Création de masque de ROI sur imageJ

Bonjour à tous,

Est-il possible de créer un masque constitué de plusieurs ROI permettant de calculer la moyenne des pixels d'une image à certains endroits (qui seront toujours les mêmes)?
Ce masque doit contenir tous les trous de l'objet test, même ceux qui ne sont que peu décelables sur l'image (voir plus bas) de sorte à évaluer quels trous sont considérés comme visible et ceux qui ne le sont pas (à partir d'un seuil établi)

Si cela est réalisable, pourriez-vous m'aiguiller dans la réalisation de ce masque? Ou existe-t-il une méthode plus efficace?

voici mon image:
Pièce jointe 172330

Je vous remercie d'avance =)

Je ne pense pas (à confirmer) qu'une ROI puisse avoir plusieurs composantes.
En revanche, tu peux très bien utiliser une image masque qui représente tes ROI : tu traites un pixel de l'image uniquement si le même pixel de l'image masque est non nul. Cela revient à faire ce que tu souhaites.

Ensuite pour détecter les trous visibles, je te conseille de commencer par un peu de morphologie mathématique pour nettoyer ton image. Je commencerai par une ouverture pour mettre en évidence les trous.
Dans ton cas tu peux aussi faire une augmentation du contraste pour accentuer encore un peu plus les trous.
Ensuite, tu seuilles ou tu fais ce que l'on appelle un bouchage de trous (il doit y avoir des pluggins qui font cela). Un H-minima peut également faire le travail dans ton cas.