Programmation transcription ADN en ARNm

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Si quelqu'un pouvais aider un jeune padawan, ça serait super !

Voici mon code:
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 def ADN2arn(ch): texte = traitement_fichier(ch) transcription = {'T':'a','A':'u','G':'c','C':'g'} texte_transcrit = '' for lettres in transcription: texte_transcrit = texte.replace(lettres,transcription[lettres]) return texte_transcrit print(ADN2arn('chromo.txt'))
Je voudrais remplacer chaque lettres majuscules présentent dans le dictionnaire par les lettres minuscules correspondantes.
Mais lorsque je fais tourner le programme ...

Liste initiale -> TCAGTGTTAGTGTTAGTGTTAGTATTAGGGTGTGGTGTGTGGGTGTGGTGTGGGTGTGGGTGTGGGTGTG
GGTGTGGGTGTGGGTGTGGTGTGGTGTGTGGGTGTGGTGTGGGTGTGGTGTGTGTGGG

Liste retournée -> TCAcTcTTAcTcTTAcTcTTAcTATTAcccTcTccTcTcTcccTcTccTcTcccTcTcccTcTcccTcTc\
ccTcTcccTcTcccTcTccTcTccTcTcTcccTcTccTcTcccTcTccTcTcTcTccc

Il a seulement choisit de changer le G ..
Pourquoi pas les autres lettres ?

21/02/2015, 12h55
plxpy

Bonjour

je ne me prononce pas sur la méthode. Mais, l'explication est très simple.

A chaque itération, tu ré-affectes texte_transcrit (et donc tu écrases allègrement ce qui a pu être fait avant). L'ordre étant (presque ...) quelconque quand on parcourt un dictionnaire, tu n'as droit, au final, qu'à la dernière itération : dans le cas présent, 'G' a été transformé en 'c'.
21/02/2015, 13h04
VincentBr

Ah d'accord ! Mais je ne vois pas vraiment comment resoudre mon probleme ..

Vous pensez à quelle autre méthode s'il vous plait ?
21/02/2015, 13h10
plxpy

Citation:

Envoyé par VincentBr

Mais je ne vois pas vraiment comment resoudre mon probleme ..

Oh ! Travailler sur une chaine mise à jour, itération après itération, pardi. Ne pas repartir de la chaine initiale mais de la chaine modifiée (par les itérations précédentes)
21/02/2015, 13h46
VincentBr

Je ne comprends pas vraiment en fait comment tourne le programme finalement ..
Pourquoi l'étape

Citation:

Travailler sur une chaine mise à jour, itération après itération

ne se fait pas déjà ?
Je ne cerne pas la condition nécessaire pour ma boucle while dans le cas contraire pour parcourir le texte modifié précédent.
21/02/2015, 13h53
plxpy

Citation:

Envoyé par VincentBr

... pour ma boucle while

quelle boucle while ? Je n'ai rien vu de tel !
21/02/2015, 14h21
VincentBr

Je me suis mal fait comprendre !

Juste pour résoudre mon problème et travailler sur une chaine mis à jour, je pensais que je devais utiliser une boucle while. Il n'en est rien ?
Je ne vois pas comment mettre en oeuvre votre conseille en fait.

Salut,

Vous avez les méthodes maketrans et translate pour faire çà:
Code:

1 2 3 4 >>> table = str.maketrans('TAGC', 'aucg') >>> 'TCAGTGTTAGTGTTAGTGTTAGTATTAGGGTG'.translate(table) 'agucacaaucacaaucacaaucauaaucccac' >>>
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