f2py pour fortran

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f2py pour fortran

Bonjour, je dois faire un programme (pour du calcul scientifique) et j'aimerais utiliser fortran et python.

j'essaye depuis hier d'installer f2py pour pouvoir utiliser du fortran dans mon programme python, mais je n'arrive pas à le faire marcher.

je suis sous windows 7 , j'ai installé mingw pour compiler les programmes fortran, j'ai installé python et numpy, (mes programmes avec python et numpy fonctionnent)
mais je n'arrive pas à faire fonctionner f2py, qui est pourtant supposé faire partie de numpy

j'ai suivi ce tutorial :
http://www.engr.ucsb.edu/~shell/che210d/f2py.pdf

ils me disent : pour compiler un module avec f2py, entrez une commande de la forme suivante :
f2py –c –m MODULENAME SOURCE.f90 --fcompiler=gnu95 --compiler=mingw32

donc j'ai testé ça, mais au lieu de compiler, ça m'affiche cette erreur :

Code:

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C:\Users\Camille\Desktop\Paul\stage\Programmes python> f2py -c -m hello.f90 --fc
ompiler=gnu95 --compiler=mingw32
running build
running config_cc
unifing config_cc, config, build_clib, build_ext, build commands --compiler opti
ons
running config_fc
unifing config_fc, config, build_clib, build_ext, build commands --fcompiler opt
ions
running build_src
build_src
building extension "hello.f90" sources
build_src: building npy-pkg config files
running build_ext
Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program Files\Python35-32\Scripts\f2py.py", line 28, in <module>
    main()
  File "c:\program files\python35-32\lib\site-packages\numpy\f2py\f2py2e.py", li
ne 648, in main
    run_compile()
  File "c:\program files\python35-32\lib\site-packages\numpy\f2py\f2py2e.py", li
ne 633, in run_compile
    setup(ext_modules=[ext])
  File "c:\program files\python35-32\lib\site-packages\numpy\distutils\core.py",
 line 169, in setup
    return old_setup(**new_attr)
  File "c:\program files\python35-32\lib\distutils\core.py", line 148, in setup
    dist.run_commands()
  File "c:\program files\python35-32\lib\distutils\dist.py", line 955, in run_co
mmands
    self.run_command(cmd)
  File "c:\program files\python35-32\lib\distutils\dist.py", line 974, in run_co
mmand
    cmd_obj.run()
  File "c:\program files\python35-32\lib\site-packages\numpy\distutils\command\b
uild.py", line 47, in run
    old_build.run(self)
  File "c:\program files\python35-32\lib\distutils\command\build.py", line 135,
in run
    self.run_command(cmd_name)
  File "c:\program files\python35-32\lib\distutils\cmd.py", line 313, in run_com
mand
    self.distribution.run_command(command)
  File "c:\program files\python35-32\lib\distutils\dist.py", line 974, in run_co
mmand
    cmd_obj.run()
  File "c:\program files\python35-32\lib\site-packages\numpy\distutils\command\b
uild_ext.py", line 117, in run
    force=self.force)
  File "c:\program files\python35-32\lib\site-packages\numpy\distutils\ccompiler
.py", line 596, in new_compiler
    compiler = klass(None, dry_run, force)
  File "c:\program files\python35-32\lib\site-packages\numpy\distutils\mingw32cc
ompiler.py", line 58, in __init__
    dry_run, force)
  File "c:\program files\python35-32\lib\distutils\cygwinccompiler.py", line 157
, in __init__
    self.dll_libraries = get_msvcr()
  File "c:\program files\python35-32\lib\distutils\cygwinccompiler.py", line 86,
 in get_msvcr
    raise ValueError("Unknown MS Compiler version %s " % msc_ver)
ValueError: Unknown MS Compiler version 1900
 
C:\Users\Camille\Desktop\Paul\stage\Programmes python>

quelqu'un pourrait m'aider à déchiffrer ça ?

17/05/2016, 16h37
wiztricks

Citation:

Envoyé par isaz24

quelqu'un pourrait m'aider à déchiffrer ça ?

Lorsque vous avez ce genre de problème, le plus simple est de lancer une recherche avec votre moteur favori sur "ValueError: Unknown MS Compiler version 1900". Il faut lire les différentes entrées, voir si elles s'appliquent à votre cas, appliquer la solution s'il y en a.
Seuls pourraient vous aider ceux qui ayant suivi le même chemin que vous ont déjà trié et testé.

- W
17/05/2016, 18h53
tyrtamos
Bonjour,

Juste une idée.

Bizarrement, tu as demandé le compilateur mingw dans la ligne de commande, mais il échoue parce qu'il ne trouve pas le compilateur de Microsoft...

Il est possible que la nature du code en question nécessite impérativement le compilateur de Microsoft, auquel cas, il est possible de l'installer: Visual Studio (la version gratuite suffit).

Mais il est possible aussi qu'il soit nécessaire de préciser le choix du compilateur à un autre endroit que la ligne de commande. Ça m'est déjà arrivé avec Cython: comme j'ai les 2 compilateurs, la compilation appelle par défaut le compilateur de Microsoft. Si je veux mingw, je le précise dans un petit fichier texte appelé "setup.cfg" et contenant:
Code:

1 2 [build] compiler = mingw32
Pour le compilateur de Microsoft, il suffit de mettre "msvc" à la place.

Regarde dans ta doc si il n'y a pas une astuce de ce genre.
18/05/2016, 22h24
isaz24

Citation:

Envoyé par wiztricks

Lorsque vous avez ce genre de problème, le plus simple est de lancer une recherche avec votre moteur favori sur "ValueError: Unknown MS Compiler version 1900". Il faut lire les différentes entrées, voir si elles s'appliquent à votre cas, appliquer la solution s'il y en a.
Seuls pourraient vous aider ceux qui ayant suivi le même chemin que vous ont déjà trié et testé.

- W

c'est la première chose que j'ai faite, mais je n'ai pas trouvé de résultat correspondant vraiment à ma situation.

Citation:

Il est possible que la nature du code en question nécessite impérativement le compilateur de Microsoft, auquel cas, il est possible de l'installer: Visual Studio (la version gratuite suffit).

j'ai essayé de le télécharger, mais après plusieurs heures d'installation , le programme d'installation m'a annoncé que l'installation avait échoué.
19/05/2016, 07h43
tyrtamos

Bonjour,

J'ai un peu regardé f2py (qui est effectivement dans numpy), et il y a beaucoup de subtilités et peu de doc à jour. Bref, en 1 heure et en utilisant les infos disponibles j'arrive à compiler sans erreur, mais pas à importer... Apparemment, même si on compile avec mingw32, on a besoin de la dll de Windows, probablement pour assurer la connexion avec Python, mais il faut la bonne: celle du Visual Studio utilisé pour compiler Python (msvcr100.dll pour Python 3.4?) et la bonne version 32 ou 64bits. Bref, j'arrête: c'est beaucoup trop compliqué (pour moi en tout cas ;)).

Ton objectif est-il d'utiliser fortran, ou de faire seulement des morceaux de code plus rapide?

Si c'est le 2ème objectif:

- tu devrais plutôt utiliser Cython: c'est plus proche de Python qui est écrit en C et ça marche très bien: le code Python est un peu modifié (ex: déclaration des variables) puis est converti en C (ou en C++) et compilé. J'ai fait un petit tuto sur le sujet: http://python.jpvweb.com/mesrecettes...ple_cython_cpp.

- certains calculs sont très accélérés en utilisant simplement des modules spécialisés pour le calcul comme gmpy2 ou mpmath (les 2 sont facilement installés avec pip). Dans un de mes programmes utilisant des entiers longs, j'ai ainsi divisé par 15 le temps d'exécution en utilisant seulement gmpy2.
19/05/2016, 11h48
wiztricks

Citation:

Envoyé par isaz24

c'est la première chose que j'ai faite, mais je n'ai pas trouvé de résultat correspondant vraiment à ma situation.

Bizarre! La première entrée que me retourne Google décrit un problème fort similaire.

- W