Données read.FCS

Bonjour,

Je cherche à extraire des données avec la fonction read.FCS

Code:

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> sample<-read.FCS("fichier.fcs") > exprs(sample)[1:5, c(3:6)] Comp-FL 1 Log Comp-FL 2 Log Comp-FL 4 Log pop [1,] 16.233442 20.28909 738.504150 2 [2,] 11.501602 33.27855 23.670496 3 [3,] 6.176196 22.30803 10.153282 3 [4,] 3.113504 19.23444 5.567299 0 [5,] 5.931785 13.99984 203.251938 3

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Je voudrai donc extraire les lignes où pop est égale à 3 par exemple.

J'ai essayé avec :

Code:

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1 2 3

> exprs(sample)[sample$pop==3] Erreur dans sample$pop == 3 : comparaison (1) possible seulement pour les types liste et atomique

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Si vous avez une petite idée, elle serait la bienvenue !

Essaye :

Code:

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exprs(sample)[exprs(sample)$pop==3,]

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Code:

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1 2	> exprs(sample)[exprs(sample)$pop==3,] Erreur dans exprs(sample)$pop : $ operator is invalid for atomic vectors

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J'ai contourné le problème en insérant mes données dans un fichier txt et je les relie avec read.table et là plus de problème. Pas très propre mais ça fonctionne...

Code:

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>write.table(exprs(sample), "out.txt", sep="\t", quote=FALSE) >sample<-read.table("out.txt",sep="\t") >pop<-sample[sample$pop==3,]

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