edge attribute used as weight in networkx eigenvector_centrality

J'ai créé un network à partir d'un fichier csv en utilisant :

Code:

---

1 2	adj_mat = np.loadtxt("outputsnet/output.csv",delimiter=',',skiprows=0) net = nx.from_numpy_matrix(adj_mat, create_using=nx.DiGraph())

---

Et quand je tape:

Code:

---

1 2	w=net.edges(data=True) print w

---

j'obtiens:

Code:

---

[(51, 92, {'weight': 589.0}), (51, 95, {'weight': 579.0}), (53, 82, {'weight': 644.0}), (56, 83, {'weight': 644.0}), (58, 93, {'weight': 589.0}), (59, 84, {'weight': 644.0}), (62, 96, {'weight': 579.0}), (64, 97, {'weight': 579.0}), (65, 89, {'weight': 599.0}), (65, 98, {'weight': 579.0}), (66, 99, {'weight': 579.0})]

---

Mon problème est que lorsque je veux calculer le eigenvector centrality du réseau en écrivant:

Code:

---

1 2	centrality = nx.eigenvector_centrality(net,weight='weight') print(['%s %0.2f'%(node,centrality[node]) for node in centrality])

---

j'obtiens tous les poids à 0:

Code:

---

['64 0.00', '65 0.00', '66 0.00', '99 0.00', '51 0.00', '97 0.00', '96 0.00', '98 0.00', '82 0.00', '83 0.00', '84 0.00', '53 0.00', '56 0.00', '89 0.00', '58 0.00', '59 0.00', '92 0.00', '93 0.00', '62 0.00', '95 0.00']

---

Je n'ai pas compris pourquoi les poids que j'ai passés ne sont pas considérés.

Quelqu'un pourrait-il m'aider la-dessus ?

Salut,

Citation:

---

Envoyé par marie_87

Je n'ai pas compris pourquoi les poids que j'ai passés ne sont pas considérés.

Quelqu'un pourrait-il m'aider la-dessus ?

---

Probablement parce qu'il y a peu ou pas de connections entre les différents nœuds.

- W

Bonjour wiztricks, Merci pour votre réponse.
C'est ce que je ne comprends pas, car quand je tape:

Code:

---

net.nodes()

---

j'obtiens la liste de tous mes noeuds

Code:

---

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

[51, 53, 56, 58, 59, 62, 64, 65, 66, 82, 83, 84, 89, 92, 93, 95, 96, 97, 98, 99]

---

et quand je veux afficher la liste des liens, ils sont bien là :

Code:

---

net.edges()

---

j'ai ceci:

Code:

---

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11

[(51, 92), (51, 95), (53, 82), (56, 83), (58, 93), (59, 84), (62, 96), (64, 97), (65, 89), (65, 98), (66, 99)]

---

Il y a détail qui serait peut être intéressant au départ, même si je pense qu'une fois le fichier chargé le réseau est c'est bon: Il s'agit de mon fichier, c'est un fichier contenant des 0 et des valeurs de poids aux indices i,j et donc à la ligne i et à la colonne j on a le poids comme contenu de la cellule. Mais comme je l'ai dit précédemment, j'arrive à avoir mon réseau :

Code:

---

[(51, 92, {'weight': 589.0}), (51, 95, {'weight': 579.0}), (53, 82, {'weight': 644.0}), (56, 83, {'weight': 644.0}), (58, 93, {'weight': 589.0}), (59, 84, {'weight': 644.0}), (62, 96, {'weight': 579.0}), (64, 97, {'weight': 579.0}), (65, 89, {'weight': 599.0}), (65, 98, {'weight': 579.0}), (66, 99, {'weight': 579.0})]

---

Salut,

J'avais vu que vous avez une liste de nœuds et de edges non vides. Ce que je vous dis c'est que vos noeuds sont loin d'être reliés entre eux: votre graphe est composé de nombreux graphes disjoints.... et pour parler de centralité d'un nœud, il faut quand même qu'il y ait des chemins/edges qui permettent d'y accéder.

- W

Ah oui c'est vrai, je n'avais pas remarqué ça.
Merci beaucoup pour votre aide :D