webapp avec ensemble du contenu visible dans l'application

Bonjour à tous,

Je souhaite actuellement mettre en place une webapp mobile permettant de charger via le manifest les fichiers de notre site réalisé en html5/php (responsive).
En surf mobile avec un smartphone ou une tablette, la détection s'effectue bien, il est ensuite possible de créer l'application sur l'écran d'accueil.
Une fois que l'on lance l'application, plusieurs pages sont accessible, cependant toutes celles faisant appel à de la réécriture d'URL ne sont pas accessible :
Elles renvoient vers les URL du site avec ouverture du navigateur.

Comment faire pour tout ouvrir dans la webapp et arrêter les appels et ouvertures dans le navigateur ?

Merci pour votre aide !

Fabrice.