Faire du SSH avec la même flexibilité que Putty

Bonjour,

Je cherche à réaliser en Java un programme permettant d'installer et de configurer intégralement un serveur débian. Il me faut donc pouvoir interagir en SSH avec les serveurs. J'ai un peu regarder certaines librairies java, mais elles ne permettent, d'après les tests que j'ai fait, qu'à envoyer rapidement une commande SSH.
Or j'ai besoin de plus, par exemple dans Putty lors d'une installation on rentre parfois dans mysql pour y taper quelque chose, on va par exemple lancer un "apt-get install postfix", ensuite l'installation nous affiche une configuration (panneau bleu) où il faut sélectionner "Site Internet" et d'autres trucs pour finir l'installation et il faut détecter quand c'est fini et qu'on a la main pour mettre la prochaine commande.

Bref il faut ouvrir un Shell et avoir la même maniabilité que sur Putty. Connaissez vous un bon moyen de faire ça ?