Script Bash pour changer fichier par itération

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03/04/2017, 11h56
Newenda

Script Bash pour changer fichier par itération
Bonjour,

J'aimerais faire un script bash qui, en itérant :

- ouvre un fichier en csh
Code:

1 2 3 4 5 6 #!/bin/csh #output file set ps=energy.ps #time step to plot set ts=230 [...]
- change la valeur de ts de +10 (par exemple)

- lance le csh

- enregistre le plot qui en résulte (donc changer de nom de la figure avec l'incrément)

- et recommence autant de fois désiré.

Une idée pour me lancer?

Merci d'avance

j'ai déjà commencé avec
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 #!/bin/bash for ((i = 000; i <= 700; i += 50)) do echo $i sed -i 's/^set ts=.*/set ts=666/' filename grep '^set ts=' filename || { echo; echo 'set ts=666'; } >>filename done
mais je pense que je vais avoir du mal pour l'itération et l'enregistrement de la figure.

03/04/2017, 14h21
disedorgue

Bonjour,

Un peu barbare, la méthode ici, je te suggère de modifier ton script csh pour qu'il puisse prendre des paramètres au lieu de le modifier avant exécution.

Merci pour ta réponse mais je trouve encore moins d'aide en csh qu'en bash.

Rien que pour faire les entrées et la boucle j'ai du mal,

par exemple :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 #!/bin/csh echo "entree temps max en sec (<1000)" set max_iter = $< echo "entree le pas de temps en sec" set pas_iter = $< set iter=0 while ($iter<$max_iter) echo $iter set iter=`exp $iter + 1` end
il me ressort "0 illegal variable name.."

Attention: les nombres commençant par le chiffre '0' sont considérés comme étant écrits en octal, ce qui peut changer leur valeur (sauf pour le nombre '0'). Exemple:
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 $ for ((i = 000; i <= 0700; i += 050)); do echo $i; done 0 40 80 120 160 200 240 280 320 360 400 440
Il faut utiliser les guillemets (double quotes) pour pouvoir utiliser la valeur d'une variable:
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 #!/bin/bash filename="./filename" for ((i = 0; i <= 700; i += 50)) do echo $i sed -i "s/^set ps=.*/set ps=energy-$i.ps/; s/^set ts=.*/set ts=$i/" ${filename} # lancement de la commande? ${filename} done
Mais je plussoie la remarque de disedorgue: il vaudrait mieux passer $i en argument au script:
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 #!/bin/bash filename="./filename" for ((i = 0; i <= 700; i += 50)) do echo $i # lancement de la commande? ${filename} $i done
Code:

1 2 3 4 5 6 7 #!/bin/csh set i=$1 #output file set ps=energy-$i.ps #time step to plot set ts=$i [...]

Citation:

Envoyé par Newenda

Merci pour ta réponse mais je trouve encore moins d'aide en csh qu'en bash.

Ça ne m'étonne pas!

Es-tu certain de vouloir absolument le faire en csh?
Citation:
Rien que pour faire les entrées et la boucle j'ai du mal,

par exemple :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 #!/bin/csh echo "entree temps max en sec (<1000)" set max_iter = $< echo "entree le pas de temps en sec" set pas_iter = $< set iter=0 while ($iter<$max_iter) echo $iter set iter=`exp $iter + 1` end
il me ressort "0 illegal variable name.."
Bizarre...

Chez moi, les entrées et la boucle fonctionnent bien (après avoir changé "exp" en "expr" et "+ 1" en "+ $pas_iter")

03/04/2017, 15h50
disedorgue

C'est peut-être aussi l'occasion de changer le csh en un shell plus dans l'air du temps...

Que fait au juste ce script csh ?
Est-il si lourd à transformer en un shell de style sh, ksh, ou bash ?

Merci pour vos réponses,

Citation:

Envoyé par jack-ft

Chez moi, les entrées et la boucle fonctionnent bien (après avoir changé "exp" en "expr" et "+ 1" en "+ $pas_iter")

Effectivement ça marche, le message d'erreur ne m'a pas aidé

J'aimerais bien l'écrire en bash mais j'y connais pas grand chose comme vous avez pu le constater.

Le script va lire une série de fichier fieldt* et utiliser GMT pour faire une figure de propagation ondulatoire. Voici pour l'instant la version modifiée (modif pour la boucle en gras) :

Code:

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#!/bin/csh

echo "entree temps max en sec (<1000)"
set max_iter = $<
echo "entree le pas de temps en sec"
set pas_iter = $<
set iter=0

while ($iter<$max_iter)
echo $iter

#output file
set ps=energy.ps
#time step to plot
set ts=iter
#set energy amplitude:
set maxamp=5e-31
#image size (in cm)
set xsize=25
set ysize=5
#domain bounday (km)
set xmin=0
set xmax=100
set ymin=0
set ymax=20
#do you need to plot the mesh (0) or not (1)
set addmesh=0
#---------------------------------------------
gmtset PAPER_MEDIA = A4
set j="-JX${xsize}c/${ysize}c"
set R="-R${xmin}/${xmax}/${ymin}/${ymax}"
set list=`\ls fieldt000.*`
set info=`echo 0.0 0.1 0.1 1.`
set list=`\ls fieldt*.*"$ts"`
if (-e tmp.tmp) \rm tmp.tmp
foreach f($list)
awk '{print $1/1000.,$2/1000,$3/'$maxamp'}' $f>> tmp.tmp
end
surface tmp.tmp  -Gtmp.grd -I0.1/0.1 -T0.6  $R
gmtset D_FORMAT = "%.3g"
makecpt -Chot  -Z -I  -T$info[1]/$info[2]/$info[3] > cptf
set tt=`awk '{if (NR==4) printf("t=%3.1fs\n",$1*10*'$ts')}' input.spec `
gmtset LABEL_FONT_SIZE = 14p
gmtset ANOT_FONT_SIZE = 12p
grdimage tmp.grd -BEWSa10:"$tt"::,"km":/10:,"km":  $j -Y5c -X4c  $R -Ccptf -K > $ps
if ( $addmesh == 0 ) then
   awk '{if (NF==2) {print $1/1000,$2/1000}else{print $0}}' mesh.gnu > toto.gnu
   psxy  -W0.1p/155/155/155  $R $j  -m toto.gnu  -O -K >> $ps
endif
set fs=`awk '{if (NR==17) print $1}' input.spec`
awk '{if (NR>2) {print ($1+250)/1000,($2+250)/1000,10,0,0,2,NR-2}}' $fs > toto.gnu
pstext $R $j -G255/0/0   -O -K  toto.gnu >> $ps
awk '{if (NR>2) {print $1/1000,$2/1000}}' $fs > toto.gnu
psxy  $R $j   -Sd0.2  toto.gnu   -O -K >> $ps
awk '{if (NR==10) print $1/1000,$2/1000}' input.spec > toto.gnu
psxy  $R $j   -Sa0.3  toto.gnu   -O  >> $ps
gv $ps

set iter=`expr $iter + $pas_iter`
end

mais me sors toujours la même figure avec ce message d'erreur :

Code:

1
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0
ls: No match.
surface: cannot open input data file tmp.tmp

voyez vous l'erreur ou bien est ce facile de mettre en bash?

03/04/2017, 16h24
N_BaH

Bonjour,

Citation:

facile de mettre en bash?

oui.
il y a beaucoup d'assignations de variables, quelques tests, et des commandes externes qui ne devraient pas changer d'un shell à l'autre.
03/04/2017, 16h39
Newenda

Citation:

Envoyé par N_BaH

Bonjour,

oui.
il y a beaucoup d'assignations de variables, quelques tests, et des commandes externes qui ne devraient pas changer d'un shell à l'autre.

Merci mais j'ai l'impression d'y être presque et que la transformation en bash serait inutile surtout qu'à la base c'est pas mon code du tout.

J'ai rééditer mon code de mon dernier message, voyez vous l'erreur?

Merci d'avance
03/04/2017, 18h16
jack-ft
Citation:
Envoyé par Newenda

mais me sort toujours la même figure avec ce message d'erreur :

Code:

1 2 3 0 ls: No match. surface: cannot open input data file tmp.tmp

voyez vous l'erreur ou bien est ce facile de mettre en bash?
Hmmm...

Je plussoie la conversion en bash: tu auras BEAUCOUP plus d'aide qu'en csh!

Je t'invite à commencer la conversion en bash et, en cas de problème, tu postes tes difficultés ici et tu auras plein d'aide sur ce forum! :D

Sinon, le message ls: No match indique que "ls" n'a pas trouvé de fichiers correspondant au pattern fourni.

Ce message provient d'un appel à "ls" (t'as de la chance que N_BaH ne l'ait pas vu...) donc de la ligne 32 ou 34.

Pour en avoir le coeur net, il suffit de faire un "echo" pour voir à quel moment se produit l'erreur:
Code:

1 2 3 4 5 set list=`\ls fieldt000.*` echo "Ici, list contient '$list'" set info=`echo 0.0 0.1 0.1 1.` set list=`\ls fieldt*.*"$ts"` echo "et maintenant, list contient '$list'"
D'ailleurs, à quoi sert la première affectation de "list", puisqu'elle est écrasée juste après??? :koi:

De toute manière, il est préférable de supprimer l'appel à "ls" (ça va apaiser N_BaH) et modifier le "foreach":

Code:

foreach f(fieldt*.*$ts)

Ensuite, il est probable que "$list" ne contienne rien, ce qui expliquerait le message suivant surface: cannot open input data file tmp.tmp, car la boucle "foreach" serait alors exécutée 0 fois et n'alimenterait pas le fichier "tmp.tmp".

En fait, je viens de trouver une autre erreur qui explique probablement une partie des problèmes...

À la ligne 15, manifestement il manque des sous... Il faut ajouter un "$" devant "iter", de manière à ce que "ts" contienne une "bonne" valeur! ;)
04/04/2017, 10h21
Newenda

Citation:

Envoyé par jack-ft

En fait, je viens de trouver une autre erreur qui explique probablement une partie des problèmes...

À la ligne 15, manifestement il manque des sous... Il faut ajouter un "$" devant "iter", de manière à ce que "ts" contienne une "bonne" valeur! ;)

Merci, le problème était là..

J'aurais une dernière question: le nom de sortie est energy.ps

J'aimerais donner un nom différent pour chaque itération tel que "enerrgy$iter.ps" mais je ne vois pas comment définir un nouveau nom mélangeant les caractères et le variable $iter.

Merci d'avance.
04/04/2017, 10h36
jack-ft

Citation:

Envoyé par Newenda

J'aurais une dernière question: le nom de sortie est energy.ps

J'aimerais donner un nom différent pour chaque itération tel que "enerrgy$iter.ps" mais je ne vois pas comment définir un nouveau nom mélangeant les caractères et le variable $iter.

:koi:

J'ai déjà donné la réponse dans une réponse précédente (4ème code, ligne 4) ;)
04/04/2017, 10h52
Newenda

Citation:

Envoyé par jack-ft

:koi:

J'ai déjà donné la réponse dans une réponse précédente (4ème code, ligne 4) ;)

oups pardon effectivement. c'est ce que j'écrivais d'ailleurs, j'avais tout de même du l'avoir en tête.

Merci !