Copier à partir d'une ligne spécifique

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Bonsoir tout le monde,

j'ai développé une fonction qui me permet de copier un ensemble de paragraphe à partir des lignes spécifiques.
Mais le problème que la fonction n'affiche pas les paragraphes désirés.
En fait, j'ai une liste ( listdebut) qui contient Debut de chaque paragraphe que je dois copier. (listfin)
Listfin: indique fin de chaque paragraphe.

Voici le code:

Code:

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//stream reader
            InputStream ips=new FileInputStream(fichier);
            InputStreamReader ipsr=new InputStreamReader(ips);
            BufferedReader br=new BufferedReader(ipsr);
            //creation paragraph
            String parag = "";
            String line;
            int nbLigne = 0;
 
            while((line=br.readLine()) != null)
            {
            if(listdebut.contains(nbLigne))<br>             {
                    int i = listdebut.indexOf(nbLigne);<br>                 int debut = (int)listdebut.get(i);
                    int fin = (int)listfin.get(i);
                    String ligne;
                    for(int j=debut;j<fin;j++)  if((ligne=br.readLine())!=null) parag=parag+ligne+"\n";
 
                    list.add(parag);
                }
                nbLigne++;<br>          }
 
        }catch(Exception e) { System.out.println(e.toString());}
        //System.out.println(list.toString());
        return list;

14/06/2014, 01h08
tchize_

et Ca affiche quoi à la place?

il ne commence pas à afficher depuis la ligne de début indiqué.
Par exemple, dans le fichier source, la ligne "2 597 573" commence par la phrase ID
Code:

1 2 3 4 5 6 2 597 573 ID LDLR_HUMAN Reviewed; 860 AA. 2 597 574 AC P01130; B4DII3; B4DJZ8; B4DR00; B4DTQ3; C0JYY8; H0YLU8; H0YNT7; 2 597 575 AC Q53ZD9; Q59FQ1; Q9UDH7; 2 597 576 DT 21-JUL-1986, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot. 2 597 577 DT 21-JUL-1986, sequence version 1.
Mais le programme débute l'affichage par:
Code:

1 2 3 AC Q53ZD9; Q59FQ1; Q9UDH7; DT 21-JUL-1986, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
Malgré qu'il affiche correctement les lignes de début et fin.
Code:

1 2 3 4 debut 2597573 fin 2599183 contenu AC Q53ZD9; Q59FQ1; Q9UDH7; DT 21-JUL-1986, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
--
De même , il dépasse la ligne de fin, au lieu de s’arrêter à 2599183, il rajoute quelques lignes.

14/06/2014, 12h48
tchize_

Quelque remarques:

-> avec ton comptage la première ligne est la ligne 0, pas la ligne 1. La plupart des editeur vont commencer à 1 pas à 0 quand ils te donnent le numéro de ligne
-> Dans ton if(listdebut.contains(nbLigne)), tu lit dans une deuxième boucle le fichier, mais tu oublie de compter ces lignes, donc tu va tout décaler par la suite.
-> Enfin, ta lecture, c'est ligne de début et ligne de fin exclues, puisque dès la ligne atteinte, la première chose que tu fais, c'est un nouveau readline qui lit la ligne suivante.

Donc rien qu'avec le point 1 et 3, tu décale déjà ta lecture de 2 lignes vers le bas.

J'ai modifié mon code de cette manière:

Code:

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int nbLigne = 1;
 
            while((line=br.readLine()) != null)
            {
            if(listdebut.contains(nbLigne))<br>             {
                    int i = listdebut.indexOf(nbLigne);<br>                 int debut = (int)listdebut.get(i);
                    int fin = (int)listfin.get(i);
                    String ligne;
                    for(int j=debut;j<fin;j++)  {
                     if((ligne=br.readLine())!=null) {parag=parag+ligne+"\n";nbLigne++;}}
 
                    list.add(parag);
                }
                nbLigne++;<br>          }
 
        }catch(Exception e) { System.out.println(e.toString());}
        //System.out.println(list.toString());
        return list;

=> il a respecté la fin indiqué mais il a commencé l'affichage à partir ligne de début +1.
Exemple: ( fichier source)

Code:

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2 597 573 ID   LDLR_HUMAN              Reviewed;         860 AA.
2 597 574 AC   P01130; B4DII3; B4DJZ8; B4DR00; B4DTQ3; C0JYY8; H0YLU8; H0YNT7;
2 597 575 AC   Q53ZD9; Q59FQ1; Q9UDH7;
2 597 576 DT   21-JUL-1986, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
2 597 577 DT   21-JUL-1986, sequence version 1.

Résultat: il n'a pas affiché la ligne de début qui contient ID .....

Code:

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content : AC   P01130; B4DII3; B4DJZ8; B4DR00; B4DTQ3; C0JYY8; H0YLU8; H0YNT7;
AC   Q53ZD9; Q59FQ1; Q9UDH7;

Merci bien tchize_ pour votre aide