Sélection d'une image individuelle en image J _macros en imageJ
Bonjour à tous,
je suis une étudiante en imagerie , et j'ai commencer récemment à utiliser imageJ. J’ai un petit souci et j’ai besoin de votre avis, en fait j’ai des fichiers(correspond à des différentes positions) qui contiennent des images individuelles telles que chaque image correspond à un Channel ( par exemple :
position 1 : img_Channel 000 (vert)
img_ Channel001 (bleus)
img_Channel 002 (visible) )
Je voulais sélectionner les images afin d’obtenir un fichier qui contient tous les images vertes et un autre que les images bleues, j’ai utilise le même script que vous m’avez transmis la fois dernière mais en modifiant quelque commande mais ça pas marcher et même par un message d’erreur apparaît juste je vois marque sur image j ‘ Angel tool ‘ , j'arrive pas toujours à savoir la commande par laquelle je peux sélectionner une image individuelle et non pas dans un stack . : le script est :
Code:
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
| m = 0
k=getNumber("number of the image to be selected", 2);
s = getString("Enter the file name:", s);
//Select folder containing stacks to process.
input = getDirectory("Choose substack Directory");
//Create output folder.
File.makeDirectory(input+ File.separator()+s);
output = input+ File.separator()+s;
Dialog.create("File type");
Dialog.addString("File suffix: ", ".tif", 5);
Dialog.show();
suffix = Dialog.getString();
setBatchMode(true);
list = getFileList(input);
for (i=0; i<list.length; i++)
{
if (endsWith(list[i], suffix))
{
m++;
open(input+list[i]);
selectImage(k);
processFile(output, list[i]);
close();
}
}
setBatchMode(false);
function processFile(output, file)
{
run("Duplicate...", " ");
saveAs("tiff", output+File.separator()+s+ list[i]);
close();
} |
Merci d'avance , Bonne journée
