab sous Python (même avec l'aide de la doc...). Pouvez vous m'aider svp?

Merci ! :)

Je ne vois rien que matlab sait faire et que python ne sait pas faire. En l'occurrence tu écris dans un fichier à l'aide de texte formaté, rien de difficile à faire en python. Ta variable i apparaît comme par magie, elle vient d'où ?

Pourquoi pas tout en python ?

EDIT: Pour ta variable i c'est juste une boucle répétitive, toujours faisable en python.

Salut,

Citation:

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Envoyé par robinooo

Mon problème est que je n'arrive pas à appeler une fonction Matlab sous Python (même avec l'aide de la doc...).

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Appeler une fonction matlab depuis Python dépend de l'interface qu'il y a entre Python et Matlab. Hier votre interface était plutôt un fichier CSV, mais "appeler une fonction", c'est commencer par installer une bibliothèque qui permettra au programmeur Python d'appeler les fonctions de Matlab...

- W

Voir ici : MATLAB Engine API for Python

J'exécute un script sous Matlab qui me donne un tableau de valeurs (ParamSets). Le script que j'ai mis dans le message précédent me permet de créer un fichier csv à partir de ce tableau ( à la place du "i" je met un chiffre correspondant au numéro de ligne du tableau que je souhaite avoir dans mon fichier csv). Ensuite j'exécute 2 fonctions sur Python qui utilise ce fichier csv me permettant d'avoir mon résultat voulu.

Je peux donc tout faire à la main :

Exécution du script Matlab ( avec i=1) -> création du fichier csv -> exécution des scripts python utilisant ce fichier -> résultat 1
Exécution du script Matlab ( avec i=2) -> modification du fichier csv -> ... -> résultat 2
Exécution du script Matlab ( avec i=3) -> modification du fichier csv -> ... -> résultat 3

C'est donc assez long de faire ça ....


2) Oui j'ai déjà téléchargé la bibliothèque mais je n'ai aucune idée de comment procéder pour utiliser mon script sur Matlab...

3) Justement c'est cette doc là que j'ai lu , mais je ne trouve pas ce que souhaite faire.

Tu peux aussi utiliser des commandes systèmes.

Depuis Python :

Code:

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1 2 3

import os   os.system('matlab -r mon_script')

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En remplaçant mon_script par le nom du fichier .m (sans l'extension) contenant le code MATLAB.

Depuis MATLAB :

Code:

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system('python mon_script.py')

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Il faudra sans doute préfixer les commandes avec les chemins vers les exécutables respectifs.

Ces 2 lignes pourront donc me permettre d'utiliser une fonction Matlab avec Python ?

Et le code Matlab me donne une erreur ...

"Error: File: test.m Line: 12 Column: 11
Function with duplicate name "test" cannot be defined."

Montre nous le code MATLAB

Code:

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function test(ParamSets)   fid = fopen('frrr.csv', 'wt');   fprintf(fid, 'Km_g3p_DXS, Km_pyr_DXS, Km_dxp_DXS, Km_co2_DXS\n');   fprintf(fid, '%f, %f, %f, %f', ParamSets);   fclose(fid);   end;

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Je doute que ce soit le code correspondant au message d'erreur…

Montre nous tout le contenu du fichier test.m

Il y a juste la ligne de code en plus (celle qui génère l'erreur)

Code:

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system('python final.py') function test(ParamSets)   fid = fopen('frrr.csv', 'wt');   fprintf(fid, 'Km_g3p_DXS, Km_pyr_DXS, Km_dxp_DXS, Km_co2_DXS\n');   fprintf(fid, '%f, %f, %f, %f', ParamSets);   fclose(fid);   end

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Tu ne peux pas faire ceci avec MATLAB. Un script ne peut pas avoir le même nom qu'une fonction qu'il contient (dans les version récentes de MATLAB)

Dans le fichier test.m, il ne doit donc y avoir que la fonction test. Tu dois appeler le code Python et la fonction test dans un autre fichier .m

Donc dans test.m :

Code:

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function test(P)   fid = fopen('frrr.csv', 'wt');   fprintf(fid, 'Km_g3p_DXS, Km_pyr_DXS, Km_dxp_DXS, Km_co2_DXS\n');   fprintf(fid, '%f, %f, %f, %f', P);   fclose(fid);

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Dans un autre fichier .m :

Code:

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for i = ...   system('python final.py')   test(ParamSets(i,:))   end

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Au final je te conseille vivement de renommer la fonction test (et le fichier la contenant) avec un nom bien plus parlant (exportCsv pr exemple)

D'accord merci, je vais suivre vos conseils!

J'ai réalisé ce que vous avez fait mais j'ai ce message qui s'affiche :

'python' n'est pas reconnu en tant que commande interne  ou externe, un programme exécutable ou un fichier de commandes. 

(J'utilise anaconda 2.7)

Citation:

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Envoyé par Jerome Briot

Il faudra sans doute préfixer les commandes avec les chemins vers les exécutables respectifs.

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Dans mon cas avec Anaconda 3 :

Code:

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system('C:\Anaconda3\python final.py')

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Génial ! Tout fonctionne très bien, merci beaucoup !! :D

J'ai une dernière question, comment puis-je récupérer mes résultats dans un fichier txt? Je suppose que je dois utiliser "fid=fopen" :

Code:

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fid = fopen('resultat.txt', 'wt'); for i=1:10   createCSV(ParamSets(i,:)); system('C:\Users\Boulanger\Anaconda2\python final.py'); end;

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Mais dans ce cas je ne peux pas mettre de fprintf, du moins je ne pense pas, étant donné que les données en sortie de mon fichier final.py et donc ce que j'écris dans le fichier txt sont des caractères et des réels ( donc problème de format pour le fprintf) ...

Citation:

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Envoyé par robinooo

J'ai une dernière question, comment puis-je récupérer mes résultats dans un fichier txt?

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Ce sera plus simple en modifiant ton script Python : Input and Output - Reading and Writing Files

D'accord, merci !