doxygen créer documentation eclipse

Bonjour,

j'utilise doxygen pour créer la documentation de mes projets mais mon problème c'est que je ne pe pas faire de documentation sur plusieurs projets. Je m'explique: j'ai deux projets ouvert dans eclipse, j'ai pu générer la documentation du premier que je fait ressortir dans le répertoire de celui-ci mais pour le second projet je ne peux pas. Comment faire pour créer de la documentation pour chaque projet et pour qu'elle ressorte dans chacun d'entres eux?

Merci de votre aide