Liaison BDD via fichier

Bonjour

Suite à une demande d'utilisateurs, pour une appli web java, j'ai essayé de faire un déploiement sur 2 PC, donc 2 serveurs le tout pointant sur une bdd implantée sur un serveur réseau via un fichier sympathique.
La configuration des 2 pc et identique.
Au démarrage de chaque serveur web j'ai bien une connexion ok à la bdd et lorsque je veux me loguer à l'appli tout est ok.
Si je démarre les 2 serveurs web, la connexion à la bdd est ok mais pour je ne peux pas me loguer (les logues de connexion sont enregistrés en bdd)
En examinant le contenu du répertoire de la bdd, une partie de certaines tables disparaissent: les .MYD et .MYI (toujours les mêmes et en l'occurrence celle de logues)

Auriez vous une petite idée du pb ?