Récupérer information dans fichier .txt

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22/01/2016, 11h44
NeuroL

Récupérer information dans fichier .txt

Bonjour,

Je suis en train de créer un batch (première fois pour moi), qui me permet d'exécuter un programme de traitement d'imagerie médicale, pour plusieurs patients consécutifs, et je rencontre un problème pour une étape.

J'ai besoin de faire tourner mon programme pour plusieurs patients à la suite, afin de ne pas relancer la commande pour le patient suivant, quand le patient précédent est terminé.
J'ai un dossier source, dans lequel j'ai plusieurs sous-dossiers (un dossier pour chaque patient, contenant son image respective à traiter).
J'ai créé un fichier texte, dans lequel j'ai fait la liste de tous les noms des dossiers des patients.

Mon problème n°1 : j'aurai besoin d'une ligne dans mon Batch, qui dit au programme d'aller chercher dans ce fichier texte, le nom du dossier dans lequel il doit chercher l'image à traiter.

Mon problème n°2 : comment indiquer au programme que quand il a fini le traitement d'un patient, d'aller rechercher dans cette liste.txt le patient suivant à traiter ?

Merci d'avance !

NeuroL

Bonjour,
Peut-être que ceci pourrait vous aider:

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
 
@echo off&cls
 
for /f "delims=" %%a in (patients.txt) do (
	REM Ici on entre toutes les commandes/actions relatives a tout les clients de la liste
	echo Patient en cours de traitement %%a
)
REM Une fois chaque entrees (clients) du fichier texte traités, on me en pause le script.
pause
exit

22/01/2016, 13h43
NeuroL

Merci pour cette réponse ! Je vais regarder ça, j'espère y comprendre quelque chose, je suis vraiment novice en la matière.. ^^

(j'ai oublié de préciser que je suis sous Linux pour un logiciel particulier, et il me semble que ce n'est pas exactement le même langage que sous Windows, j'ai entendu parlé de Shell.. est-ce que cela change quelque chose par rapoprt à l'aide que vous m'avez suggéré ?!)

Merci encore beaucoup !

NeuroL
22/01/2016, 15h36
Invité

Cela change tout en effet, il faudra un script Shell (.sh) ou un autre langage qui n'est pas comme le Batch de Windows.
Pouvez-vous me dire si votre logiciel Linux est exécuté via une machine virtuelle (vous l'ouvrez depuis Windows) ou si vous devez redémarrer l'ordinateur pour démarrer sous linux ou changer d'ordinateur?
Merci de m'indiquer toutes les informations utiles concernant le cas du logiciel Linux.
24/01/2016, 00h15
Invité

Citation:

Envoyé par NeuroL

J'ai besoin de faire tourner mon programme pour plusieurs patients à la suite, afin de ne pas relancer la commande pour le patient suivant, quand le patient précédent est terminé.
J'ai un dossier source, dans lequel j'ai plusieurs sous-dossiers (un dossier pour chaque patient, contenant son image respective à traiter).
J'ai créé un fichier texte, dans lequel j'ai fait la liste de tous les noms des dossiers des patients.

Mon problème n°1 : j'aurai besoin d'une ligne dans mon Batch, qui dit au programme d'aller chercher dans ce fichier texte, le nom du dossier dans lequel il doit chercher l'image à traiter.

Mon problème n°2 : comment indiquer au programme que quand il a fini le traitement d'un patient, d'aller rechercher dans cette liste.txt le patient suivant à traiter ?

Bonjour,

vous pouvez tout brûler, on va recommencer proprement. on va faire ça en shell (sh ou bash, selon les capacités de votre système, ou l'énoncé de votre execrice)
en commençant par mettre un peu d'ordre dans tout ça :

Citation:

Envoyé par NeuroL

J'ai un dossier source, dans lequel j'ai plusieurs sous-dossiers (un dossier pour chaque patient, contenant son image respective à traiter).

il faut donc parcourir l'arborescence du dossier source. Cela se fait avec une boucle for et le Développement de chemins (cf. man bash)
y a-t-il d'autres fichiers dans le dossier personnel d'un patient ?
le nom fichier image a-t-il un format qui permet de le reconnaître ?

en attendant, profitez-en pour lire les tutos qui figurent dans ma signature.
24/01/2016, 01h13
Flodelarab
Bonjour :coucou:

Comme la liste des dossiers à traiter a déjà été dressée, il est sans doute préférable d'alimenter une boucle while avec le contenu du fichier-liste.

Exemple:
Code:

1 2 3 4 while read dossier do ls "$dossier" done <fichier_liste.txt
24/01/2016, 01h28
Invité

on peut aussi montrer tout de suite les bonnes habitudes à notre amie néophyte, en ne lui faisant pas utiliser des fichiers temporaires inutiles et néfastes aux déjà pauvres performance de shell!
surtout si derrière c'est pour à nouveau parcourir l'arborescence.
AVEC ls ??? :massacre: :dehors: et je vous attends ! :kill:
24/01/2016, 11h46
disedorgue
Bonjour,

Citation:

Envoyé par NeuroL

Mon problème n°1 : j'aurai besoin d'une ligne dans mon Batch, qui dit au programme d'aller chercher dans ce fichier texte, le nom du dossier dans lequel il doit chercher l'image à traiter.

La commande en shell qui lit une ligne sur l'entrée standard est read:
(le $ en début de ligne est mon prompt).
Code:

1 2 3 4 $ read ligne ceci est une ligne saisie sur l entrée standart $ echo $ligne ceci est une ligne saisie sur l entrée standart
un fichier peut être redirigé vers l'entrée standart via le chevron '<' :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 $ cat fichier.txt ligne 1 a traiter ligne 2 a traiter ligne 3 a traiter $ read ligne <fichier.txt $ echo $ligne ligne 1 a traiter
Donc pour l'instant, on ne sait lire que la première ligne d'un fichier via read qui rend la main par défaut, lorsque'il rencontre un retour chariot.
Ce qui nous amène à ta 2éme question:

Citation:

Envoyé par NeuroL

Mon problème n°2 : comment indiquer au programme que quand il a fini le traitement d'un patient, d'aller rechercher dans cette liste.txt le patient suivant à traiter ?

Ici, il suffit de créer une boucle, qui lit ligne à ligne ton fichier et execute les actions en conséquences. On peut,comme le suggère Flodelarab, utiliser une boucle while couplé à la commande read et en redirigeant le fichier sur l'entrée standart mais non pas sur le read lui-même mais sur le bloc complet de la boucle:
Code:

1 2 3 4 5 6 7 $ while read ligne do echo "$ligne" done <fichier.txt ligne 1 a traiter ligne 2 a traiter ligne 3 a traiter
Après, il y a d'autres possibilités via une boucle for comme le suggère N_BaH, mais pour cela, il faudrait avoir plus d'informations sur les commandes de traitements à exécuter et le modèle de ton arborescence.