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24/01/2016, 13h23
nina2007

ça ne marche pas :( Je ne sais pas quelle commande pose problème
je t'envoie la sortie de chaque commande

curl -k -o /opt/ez_setup.py https://bootstrap.pypa.io/ez_setup.py
% Total % Received % Xferd Average Speed Time Time Time Current
Dload Upload Total Spent Left Speed
100 12059 100 12059 0 0 27092 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 436k

[root@localhost opt]# cat ez_setup.py | /usr/local/bin/python
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 415, in <module>
File "<stdin>", line 411, in main
File "<stdin>", line 327, in download_setuptools
File "<stdin>", line 347, in _resolve_version
File "/usr/local/lib/python2.7/urllib2.py", line 154, in urlopen
return opener.open(url, data, timeout)
File "/usr/local/lib/python2.7/urllib2.py", line 431, in open
response = self._open(req, data)
File "/usr/local/lib/python2.7/urllib2.py", line 449, in _open
'_open', req)
File "/usr/local/lib/python2.7/urllib2.py", line 409, in _call_chain
result = func(*args)
File "/usr/local/lib/python2.7/urllib2.py", line 1240, in https_open
context=self._context)
File "/usr/local/lib/python2.7/urllib2.py", line 1197, in do_open
raise URLError(err)
urllib2.URLError: <urlopen error [SSL: CERTIFICATE_VERIFY_FAILED] certificate verify failed (_ssl.c:590)>

[root@localhost opt]# pip install scikit-learn
Collecting scikit-learn
Using cached scikit-learn-0.17.tar.gz
Could not import setuptools which is required to install from a source distribution.
Please install setuptools.
24/01/2016, 16h47
BenjGe

le problème ici est le même depuis plusieurs posts, ta machine a des probèmes ssl qui empêchent diverses choses. Ici le script d'installation de setuptools demande ssl,

Avant c'etait le script get-pip.py qui rencontrait des problèmes ssl, et encore avant c'est la commande curl qui plantait toujours à cause de ssl. Si on veut aller plus loin, il faut identifier la source de ce problème et le régler.

On a déjà pas mal avancé, puisqu'on a résolu ton problème yum, et qu'on dispose d'un python dans une version qui supporte scikit-learn.

Peux tu renvoyer la sortie de ceci:

Code:

openssl s_client -servername www.libwalk.so -connect www.libwalk.so:443
25/01/2016, 18h38
nina2007

voilà la sortie

[root@localhost ~]# openssl s_client -servername www.libwalk.so -connect www.libwalk.so:443
unknown option -servername
usage: s_client args

-host host - use -connect instead
-port port - use -connect instead
-connect host:port - who to connect to (default is localhost:4433)
-verify depth - turn on peer certificate verification
-cert arg - certificate file to use, PEM format assumed
-certform arg - certificate format (PEM or DER) PEM default
-key arg - Private key file to use, in cert file if
not specified but cert file is.
-keyform arg - key format (PEM or DER) PEM default
-pass arg - private key file pass phrase source
-CApath arg - PEM format directory of CA's
-CAfile arg - PEM format file of CA's
-reconnect - Drop and re-make the connection with the same Session-ID
-pause - sleep(1) after each read(2) and write(2) system call
-showcerts - show all certificates in the chain
-debug - extra output
-msg - Show protocol messages
-nbio_test - more ssl protocol testing
-state - print the 'ssl' states
-nbio - Run with non-blocking IO
-crlf - convert LF from terminal into CRLF
-quiet - no s_client output
-ign_eof - ignore input eof (default when -quiet)
-ssl2 - just use SSLv2
-ssl3 - just use SSLv3
-tls1 - just use TLSv1
-dtls1 - just use DTLSv1
-mtu - set the MTU
-no_tls1/-no_ssl3/-no_ssl2 - turn off that protocol
-bugs - Switch on all SSL implementation bug workarounds
-serverpref - Use server's cipher preferences (only SSLv2)
-cipher - preferred cipher to use, use the 'openssl ciphers'
command to see what is available
-starttls prot - use the STARTTLS command before starting TLS
for those protocols that support it, where
'prot' defines which one to assume. Currently,
only "smtp" and "pop3" are supported.
-engine id - Initialise and use the specified engine
-rand file:file:...
25/01/2016, 18h44
BenjGe
problème de version. Donc la bonne commande:
Code:

1 2 openssl s_client -debug -connect www.libwalk.so:443

bon sinon on laisse tomber la résolution du problème ssl et on installe le module à la main. J'ai regardé le setup du module, il est facile et il y a peu de dépendances:

Installation de Numpy

Code:

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cd /usr/local/src
curl -L -k -o numpy.tar.gz http://downloads.sourceforge.net/project/numpy/NumPy/1.10.4/numpy-1.10.4.tar.gz?r=&ts=1453764351&use_mirror=netassist
tar -xzf  numpy.tar.gz
cd numpy-1.10.4/
/usr/local/bin/python2.7 setup.py build install --prefix /usr/local/

Installation de SciPy

Code:

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cd /usr/local/src
curl -L -k -o scipy.tar.gz http://downloads.sourceforge.net/project/scipy/scipy/0.16.1/scipy-0.16.1.tar.gz?r=http%3A%2F%2Fsourceforge.net%2Fprojects%2Fscipy%2Ffiles%2Fscipy%2F0.16.1%2F&ts=1453763764&use_mirror=netcologne
tar -xzf scipy.tar.gz
cd scipy-0.16.1/
/usr/local/bin/python2.7  setup.py install --prefix /usr/local/

Installation de scikit-learn

Code:

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cd /usr/local/src
curl -k -o scikit-learn.tar.gz https://pypi.python.org/packages/source/s/scikit-learn/scikit-learn-0.17.tar.gz#md5=4b5cebc8c92cfe33749ae8ab3b2149b7
tar -xzf scikit-learn.tar.gz
cd scikit-learn-0.17/
/usr/local/bin/python2.7  setup.py install --prefix /usr/local/

Il manquera la dépendance vers matplotlib, mais elle ne sert qu'à exécuter les exemples suivant la doc.

26/01/2016, 12h39
nina2007

1 pièce(s) jointe(s)

Bonjour,

Je pense que l'installation de Numpy s'est bien déroulée. Par contre ce n'est pas le cas pour Scipy.
Je t'envoir la sortie de la commande /usr/local/bin/python2.7 setup.py install --prefix /usr/local/ en pièce jointe.

Pièce jointe 199109

ok

je viens de créer ce script et de le tester sur une machine vierge. Ca semble fonctionner (il recommence les compilations de 0)

Code:

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#nettoyage
rm -rf /usr/local/*
mkdir /usr/local/src
cd /usr/local/src/
yum install -y zlib-devel lapack-devel blas-devel
 
 
#installation de python
cd /usr/local/src
curl -k -o Python-2.7.10.tgz https://www.python.org/ftp/python/2.7.10/Python-2.7.10.tgz
tar -xzf Python-2.7.10.tgz
cd Python-2.7.10
./configure
make
make install
 
#installation de pip
cd /usr/local/src
curl -k -o get-pip.py https://bootstrap.pypa.io/get-pip.py
/usr/local/bin/python2.7 get-pip.py --no-setuptools --no-wheel
 
#installation de numpy
cd /usr/local/src
curl -L -k -o numpy.tar.gz http://downloads.sourceforge.net/project/numpy/NumPy/1.10.4/numpy-1.10.4.tar.gz?r=&ts=1453764351&use_mirror=netassist
tar -xzf  numpy.tar.gz
cd numpy-1.10.4/
/usr/local/bin/python2.7 setup.py build install --prefix /usr/local/
 
#installation de scipy
cd /usr/local/src
curl -L -k -o scipy.tar.gz http://downloads.sourceforge.net/project/scipy/scipy/0.16.1/scipy-0.16.1.tar.gz?r=http%3A%2F%2Fsourceforge.net%2Fprojects%2Fscipy%2Ffiles%2Fscipy%2F0.16.1%2F&ts=1453763764&use_mirror=netcologne
tar -xzf scipy.tar.gz
cd scipy-0.16.1/
/usr/local/bin/python2.7  setup.py install --prefix /usr/local/
 
#installation de setuptools
cd /usr/local/src
curl -k -o setuptools.tar.gz https://pypi.python.org/packages/source/s/setuptools/setuptools-19.6.tar.gz#md5=c607dd118eae682c44ed146367a17e26
tar -xzf setuptools.tar.gz
cd setuptools-19.6/
/usr/local/bin/python2.7 setup.py install --prefix=/usr/local/
 
 
 
 
#installation de scikit-learn
cd /usr/local/src
curl -k -o scikit-learn.tar.gz https://pypi.python.org/packages/source/s/scikit-learn/scikit-learn-0.17.tar.gz#md5=4b5cebc8c92cfe33749ae8ab3b2149b7
tar -xzf scikit-learn.tar.gz
cd scikit-learn-0.17/
/usr/local/bin/python2.7 setup.py build
/usr/local/bin/python2.7 setup.py install --prefix /usr/local/

27/01/2016, 10h50
nina2007

Bonne nouvelle. Normalement c'est bon :) tu es mon Héros et je n'ai pas de mots pour te remercier pour ta patience et ta générosité.
Merci encore

dernière petite question: si je veux installer la bibliothèque matplolib comment je fais pour retrouver le package et faire la même chose?
Bonne journée

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