Perltk pour lancer des scripts perl et R.

Version imprimable

Bonjour, voilà je suis sur une interface graphique et j'ai des petits soucis. Bon pour commencer, j'ai écris ça pour pouvoir soit entrer le nom du fichier voulu (ou dossier), soit ouvrir Fileselect pour en choisir un... Sauf que le soucis c'est que je galère à stocker mes variables et à afficher dans mon entry le fichier une fois choisis avec le Fileselect...
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 my $lab1 = $onglet1->Label ( -text => 'Choix du dossier "Read" :', -font => '{arial} 9 bold', ) ->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left'); $lab1->grid(-row => 0, -column => 1, ); my $entry1 = $onglet1->Entry(-text => my $file_se1 )->pack( qw/ -side left/ ); $entry1->grid(-row => 0, -column => 2, ); my$b1=$onglet1->Button ( -text => '...', -command => sub { my $start_dir = "."; my $Fsref = $fenetre_principale->FileSelect(-directory => $start_dir,-verify => [ '-e' ]); my $file = $Fsref->Show; $Fsref->configure( -command=>\&sous($file), -width => 25 ); sub sous { my $file = $_[0] || ''; print "Choix 1 = $file \n"; $file_se1=$file; } }, )->pack( qw/ -side left/ ); &bind_message($b1, "Cliquez pour choisir le dossier contenant les conditions en .fastq à lancer."); $b1->grid(-row => 0, -column => 3, );
Ensuite, mon second soucis est que je veux lancer un perl, où un R avec ces arguments une fois importés , et je ne sais pas trop comment m'y prendre... mon bouton de lancement ressemble à ça pour le moment :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 my$b5=$onglet1->Button ( -text => 'LANCER L\'ETAPE 1 !', #-command => [\&ma_fonction, $arg1, $arg2...],. -command => sub { #programme là ? print "test du lancement 1. \n"; print "doss 1 : $file_se1 \n"; print "doss 2 : $file_se2 \n"; print "doss 3 : $file_se3 \n"; print "doss 4 : $file_se4 \n"; }, )->pack( qw/ -side left/ ); &bind_message($b5, "Cliquez pour lancer le match."); $b5->grid(-row => 4, -column => 3, );
Voilà, j'ai mis les print pour vérifier le fonctionnement, mais là je bloque ... Si quelqu'un pouvais me filer un coup de main ça serrai génial, c'est un projet que je suis censé finir ce week-end max.

28/03/2014, 10h27
djibril

Bonjour,

Premier conseil, essaye d'améliorer ton indentation, car un code Tk devient très vite illisible, pire si l'indentation n'est pas bonne.
Secondo, on va procéder par étape et d'abord trouver une solution pour ton premier souci.

Peux-tu le reformuler et nous donner un code afin que l'on comprenne ce qui ne va pas ?

Ok je vais essayer de mieux présenter ça. Donc problème 1 : J'aimerais pouvoir choisir des dossier ou des fichiers via un bouton menant à une fenêtre fileselect et stocker les chemins obtenus dans différentes variables. pour le moment mes boutons ressemblent à ça :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 my$b4=$onglet1->Button ( -text => '...', -command => sub { my $start_dir = "."; my $Fsref = $fenetre_principale->FileSelect(-directory => $start_dir,-verify => [ '-e' ]); my $file4 = $Fsref->Show; $Fsref->configure ( -command=>\&sous($file4), -width => 25 ); sub sous { my $file4 = $_[0] || ''; print "Choix 4 = $file4 \n"; $file_se4=$file4; } }, ) ->pack( qw/ -side left/ ); &bind_message ($b4, "Cliquez pour choisir le dossier de sortie des Logs." ); $b4->grid ( -row => 3, -column => 3, );
Le soucis est que j'ai mis le même code pour les autres boutons avec des variables différentes 4 étant pour le bouton 4, Et le soucis est que lorsque je print mes variables

Code:

$file_se4

par exemple, et bien seulement le dernier est retenu....

Voici un exemple de programme que tu peux tester et qui fonctionne

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
#! usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
use Encode;
use Tk;
 
my $mw = MainWindow->new( -title => "Sélectionner des fichiers" );
$mw->minsize( 300, 200 );
my $button = $mw->Button(
	-text    => "Exit",
	-command => sub { exit; }
)->pack;
 
my ( $selection1, $selection2 ) = ();
my $button1 = $mw->Button(
	-text    => "Sélecion 1",
	-command => sub {
		$selection1 = $mw->getOpenFile();
		if ( defined $selection1 ) {
			$selection1 = encodage_windows($selection1);
			print "Selection 1 : $selection1\n";
		}
	},
)->pack;
 
my $button2 = $mw->Button(
	-text    => "Sélecion 2",
	-command => sub {
		$selection2 = $mw->getOpenFile();
		if ( defined $selection2 ) {
			$selection2 = encodage_windows($selection2);
			print "Selection 2 : $selection2\n";
		}
	},
)->pack;
 
MainLoop;
 
# Dans un environnement Windows, cette procédure permet de gérer l'encodage
sub encodage_windows {
	my $chaine = shift;
	my $OS     = lc($^O);
	if ( $OS eq 'mswin32' and defined $chaine ) {
		$chaine = encode( 'iso-8859-1', $chaine );
	}
	return $chaine;
}

Il crée deux boutons de sélection de fichiers et effectue des print. Le plus important est de remarquer l'emplacement des déclarations des variables qui stockerons des fichiers afin de pouvoir les utiliser dans ton script entier.

Ok, premier problème, résolu, getOpenFile ne marche pas sur mon ordi, je ne sais pas pourquoi, mais je me suis inspiré de votre code, et j'ai trouvé le soucis, ma sub sous était la même partout alors j'ai juste numéroté les sous routines et c'est bon :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 my$b4=$onglet1->Button ( -text => '...', -command => sub { my $start_dir = "."; my $Fsref = $fenetre_principale->FileSelect(-directory => $start_dir,-verify => [ '-e' ]); my $file4 = $Fsref->Show; $Fsref->configure ( -command=>\&sous4($file4), -width => 25 ); sub sous4 { my $file4 = $_[0] || ''; print "Choix 4 = $file4 \n"; $file_se4=$file4; } }, )
Du coup passons au problème suivant si vous voulez bien. J'aimerais que l'utilisateur puisses avoir le choix entre ce bouton, et une Entry pour pouvoir saisir le chemin du fichier désiré, et j'aimerais que lorsque le fichier est séléctionné via le bouton, il s'affiches dans la zone entry. Voilà mon code pour le moment... Je pensait qu'il faillais peu être update la valeur dans le champ ou quelque chose du genre... Mais j'ai pas réussit...
Code:

1 2 my $entry4 = $onglet1->Entry(-text => my $file_se4 )->pack( qw/ -side left/ ); $entry4->grid(-row => 3, -column => 2, );
Ça me parais naze comme soucis, mais pour ma défense, j'ai pas eu de cours en tk et juste quelques bases de perl. Donc j'apprends sur le tas... :calim2:

28/03/2014, 15h41
djibril

L'écriture de votre code n'est vraiment pas bonne. Les sous programmes sont déclarées n'importe comme et surtout appelée n'importe comment dans Tk.
Je vous ai mis le code pour que vous puissiez vous en inspirer. Et il y a aussi la FAQ Perl Tk de disponible sur ce site.

Je me doutes bien que mon code doit paraître vraiment très sale. Comme je l'ai dis je fais comme je peux avec le temps que je peux y accorder... J'ai appris tk via google, au fil des sujets, et je n'ai vraiment pas le temps de prendre un livre sur perltk et apprendre à m'en servir bien. Car je n'ai que jusqu'à lundi... Pour le moment mon script complet est le suivant et ressemble à ce que je désire. obtenir.

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
use Tk;
use Tk::NoteBook;
use Tk::FileSelect;
 
my $fenetre_principale = MainWindow->new( -title => 'MetRe A.', -background => 'white', );
$fenetre_principale->minsize ( 600, 600);
 
 
 
my $message="";
$fenetre_principale ->Label(-textvariable => \$message)
   ->pack(-side => 'bottom', -fill => 'x');
 
 
 
 
 
# blocnote
my $blocnote = $fenetre_principale->NoteBook
	(
	-background    => '#00007f3b0000',
	-backpagecolor => 'white',
	-inactivebackground => '#434dcdd28087',
	)->pack( qw/-fill both -expand 1/ );
 
 
 
 
 
# onglets
my $onglet1 = $blocnote->add('Création des données', -label => 'Création des données', );
my $onglet2 = $blocnote->add('Analyse préliminaire', -label => 'Analyse préliminaire',);
my $onglet3 = $blocnote->add('Analyse des matchs',-label => 'Analyse des matchs',);
my $onglet4 = $blocnote->add('Etude de couverture',-label => 'Etude de couverture',);
&bind_message($onglet1, "Création du jeux de données.");
&bind_message($onglet2, "Analyse préliminaire des fichiers de conditions.");
&bind_message($onglet3, "Analyse des résultats du match.");
&bind_message($onglet4, "Etude de la couverture des match.");
 
 
#ONGLET 1
 
my $lab1 = $onglet1->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du dossier "Read" :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab1->grid(-row => 0, -column => 1, );
 
my $entry1 = $onglet1->Entry(-text => my $file_se1 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry1->grid(-row => 0, -column => 2, );
 
my$b1=$onglet1->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{ 
		my $start_dir = ".";
		my $Fsref = $fenetre_principale->FileSelect(-directory => $start_dir,-verify => [ '-e' ]);
		my $file1 = $Fsref->Show;
		$Fsref->configure(
            -command=>\&sous1($file1),
            -width => 25
			);
		sub sous1 {
			my $file1 = $_[0] || '';
			print "Choix 1 = $file1 \n";
			$file_se1=$file1;
			}
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b1, "Cliquez pour choisir le dossier contenant les conditions en .fastq à lancer.");
$b1->grid(-row => 0, -column => 3, );
 
 
 
my $lab2 = $onglet1->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du fichier "Megatranscriptome" :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab2->grid(-row => 1, -column => 1, );
 
my $entry2 = $onglet1->Entry(-text => my $file_se2 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry2->grid(-row => 1, -column => 2, );
 
my$b2=$onglet1->Button
	( 
		-text => '...', 
		-command => sub 
			{ 
		my $start_dir = ".";
		my $Fsref = $fenetre_principale->FileSelect(-directory => $start_dir,-verify => [ '-e' ]);
		my $file2 = $Fsref->Show;
		$Fsref->configure(
            -command=>\&sous2($file2),
            -width => 25
			);
		sub sous2 {
			my $file2 = $_[0] || '';
			print "Choix 2 = $file2 \n";
			$file_se2=$file2;
			}
			}, 
 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b2, "Cliquez pour choisir le fichier .fasta du Megatranscriptome.");
$b2->grid(-row => 1, -column => 3, );
 
 
my $lab3 = $onglet1->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du dossier de sortie :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab3->grid(-row => 2, -column => 1, );
 
my $entry3 = $onglet1->Entry(-text => my $file_se3 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry3->grid(-row => 2, -column => 2, );
 
my$b3=$onglet1->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{  
		my $start_dir = ".";
		my $Fsref = $fenetre_principale->FileSelect(-directory => $start_dir,-verify => [ '-e' ]);
		my $file3 = $Fsref->Show;
		$Fsref->configure(
            -command=>\&sous3($file3),
            -width => 25
			);
		sub sous3 {
			my $file3 = $_[0] || '';
			print "Choix 3 = $file3 \n";
			$file_se3=$file3;
 
			}
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b3, "Cliquez pour choisir le dossier de sortie des résultats.");
$b3->grid(-row => 2, -column => 3, );
 
 
my $lab4 = $onglet1->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du dossier de sortie des logs :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab4->grid(-row => 3, -column => 1, );
 
my $entry4 = $onglet1->Entry(-text => my $file_se4 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry4->grid(-row => 3, -column => 2, );
 
my$b4=$onglet1->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{  
		my $start_dir = ".";
		my $Fsref = $fenetre_principale->FileSelect(-directory => $start_dir,-verify => [ '-e' ]);
		my $file4 = $Fsref->Show;
		$Fsref->configure
			(
            -command=>\&sous4($file4),
            -width => 25
			);
		sub sous4 
			{
			my $file4 = $_[0] || '';
			print "Choix 4 = $file4 \n";
			$file_se4=$file4;
			}
		}, 
	)
->pack( qw/ -side left/ ); 
 
&bind_message
	($b4,
	"Cliquez pour choisir le dossier de sortie des Logs."
	);
 
$b4->grid
	(
	-row => 3, 
	-column => 3, 
	);
 
 
my$b5=$onglet1->Button
	( 
	-text => 'LANCER L\'ETAPE 1 !', 
	#-command => [\&ma_fonction, $arg1, $arg2...],.
	-command => sub 
		{ 
 
 
#programme là ?
print "test du lancement 1. \n";
print "doss 1 : $file_se1 \n";
print "doss 2 : $file_se2 \n";
print "doss 3 : $file_se3 \n";
print "doss 4 : $file_se4 \n";
 
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b5, "Cliquez pour lancer le match.");
$b5->grid(-row => 4, -column => 3, );
 
 
 
 
 
 
 
#ONGLET 2
 
 
 
 
 
 
 
my $lab7 = $onglet2->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du dossier "Read" :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab7->grid(-row => 0, -column => 1, );
 
my $entry7 = $onglet2->Entry(-text => my $file_se7 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry7->grid(-row => 0, -column => 2, );
 
my$b7=$onglet2->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{ 
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b7, "Cliquez pour choisir le dossier contenant les conditions en .fastq à lancer.");
$b7->grid(-row => 0, -column => 3, );
 
 
my $lab6 = $onglet2->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du dossier de sortie :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab6->grid(-row => 1, -column => 1, );
 
my $entry6 = $onglet2->Entry(-text => my $file_se6 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry6->grid(-row => 1, -column => 2, );
 
my$b6=$onglet2->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{  
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b6, "Cliquez pour choisir le dossier de sortie des résultats.");
$b6->grid(-row => 1, -column => 3, );
 
 
 
 
my$b8=$onglet2->Button
	( 
	-text => 'LANCER L\'ETAPE 2 !', 
	-command => sub 
		{ 
 
 
#programme là pr etape 2
print "test du lancement 2.\n"
 
		}, 
	)->grid(-row => 4, -column => 3, ); 
&bind_message($b8, "Cliquez pour lancer l'exploitation des données de conditions.");
 
 
 
#ONGLET 3
 
 
 
my $lab9 = $onglet3 -> Label 
	(
	-text    => 'Choix du fichier "Megatranscriptome" :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab9->grid(-row => 0, -column => 1, );
 
my $entry9 = $onglet3->Entry(-text => my $file_se9 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry9->grid(-row => 0, -column => 2, );
 
my$b9=$onglet3->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{ 
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b9, "Cliquez pour choisir le fichier .fasta du Megatranscriptome.");
$b9->grid(-row => 0, -column => 3, );
 
my $lab10 = $onglet3->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du dossier des résultats du match :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab10->grid(-row => 1, -column => 1, );
 
my $entry10 = $onglet3->Entry(-text => my $file_se10 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry10->grid(-row => 1, -column => 2, );
 
my$b10=$onglet3->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{  
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b10, "Cliquez pour choisir le dossier contenant les résultats du match créé à l'étape 1.");
$b10->grid(-row => 1, -column => 3, );
 
my $lab11 = $onglet3->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du dossier de sortie des résultats :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab11->grid(-row => 2, -column => 1, );
 
my $entry11 = $onglet3->Entry(-text => my $file_se11 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry11->grid(-row => 2, -column => 2, );
 
my$b11=$onglet3->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{  
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b11, "Cliquez pour choisir le dossier de sortie des résultats.");
$b11->grid(-row => 2, -column => 3, );
 
my $lab12 = $onglet3->Label 
	( 
	-text    => 'Si des résultats préliminaires ont étés obtenus précédemment : ',
	-font    => '{arial} 10 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab12->grid(-row => 4, -column => 1, -columnspan => 3, );
 
my $lab13 = $onglet3->Label 
	( 
	-text    => 'Nombre_de_reads_par_individus.txt :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab13->grid(-row => 5, -column => 1, );
 
my $entry13 = $onglet3->Entry(-text => my $file_se13 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry13->grid(-row => 5, -column => 2, );
 
my$b13=$onglet3->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{  
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b13, "Veuillez sélectionner l\'emplacement du fichier contenant le nombre de reads par individus.");
$b13->grid(-row => 5, -column => 3, );
 
my$b14=$onglet3->Button
	( 
	-text => 'LANCER L\'ETAPE 3 !', 
	-command => sub 
		{ 
 
 
#programme là pr etape 3
print "test du lancement 3.\n"
 
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b14, "Cliquez pour lancer l'analyse des matchs.");
$b14->grid(-row => 6, -column => 3, );
 
 
#ONGLET 4
 
my $lab15 = $onglet4->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du fichier "Megatranscriptome" :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab15->grid(-row => 0, -column => 1, );
 
my $entry15 = $onglet4->Entry(-text => my $file_se15 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry15->grid(-row => 0, -column => 2, );
 
my$b15=$onglet4->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{ 
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b15, "Cliquez pour choisir le fichier .fasta du Megatranscriptome.");
$b15->grid(-row => 0, -column => 3, );
 
my $lab16 = $onglet4->Label 
	( 
	-text    => 'Nom d\'une séquence de référence :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab16->grid(-row => 1, -column => 1, );
 
my $entry16 = $onglet4->Entry(-text => my $nomseq )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry16->grid(-row => 1, -column => 2, );
 
 
my $lab17 = $onglet4->Label 
	( 
	-text    => 'Résultat de l\'analyse des matchs : ',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab17->grid(-row => 2, -column => 1, );
 
my $entry17 = $onglet4->Entry(-text => my $file_se17 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry17->grid(-row => 2, -column => 2, );
 
my$b17=$onglet4->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{ 
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b17, "Cliquez pour choisir le fichier résultant de l'étape 3.");
$b17->grid(-row => 2, -column => 3, );
 
my $lab18 = $onglet4->Label 
	( 
	-text    => 'Choix du dossier de sortie :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$lab18->grid(-row => 3, -column => 1, );
 
my $entry18 = $onglet4->Entry(-text => my $file_se18 )->pack( qw/ -side left/ );  
$entry18->grid(-row => 3, -column => 2, );
 
my$b18=$onglet4->Button
	( 
	-text => '...', 
	-command => sub 
		{ 
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b18, "Cliquez pour choisir le dossier de sortie des résultats.");
$b18->grid(-row => 3, -column => 3, );
 
my$b19=$onglet4->Button
	( 
	-text => 'LANCER L\'ETAPE 4 !', 
	-command => sub 
		{ 
 
 
#programme là ?
print "test du lancement 4.\n"
 
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b19, "Cliquez pour lancer la dernière étape.");
$b19->grid(-row => 4, -column => 3, );
 
 
 
 
 
 
 
 
 
#zone de terminal + bench 
 
 
 
my $fene1 = $fenetre_principale->Frame(
    -height => 30,
    -bg     => '#00007f3b0000',
    )->grid(-row => 0, -column => 1,-rowspan => 1, -sticky => 'nsew');
	$fene1->pack( qw/ -fill both -expand 0/ );
 
 
 
 
my $fene2 = $fenetre_principale->Frame()
->grid(-row => 0, -column => 3, -columnspan => 1);
$fene2->pack( qw/ -fill both -expand 0/ );
 
my $label2 = $fene2->Label 
	( 
	-text    => 'Temps total écoulé :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$label2->grid(-row => 0, -column => 5, );
my $entr2 = $fene2->Entry(-text => 'XXy XXm XXd XX:XX:XX' )->pack( qw/ -side left/ );  
$entr2->grid(-row => 0, -column => 6, );
 
my$bouton1=$fene2->Button
	( 
	-text => 'r', 
	-command => sub 
		{ 
		#fileselect
		}, 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($bouton1, "Cliquez pour réinitialiser le temps tolal.");
$bouton1->grid(-row => 0, -column => 7, );
 
my $label3 = $fene2->Label 
	( 
	-text    => 'Temps écoulé :',
	-font    => '{arial} 9 bold',
	)
	->pack(qw/-padx 10 -pady 10 /, -side=>'left');
$label3->grid(-row => 0, -column => 3, );
 
my $entr3 = $fene2->Entry(-text => 'XXm XXd XX:XX:XX' )->pack( qw/ -side left/ );  
$entr3->grid(-row => 0, -column => 4, );
 
 
 
 
#stdout en fenetre
my $term = $fene1->Text(
      -height     => 10,
      -wrap       => "none",
      -relief     => "solid",
    )->pack(-fill => "both", -expand => 1);
 
 tie *STDOUT, ref $term, $term;
 
&bind_message($term, "Zone affichant la sortie du terminal.");
 
 
 
 
#$cadre1->Label
#	( 
#	-text => 'Et la, la partie de bench' 
#	)
#	->pack
#		(
#		 -side => 'right'
#		);
 
 
 
sub bind_message {
  my ($widget1, $msg) = @_;
  $widget1->bind('<Enter>', [ sub { $message = $_[1]; }, $msg ]);
  $widget1->bind('<Leave>', sub { $message = ""; });
}
 
MainLoop;

Si vous voulez le tester, il se lance sans message d'erreur. Mon soucis n°2 est plus de l'ordre du gadget que de l'essentiel. Lorsque j'ouvre un lien via le un bouton (...) (mis en place pour le moment que dans le premier onglet.) j'aimerais qu'il s'affiche dans l'Entry correspondante...

Je me doutes que le code ne soit pas du tout bien présenté, mais je n'ai plus le temps de réarranger la présentation sur 600 lignes. Je vous prie donc de m'en excuser.

La principale chose que j'aimerais faire c'est pouvoir lancer, via les boutons (Lancer l'etape x!, $b5 par exemple) des scripts que j'ai fait sous R et sous perl exécutables via "prog.r arg1 arg2 arg3". Les arguments étant les $files_se enregistrés...

:calim2::calim2::calim2::calim2: Pouvez vous m'aider ? S'il vous plait ? :calim2::calim2::calim2::calim2::calim2:

Petite piste pour te guider :

Code:

1
2
my $file_se1;
my $entry1 = $onglet1->Entry(-textvariable => \$file_se1 )->pack( qw/ -side left/ );

Merci vous êtes génial !! Je voit, -textvariable ... J'ss nule... mais du coup juste pour bien comprendre, pourquoi un slash avant ma variable ? En tout cas ça marche maintenant, et c'est exactement ça!! ...

Nous voilà donc maintenant au cœur de mon problème, ma principale interrogation vis à vis de ce sujet. Comment lancer un script externe perl ou R dans un bouton ?

Je sais pas trop comment ça marches, est ce que la commande est juste transférée telle quel dans le terminal où il y a une instruction à donner pour ça ? Pour le moment j'ai ça, et je n'ai pas trouvé grand chose sur le sujet sur google, où du moins qui marche pour moi :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 my$b5=$onglet1->Button ( -text => 'LANCER L\'ETAPE 1 !', #-command => [\&ma_fonction, $arg1, $arg2...],. -command => \"perl sprojet.pl, file_se1, file_se2, file_se3" # ici ? sprojet.pl est dans le dossier courant et se lance via perl sprojet.pl <cond1> <cond2> <cond3> -command => sub { #programme là ? print "test du lancement 1. \n"; print "doss 1 : $file_se1 \n"; print "doss 2 : $file_se2 \n"; print "doss 3 : $file_se3 \n"; print "doss 4 : $file_se4 \n"; }, )->pack( qw/ -side left/ ); &bind_message($b5, "Cliquez pour lancer le match."); $b5->grid(-row => 4, -column => 3, );
Et du coup sur les autres onglet ce sont des scripts R, et je n'ai aucune idée de leur lancement en ligne de commande si c'est bien comme ça qu'il faut faire ... Mais je penses que déjà la solution pour l'un va m'éclairer et guider mes recherches pour l'autre... Merciii =).

28/03/2014, 20h07
djibril
Un peu de lecture car il faut apprendre à lire la documentation officielle :
- http://perl.developpez.com/faq/tk/?p...boutons-Button
- http://perl.developpez.com/faq/perl/...onction-system
Sinon consulter aussi les cours et tutoriels pour apprendre Perl : http://perl.developpez.com/cours/

Pour le bouton, c'est exactement ce que j'avais vu mais ailleurs, et du coup je voulais savoir comment choisir entre un -command => sub { ... }, et -command => [\&ma_fonction, $arg1, $arg2...],. Le second me semble le plus adapté, je me trompe ? Et pourquoi ?

Ensuite, je suis pas sure de comprendre la différence entre system(ma commande) et exec ("ma commande") J'ai compris que exec va fermer mon interface dés qu'il aura fini, c'est bien ça ? donc faudrait que je code :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 my $commande = 'perl sprojet.pl'; system($commande) == 0 or die "Erreur de la commande : $commande\n"; [...]->Button ( -text => '...', -command => [\&commande, $file_se1, $file_se2, $file_se3], )->[...]
C'est correct ? où faut il que je mette mes arguments dans $commande ?

Bon aprés plusieurs essais voilà ce que j'obtiens :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 C:\Users\jawhar\Desktop>perl GUIv15.pl chemin(s) invalide(s): Seuls les dossiers sont acceptes! Tk::Error: Undefined subroutine &main::commande1 called at C:/Perl64/site/lib/Tk .pm line 251. Tk callback for .notebook.cr_ation_des_donn_es.button4 Tk::__ANON__ at C:/Perl64/site/lib/Tk.pm line 251 Tk::Button::butUp at C:/Perl64/site/lib/Tk/Button.pm line 175 <ButtonRelease-1> (command bound to event)
Et petite question, pour les chemins il faut des \ obligatoirement ? Parce que le chemin obtenus avec FileSelect contient des /...

29/03/2014, 09h11
djibril

Citation:

Envoyé par jagtheboss

Et petite question, pour les chemins il faut des \ obligatoirement ? Parce que le chemin obtenus avec FileSelect contient des /...

non

Du coup j'arrvives pas à lancer mes programmes via les boutons, je comprends pas pk .... voilà le code utilisé pr le moment :

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
my$b5=$onglet1->Button
	( 
	-text => 'LANCER L\'ETAPE 1 !', 
	#-command => [\&ma_fonction, $arg1, $arg2...],.
	-command => sub 
		{ 
 
 
#programme là ?
print "test du lancement 1. \n";
print "doss 1 : $file_se1 \n";
print "doss 2 : $file_se2 \n";
print "doss 3 : $file_se3 \n";
print "doss 4 : $file_se4 \n";
 
		}, 
 
    -command => [\&commande1], 
	)->pack( qw/ -side left/ ); 
&bind_message($b5, "Cliquez pour lancer le match.");
$b5->grid(-row => 4, -column => 3, );
 
	my $commande1 = 'perl sprojet.pl $file_se1, $file_se2, $file_se3'; 
system($commande1) == 0 or die "Erreur de la commande : $commande1\n";

j'ai testé avec les arguments dans $commande1 et dans son appel au niveau du bouton, mais aucune des deux propositions ne marche... =( je désespère...

29/03/2014, 20h55
Lolo78

Citation:

Envoyé par jagtheboss

je voulais savoir comment choisir entre un -command => sub { ... }, et -command => [\&ma_fonction, $arg1, $arg2...],. Le second me semble le plus adapté, je me trompe ? Et pourquoi ?

La première syntaxe définit sur place (dans les accolades) une référence vers le code à exécuter. Le seconde prend une référence vers un tableau contenant en premier lieu une référence vers la fonction à exécuter (qui doit être définie ailleurs) et les arguments à utiliser. Mais, bien que je n'aie pas utilisé TK depuis des années, je suis à peu près sûr que tu pourrais aussi faire quelque chose comme:

Code:

-command => [sub { ... }, $arg1, $arg2...]

ou également:

Code:

-command => \&ma_fonction,

Tout dépend donc de ce dont tu as besoin.

Citation:

Envoyé par jagtheboss

Ensuite, je suis pas sure de comprendre la différence entre system(ma commande) et exec ("ma commande")

system() exécute la commande et attend la fin de l'exécution de la commande pour reprendre l'exécution du script Perl là où il était arrivé, alors qu'exec() lance la commande (et attend la fin du script) mais ne revient jamais dans le script.
29/03/2014, 21h17
jagtheboss

Merci pour ta réponse, donc un exec() est plus adapté car le script tourne normalement indépendamment de l'interface. Et du coup, je ne comprends pas pourquoi cela ne fonctionne pas, alors qu'en ligne de commande le programme tourne et est lancé via la commande :

Code:

perl sprojet.pl $file_se1, $file_se2, $file_se3

avec les adresses des dossiers à la place des $file_se. Je ne comprends pas le message d'erreur obtenus... J'ai l'impression qu'il me dis qu'il y a un soucis lorsque le bouton est relâché...
Et avec exec, il semble vouloir lancer directement mon sous programme au lancement de l'interface...
30/03/2014, 17h26
jagtheboss

Du coup personne peut m'aider pour le bouton de lancement ? Je n'y arrives pas et je ne comprends pas comment faire... les tutos et les guides ne m'ont pas aidés... Je cherche encore, et l'ultimatum approches, je sens que je vais pas bcp dormir ce soir ... =( :calim2:
30/03/2014, 17h56
djibril

Lolo78 t'as donné une explication claire, mon premier programme posté te montre comment bien écrire. On ne va pas faire ton devoir à ta place.
Et puis, c'est bien gentil, mais je trouve cela un peu limite de devoir faire une petite application alors que tu n'y connais rien en programmation, en Perl et ensuite en interface graphique. De plus, jouer entre Perl et un autre langage qui est le R.
Donc devoir bricoler de gauche à droite, cela a un peu ses limites ;).
30/03/2014, 19h47
jagtheboss

Quand vous me dites que j'ai tout ce qu'il faut pour le faire, je vous crois, mais le soucis est que je n'y arrives pas, j'ai testé plein de codes, plein de possibilités, et ça ne marches toujours pas... Je n'obtiens que des messages d'erreur obscurs à mes yeux...

Le pire c'est que ce n'est même pas un devoir à faire, c'est juste une amélioration du travail demandé, j'ai choisi Tk parce qu'il se rapproches de perl que j'ai vu vite fait en cours. Je ne dirais pas que je n'y connais rien en programmation, mais plutôt que je débute. Je suis en licence pro bioinformatique, et la formation est naze car on ne voit pas grand chose. On ne voit même pas Java ou le C++...

Enfin, je ne pensais pas que ce serrai si compliquer de lancer un script externe via l'envoie d'une ligne de commande par l'interface, donc j'avoue que ça à été une erreur... Mais au point où j'en suis, il ne me manques plus que ça... Un bouton qui lance une ligne de commande de terminal... Je pensais que si c'était possible de les lancer en ligne de commande, alors l'interface devais pouvoir le faire, avec un déclenchement sur clic...

J'ai juste envie de laisser tomber tellement ça me soûle en fin de compte, quitte a me ramasser une boite coeff 10. De toute façon leur formation vaut rien... Et de toute façon les diplômes français n'ont plus de valeur... Autant être autodidacte... :arf::arf::help:

Le pire c'est que j'ai beau chercher, je trouve même pas un exemple de bouton qui lance une commande du genre de ce que je cherche... C'est pas possible que ça n'existe pas, donc je sais pas chercher...
30/03/2014, 19h56
djibril

Tout de suite les grandes critiques.
Lorsque que l'on s'autoforme, on cherche par soi même et on consulte les forums. Par contre, on tient aussi compte des remarques que l'on peut te donner.

Lolo et moi t'avons donné deux exemples clairs, à toi déjà de l'appliquer et de nous montrer ce que tu as fait. Si tu n'es pas capable d'appliquer nos recommandations, ce sera difficile d'aller plus loin.
30/03/2014, 20h32
jagtheboss
J'essaie sincèrement de tenir compte de vos remarques... Bin c'est sur que pour vous c'est clair, mais moi je suis perdu... Vous voulez que je vous mettes tout ce que j'ai testé ?

Code:

[...]-command => sub { exec(perl sprojet.pl, $file_se1,$file_se2,$file_se3;)},[...]
Code:

1 2 3 [...]-command => [\&commande1,$file_se1, $file_se2, $file_se3],[...] my $commande1 = 'perl sprojet.pl'; exec($commande1) == 0 or die "Erreur de la commande : $commande1\n";[...]
Code:

1 2 3 [...]-command => [\&commande1],[...] my $commande1 = 'perl sprojet.pl $file_se1 $file_se2 $file_se3'; exec($commande1) == 0 or die "Erreur de la commande : $commande1\n";[...]
Je ne me souviens plus des autres codes que j'ai testé, mais j'y ai perdu beaucoup de cheveux...
30/03/2014, 20h35
djibril

ton code !
30/03/2014, 23h36
Lolo78

Hmm, c'est comme ça, la vie d'ingénieur. Il y a beaucoup de sujets pour lesquels je peux chercher de l'aide auprès de collègues qui les connaissent mieux que moi. Et il y en a d'autres (dont le langage Perl) pour lesquels c'est moi le référent technique ou fonctionnel de mon département. Et là, c'est à moi qu'on demande... Le plus souvent, j'ai la solution plus ou moins facilement, je connais (encore vendredi dernier, j'ai résolu le problème d'un collègue entre 17h00 et 17h40), mais parfois, il faut vraiment que je me creuse la cervelle et que je teste des solutions, et je n'ai personne pour assurer mes arrières. C'est à moi de trouver la solution, et personne d'autre. Dans ces cas-là (heureusement assez peu fréquents), je suis vraiment tout seul et je galère. Mais c'est aussi parce que je ne baisse pas les bras dans ces cas-là que l'on m'apprécie et c'est d'ailleurs pour la même raison que j'ai fini par devenir l'expert que l'on consulte: à force de me cogner de nouveaux problèmes et de trouver les moyens de les résoudre, j'ai acquis des compétences plus ou moins uniques. Il y a même deux ou trois sujets complexes pour lesquels je suis reconnu comme étant juste LE meilleur expert. Ce qui me permet de gagner assez confortablement ma vie en qualité de consultant indépendant.

Donc, je dirais: cesse de te plaindre, critiquer le système de formation est peut-être justifié, mais ne t'avancera pas, c'est en galérant que tu deviendras bon, peut-être même le meilleur. Voilà, c'est un défi, il y a de quoi avoir peur, mais c'est à toi de voir comment tu vas le traiter.

Hum, en relisant mon message, je me dis que j'ai peut-être l'air de me poser en "donneur de leçon". Je t'assure que ce n'est pas mon état d'esprit. Je comprends tes difficultés et ai essayé de t'aider dans la mesure de mes moyens, mais ne peux pas t'aider sur TK que je n'ai pas utilisé depuis environ 12 ans. Et, à un certain point, il n'y a pas photo: c'est au pied du mur que l'on voit le maçon.
31/03/2014, 00h36
djibril

+1 Lolo78

Pour Perl/Tk, je pense être bien placé pour t'aider ici, tu n'as qu'à lire la documentation ou les postes sur ce site. Mais ce genre d'approche ne me donne pas envie de t'aider. Relit donc mes posts, essaye quelque chose et propose et ensuite, on t'aidera.

Bon courage !

Ok, repartons sur de bonnes bases. Voilà un code uniquement pour le bouton.

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
use Tk;
 
my $fenetre_principale = MainWindow->new( );
$fenetre_principale->minsize ( 200, 200);
 
 
my$b5=$fenetre_principale->Button( -text => 'LANCER L\'ETAPE 1 !',-command => sub 
		{ 
 
system('perl sprojet.pl', 'C:\Users\jawhar\Desktop\1_reads', 'C:\Users\jawhar\Desktop\1_megt', 'C:\Users\jawhar\Desktop\1_sortie');
		print 'test';
		}, )->pack( qw //); 
 
my $fene1 = $fenetre_principale->Frame(-height => 30,-bg     => '#00007f3b0000',)->grid(-row => 0, -column => 1,-rowspan => 1, -sticky => 'nsew');
	$fene1->pack( qw/ -fill both -expand 0/ );
 
 
#stdout en fenetre
my $term = $fene1->Text(-height=> 10,-wrap=> "none",-relief     => "solid",)->pack(-fill => "both", -expand => 1);  
 tie *STDOUT, ref $term, $term;
 
MainLoop;

Voilà mon code pour le moment. et j'ai ça comme message d'erreur :

Code:

1
2
3
4
5
 
C:\Users\jawhar\Desktop>perl testb.pl
Unquoted string "perl" may clash with future reserved word at testb.pl line 13.
Name "main::perl" used only once: possible typo at testb.pl line 13.
Can't spawn "cmd.exe": No such file or directory at testb.pl line 13.

Je continuerais de tester des possibilités demain, la j'en peu plus. Il est clairement pas content de ma ligne

Code:

system('perl sprojet.pl', 'C:\Users\jawhar\Desktop\1_reads', 'C:\Users\jawhar\Desktop\1_megt', 'C:\Users\jawhar\Desktop\1_sortie');

Tu ne peux pas utiliser le gestionnaire d'espace pack et grid sur le même objet :

Code:

1
2
3
4
5
my $fene1 = $fenetre_principale->Frame(
	-height => 30,
	-bg     => '#00007f3b0000',
)->grid( -row => 0, -column => 1, -rowspan => 1, -sticky => 'nsew' );
$fene1->pack(qw/ -fill both -expand 0/);

Pour lancer une commande, tu peux tout mettre dans une chaine.

Bon voici un petit deuxième code :

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
use Tk;
 
my $fenetre_principale = MainWindow->new();
$fenetre_principale->minsize( 200, 200 );
 
my $fene1 = $fenetre_principale->Frame(
	-height => 30,
	-bg     => '#00007f3b0000',
);
 
my $term = $fene1->Text( 
	-height => 10, 
	-wrap => "none", 
	-relief => "solid", 
);
 
my $b5 = $fenetre_principale->Button(
	-text    => "LANCER L'ETAPE 1 !",
	-command => [\&lancement_projet1, $term],
);
 
# Gestionnaire d'espace
$b5->pack;
$term->pack( -fill => "both", -expand => 1 );
$fene1->pack(qw/ -fill both -expand 0/);
 
MainLoop;
 
sub lancement_projet1 {
	my ($widget_texte) = @_;
 
	$widget_texte->insert('end', "Lancement projet 1\n"); 
	my $commande = "dir \"C:/Documents and Settings\"";
	$widget_texte->insert('end', "Lancement de la commande : $commande\n"); 
	$widget_texte->insert('end', `$commande`); 
}

02/04/2014, 13h18
jagtheboss

Bonjour, excusez moi pour le retard de réponse, j'ai eu un soucis et j'ai planté mon windows... Il relance explorer.exe en chaine... J'ai donc recréé un windows pr finir mon travail, je réparerais ça plus tard...

Du coup je viens de comprendre le principal problème que j'avais. Je n'avais pas compris l'importance du placement vis à vis de MainLoop:, ce qui m'handicapais pas mal au final... Du coup en m'inspirant de votre code j'ai réussit à le faire marcher, merci. Par contre j'ai deux petits soucis.
- L'affichage n'as lieu qu'aprés l'exécution totale du script. Avec mon "tie STDOUT" je crois que je peux le rendre dynamique, je me trompes ?
- Et second soucis, je n'ai qu'un affichage d'une ligne sur deux, qu'est ce qui peut l'expliquer? (Je vous envoie le script qui fonctionne dés que je serrais rentré.

Ah et du coup vu que ce n'était pas obligatoire dans mon projet, j'ai la semaine pour le finir tranquillement, l'idéal étant que je l'eusse fini de telle sorte à pouvoir le présenter vendredi matin...