[Python 2.x]Numpy problème de dimension d'array

Bonjour,

Je suis en train d'écrire un petit logiciel pour le traitement statistique via Scipy. Le problème est que l'appel de la fonction mstats.kruskalwallis() existe d'avoir un array en 2D. Dans notre cas, la variable passée en paramètre est une liste 2D (des listes dans une liste) mais pour autant il affiche toujours l'erreur...

Voici la liste passée en paramètre :

Code:

1
2
3
4
5
 
 
>>>> print donnees
 
[[117189.0, 29369.0, 62604.0, 142599.0, 169443.0, 30013.0, 186207.0, 212904.0, 11229.0, 29306.0, 64776.0, 87964.0, 115216.0, 165532.0, 11039.0, 17112.0, 65011.0, 57625.0, 25967.0, 46066.0, 82934.0, 14980.0, 86649.0, 97598.0, 15425.0, 98019.0, 56034.0, 188247.0, 25020.0, 10955.0, 193668.0, 63669.0, 140036.0, 61202.0, 35903.0, 95116.0, 15815.0, 78427.0, 21124.0, 193217.0, 164180.0, 211225.0, 117418.0, 40789.0, 127880.0, 83584.0, 93548.0, 39622.0, 37578.0, 32384.0, 51828.0, 64341.0, 66869.0, 195895.0, 28816.0, 23445.0, 46287.0, 22875.0, 20359.0, 80985.0, 159065.0, 23796.0, 84265.0, 30139.0, 21269.0, 81010.0, 81118.0, 195158.0, 15850.0, 16323.0, 16470.0, 22469.0, 66247.0, 18794.0, 78658.0, 94007.0, 13080.0, 22798.0, 74296.0, 46955.0, 41575.0, 27318.0, 20668.0, 54553.0, 160888.0, 19904.0, 29814.0, 24069.0, 22057.0, 88384.0, 27174.0, 150903.0, 26322.0, 64654.0, 41984.0, 104154.0, 49508.0, 190547.0, 25992.0, 144080.0, 33689.0, 33066.0, 36854.0, 48431.0, 47269.0, 37093.0, 26685.0, 32060.0], [25499.0, 29327.0, 107747.0, 28228.0, 48439.0, 17866.0, 20468.0, 45520.0, 27276.0, 40228.0, 145194.0, 23060.0, 120374.0, 31902.0, 42879.0, 100706.0, 76030.0, 45246.0, 57840.0, 78163.0, 33416.0, 190205.0, 73678.0, 27569.0, 45618.0, 13699.0, 187231.0, 92028.0, 37764.0, 33873.0, 43968.0, 19799.0, 137291.0, 69422.0, 23405.0, 42254.0, 48373.0, 22291.0, 190870.0, 58081.0, 17959.0, 121269.0, 38542.0, 30295.0, 60332.0, 26717.0, 19726.0, 44510.0, 200748.0, 17350.0, 61431.0, 22766.0, 102337.0, 14615.0, 41860.0, 94334.0, 70319.0, 32398.0, 57294.0, 26623.0, 19633.0, 18353.0, 19915.0, 36465.0, 96523.0, 22646.0, 55409.0, 33323.0, 30248.0, 20497.0, 86197.0, 45806.0, 114518.0, 44562.0, 34291.0, 19754.0, 154805.0, 38592.0, 20833.0, 122056.0, 35138.0, 181005.0, 116780.0, 207961.0, 35936.0, 186858.0, 30214.0, 33040.0, 25213.0, 42066.0, 17258.0, 26974.0, 58788.0, 32553.0, 35231.0, 38340.0, 196065.0, 28087.0, 51977.0, 183487.0, 44816.0, 20189.0, 28386.0, 49439.0, 35251.0, 20660.0, 23944.0, 32558.0], [145595.0, 199888.0, 198222.0, 98488.0, 115495.0, 231416.0, 66701.0, 192013.0, 24250.0, 58317.0, 37909.0, 58102.0, 114055.0, 181157.0, 20836.0, 15348.0, 15187.0, 17242.0, 19197.0, 46819.0, 181003.0, 185906.0, 190253.0, 181000.0, 181036.0, 86886.0, 48586.0, 193213.0, 102495.0, 114521.0, 194705.0, 62454.0, 27515.0, 17793.0, 14946.0, 19235.0, 56967.0, 199891.0, 31289.0, 59819.0, 223939.0, 150105.0, 36426.0, 85331.0, 93377.0, 195390.0, 28209.0, 39379.0, 206247.0, 129414.0, 46851.0, 43978.0, 71679.0, 200547.0, 105447.0, 83680.0, 207172.0, 54883.0, 187605.0, 216743.0, 13999.0, 42243.0, 195648.0, 186565.0, 132065.0, 191609.0, 33952.0, 203946.0, 60253.0, 52925.0, 88788.0, 188984.0, 29809.0, 127778.0, 209595.0, 110450.0, 19823.0, 33016.0, 160277.0, 186029.0, 31416.0, 72052.0, 19025.0, 206626.0, 47895.0, 156843.0, 14432.0, 186381.0, 27742.0, 30758.0, 85505.0, 75094.0, 184917.0, 71587.0, 35141.0, 28164.0, 222124.0, 109726.0, 189743.0, 81163.0, 147647.0, 186523.0, 69492.0, 186442.0, 187625.0, 122804.0], [211702.0, 158666.0, 99301.0, 29042.0, 36131.0, 203730.0, 28089.0, 84449.0, 228425.0, 30449.0, 181287.0, 98305.0, 62906.0, 114433.0, 24766.0, 219809.0, 187691.0, 231131.0, 62812.0, 28290.0, 80418.0, 192615.0, 229500.0, 19631.0, 64234.0, 34278.0, 253564.0, 49083.0, 208058.0, 189040.0, 25048.0, 23996.0, 71936.0, 16937.0, 22352.0, 27636.0, 22664.0, 108148.0, 29994.0, 20926.0, 28688.0, 36138.0, 121492.0, 31902.0, 49083.0, 91257.0, 79776.0, 198715.0, 50117.0, 24786.0, 198187.0, 36700.0, 75262.0, 17932.0, 73930.0, 30693.0, 122951.0, 18520.0, 53949.0, 60632.0, 50312.0, 181010.0, 111306.0, 87097.0, 33767.0, 191237.0, 181013.0, 42412.0, 92037.0, 181002.0, 32528.0, 99854.0, 48889.0, 144869.0, 52392.0, 41531.0, 204998.0, 193284.0, 196875.0, 67292.0, 68501.0, 161121.0, 193393.0, 211684.0, 187756.0, 11670.0, 139033.0, 19539.0, 16694.0, 14550.0, 199586.0, 33825.0, 64820.0, 32269.0, 49996.0, 194196.0, 22065.0, 26081.0, 51434.0, 235740.0, 56941.0, 206276.0, 59320.0, 21213.0, 68174.0, 217665.0, 115005.0, 17741.0], [41145.0, 23961.0, 34674.0, 24992.0, 112296.0, 176503.0, 46397.0, 50674.0, 106408.0, 118273.0, 35064.0, 22291.0, 80214.0, 90527.0, 89547.0, 54968.0, 29065.0, 25368.0, 185371.0, 71367.0, 41031.0, 181110.0, 89312.0, 32419.0, 25141.0, 48104.0, 94724.0], [64417.0, 29798.0, 40770.0, 96408.0, 45352.0, 181111.0, 181115.0, 79093.0, 27909.0, 66298.0, 55142.0, 37658.0, 53207.0, 181451.0, 50987.0, 129145.0, 192361.0, 119636.0, 170074.0, 49697.0, 56097.0, 181106.0, 90502.0, 109699.0, 34383.0, 26477.0], [181024.0, 89071.0, 10666.0, 35020.0, 27850.0, 46000.0, 25875.0, 18956.0, 17029.0, 15935.0, 69520.0, 16893.0, 63598.0, 22222.0, 56630.0, 21644.0, 40699.0, 18756.0, 13234.0, 14537.0, 9690.0, 58352.0, 8495.0, 187362.0, 18512.0, 8288.0, 81456.0, 65604.0, 30211.0, 184403.0, 27209.0, 121309.0, 106996.0, 18900.0, 56620.0, 41342.0, 13544.0, 87595.0, 43012.0, 12485.0, 58476.0, 191457.0, 87822.0, 153753.0, 36001.0, 55768.0, 51146.0, 24659.0, 37867.0, 50888.0, 190785.0, 34064.0, 43645.0, 74800.0, 10191.0, 25920.0, 128080.0, 110842.0, 90520.0, 27979.0, 20859.0, 201179.0, 42798.0, 43118.0, 22515.0, 61549.0, 82158.0, 36083.0, 191004.0, 130758.0, 70293.0, 138294.0, 11161.0, 40167.0, 46049.0, 192360.0, 5718.0, 50099.0, 32767.0, 9341.0, 38142.0, 52816.0, 7067.0, 55707.0, 48525.0, 56223.0, 18876.0, 183967.0, 46686.0, 9680.0, 96326.0, 101475.0, 192430.0, 67305.0, 68435.0, 21812.0, 184916.0, 40033.0, 20878.0, 63005.0, 22676.0, 13818.0, 28206.0, 16649.0, 53690.0, 191167.0, 31670.0, 191126.0], [42885.0, 25315.0, 181130.0, 67940.0, 27197.0, 18000.0, 58530.0, 40894.0, 30924.0, 74343.0, 181132.0, 81413.0, 23835.0, 27426.0, 181109.0, 39848.0, 29985.0, 32685.0, 73129.0, 92637.0, 23544.0, 172711.0, 78524.0, 181108.0, 181116.0, 31147.0, 149221.0], [44435.0, 197403.0, 10041.0, 91701.0, 183492.0, 27400.0, 20193.0, 30016.0, 22602.0, 192971.0, 69959.0, 27406.0, 59793.0, 54731.0, 160116.0, 15717.0, 15555.0, 16668.0, 194932.0, 58358.0, 57698.0, 28264.0, 35242.0, 9514.0, 25713.0, 11170.0, 10604.0, 13653.0, 14256.0, 14199.0, 201146.0, 16787.0, 118811.0, 10102.0, 18974.0, 9008.0, 152038.0, 41166.0, 106853.0, 16972.0, 36199.0, 212031.0, 22785.0, 8233.0, 18557.0, 96399.0, 181019.0, 79795.0, 17295.0, 23499.0, 181053.0, 12543.0, 36041.0, 25440.0, 128118.0, 133069.0, 126337.0, 53215.0, 199800.0, 35894.0, 39367.0, 16082.0, 123219.0, 187070.0, 107509.0, 32586.0, 92902.0, 125137.0, 191144.0, 31992.0, 17724.0, 60631.0, 91472.0, 158927.0, 24901.0, 26767.0, 84780.0, 201469.0, 95770.0, 102722.0, 188034.0, 55866.0, 60761.0, 83651.0, 74193.0, 22562.0, 17222.0, 23299.0, 11430.0, 16566.0, 76705.0, 12623.0, 183202.0, 42063.0, 6501.0, 183614.0, 13897.0, 183882.0, 194934.0, 13096.0, 57043.0, 65236.0, 70485.0, 89063.0, 13368.0, 15355.0], [77345.0, 63892.0, 111494.0, 181107.0, 17634.0, 29799.0, 18566.0, 15908.0, 147809.0, 40804.0, 141145.0, 19702.0, 27707.0, 181155.0, 26692.0, 27744.0, 18143.0, 45287.0, 24906.0, 119676.0, 49846.0, 76397.0, 33577.0, 42361.0, 140541.0, 186302.0, 93300.0], [70988.0, 187592.0, 128078.0, 202292.0, 189674.0, 192648.0, 184662.0, 35351.0, 181141.0, 184543.0, 29996.0, 47322.0, 150885.0, 190500.0, 81048.0, 105935.0, 185899.0, 187134.0, 43272.0, 43510.0, 180872.0, 24294.0, 104629.0, 20006.0, 24996.0, 115165.0, 26233.0, 44529.0, 41141.0, 22326.0, 48572.0, 41106.0, 25878.0, 47857.0, 31807.0, 142853.0, 62967.0, 52820.0, 104014.0, 30835.0, 19345.0, 84762.0, 44619.0, 187602.0, 148626.0, 15660.0, 86548.0, 56833.0, 190544.0, 38648.0, 189204.0, 195916.0, 189474.0, 198931.0, 127388.0, 100411.0, 42999.0, 42559.0, 198758.0, 74074.0, 42438.0, 187046.0, 90230.0, 65707.0, 54417.0, 71210.0, 71349.0, 176703.0, 74060.0, 56918.0, 181123.0, 27059.0, 34751.0, 25689.0, 22465.0, 76382.0, 183344.0, 89448.0, 38984.0, 96115.0, 64341.0, 46816.0, 49119.0, 44101.0, 41268.0, 58855.0, 181001.0, 41366.0, 16332.0, 33463.0, 32635.0, 79399.0, 28459.0, 181059.0, 23155.0, 85206.0, 32089.0, 102864.0, 82481.0, 186847.0, 93409.0, 120274.0, 134576.0, 125796.0, 119096.0, 133383.0, 37124.0]]

En revanche si on fait un print numpy.ndim(donnees) il renvoie 1.

On arrive pas a trouver d'où provient le soucis

Voici l'erreur complète :

Code:

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<type 'exceptions.ValueError'> Exception in Tk callback
  Function: <function Kruskall_wallis at 0x7f573d07aed8> (type: <type 'function'>)
  Args: ()
Traceback (innermost last):
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/Pmw/Pmw_1_3/lib/PmwBase.py", line 1747, in __call__
    return apply(self.func, args)
  File "/autofs/netapp/account/cremi/kjamart/AAA_Semestre2/PROJET/Projet_S8/Statistiques.py", line 63, in Kruskall_wallis
    res = mstats.kruskalwallis(donnees)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/stats/mstats_basic.py", line 858, in kruskalwallis
    output = argstoarray(*args)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/stats/mstats_basic.py", line 127, in argstoarray
    raise ValueError("The input should be 2D")
<type 'exceptions.ValueError'>: The input should be 2D

Quelqu'un aurait il une idée ?

Cordialement,

Unic0

Salut,

Si tu executes ce test:
Code:

1 2 for data_set in donnees: print len(data_set)
Cela affichera quelque chose comme:
Code:

1 2 3 4 5 6 108 108 106 108 27 ...
Si tu contruis ta matrice à partir de cette liste de liste en faisant simplement:

Code:

data_array = np.array(donnees)

Numpy ne dit rien, mais le résultat n'est pas un array 2D. Pour t'en assurer tu peux faire:
Code:

1 2 print data_array.shape >>> (11,) # devrait être quelque chose comme (11,108)
Il faut que toutes les sous listes soient de meme tailles pour construire une matrice.

Merci pour ta réponse, l'intérêt de se test vient de la possibilité justement d'avoir des listes de tailles différentes à analysée (dans le cadre du projet), de fait la réponse que nous avons trouvée est de permettre cette possibilité en ajoutant un '*' aux paramètres de la fonction, le programme tourne désormais correctement pour cette partie.

Merci encore,

Cordialement,

Unic0