Récupération des données à l'aide de fread et fseek

Bonjour à tous,

C'est encore moi ! J'ai à présent un problème un peu plus subtile que je souhaiterais résoudre. Je suis en train d'écrire une fonction qui est chargée de récupérer des données à l'aide de fread mais seulement entre certaines bornes prédéfinies. J'ai écrit un code qui fonctionne mais je ne suis pas sûr de récupérer effectivement les données au bon endroit.

Je m'explique, voici d'abord le code simplifié et les commentaires juste après :

Code:

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function X=lire_50(repertoire,debut,fin) debut=(1 + 50*(debut-1)); fin=50*fin; nomfichier0=strcat('C:\MATLAB701\work\IMP\DATA\',repertoire,'\',repertoire,'-50\','Imp1.int'); fid0=fopen(nomfichier0); fseek(fid0,2*debut,'bof'); valeurs_Imp1=fread(fid0,(fin-debut),'short');

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Cette fonction prend en paramètre un certain répertoire et des nombres début et fin. Dans la fonction je calcule de nouvelles valeurs entre début et fin, par exemple disons que j'ai debut=1000 et fin=2000. Ensuite, je recherche un répertoire à l'aide du strcat qui contient des données que je veux exploiter depuis un fichier .int (peu importe le format .int, j'ai simplement des données stockées dedans qu'il me faut récupérer). Je l'ouvre (fopen) puis à l'aide du fseek et de fread je voudrais simplement lire ce .int entre debut et fin.

Il se trouve que tel que j'ai écris ces lignes, le code fonctionne mais ne semble pas lire les vraies données. Sans le fseek, cela marche aussi mais ce qui est dans valeurs_Imp1 est clairement faux. En effet si je rajoute une ligne valeurs_Imp1_bis=fread(fid0,'short') et qu'ensuite je fais quelque chose comme valeurs_Imp1_bis(debut:fin) je n'obtiens pas les mêmes résultats qu'en intégrant directement fin-debut dans le fread. Bref le problème vient sans doute du fseek et de l'usage du 'short' dans le fread dont je ne peux pas me passer dans le contexte.

Bref, pour résumer c'est assez simple : il faut imaginer que dans le .int j'ai une colonne de données et que je cherche à récupérer seulement ces données entre début et fin, moyennant les problèmes induits par 'short'. J'ai besoin de faire ceci car la fonction va être appelée une bonne centaine de fois
et je voudrais m'éviter de récupérer toutes les données dans valeurs_Imp1 (il y a des millions de nombres dans les .int) mais seulement ce qui nécessaire entre début et fin à chaque fois.

Entre temps j'ai effectué des tests afin de voir ce qui pose problème dans le code. A priori c'est bien le fseek qui est en cause. En effet :

D'abord ceci :

Code:

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function X=lire_50(repertoire,debut,fin) nomfichier0=strcat('C:\MATLAB701\work\IMP\DATA\',repertoire,'\',repertoire,'-50\','Imp1.int'); fid0=fopen(nomfichier0); valeurs_Imp1=fread(fid1,'short'); valeurs_Imp1bis=valeurs_Imp1(debut:fin);

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Ceci donne les bonnes valeurs entre debut et fin que j'attends mais je lis toutes les valeurs avec le fread puis je sélectionne celle entre les deux bornes mais justement je voudrais éviter d'avoir à lire toutes les données d'abord.

Ensuite ceci :

Code:

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function X=lire_50(repertoire,debut,fin) nomfichier0=strcat('C:\MATLAB701\work\IMP\DATA\',repertoire,'\',repertoire,'-50\','Imp1.int'); fid0=fopen(nomfichier0); valeurs_Imp1=fread(fid0,(fin-debut+1),'short');

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Cette variante ne marche pas : j'obtiens certes des valeurs dans valeurs_Imp1 mais je ne sais pas exactement desquelles il s'agit, en tout cas pas de celles entre debut et fin.

Enfin la dernière varainte en ajoutant fseek :

Code:

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function X=lire_50(repertoire,debut,fin) nomfichier0=strcat('C:\MATLAB701\work\IMP\DATA\',repertoire,'\',repertoire,'-50\','Imp1.int'); fid0=fopen(nomfichier0); fseek(fid0,2*debut,'bof'); valeurs_Imp1=fread(fid0,(fin-debut),'short');

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Cela ne marche pas tout à fait et je ne comprends pas pourquoi : en gros au lieu d'obtenir les résultats entre debut et fin, je les obtiens entre debut+1 et fin et il manque donc la première valeur. Rien n'y fait, que je fasse fin-(debut-1) ou autres combinaisons ce décalage reste le même. Que faire ?

EDIT:

En fait en mettant

Code:

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fseek(fid0,2*(debut-1),'bof');

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Il semble qu'après plusieurs tests j'obtienne bien les résultats escomptés. Malgré tout je crois que je ne comprends pas bien le fonctionnement de fseek car je serai incapable de dire pourquoi la lecture s'effectue bien comme je le voudrais. De plus il y a quelque chose que j'ignore : admettons que le segment [debut:fin] soit en dehors des valeurs de valeurs_Imp1 : par exemple valeurs_Imp1 possède 1000 élément et je demande debut=900 et fin=2000, va-t-il me renvoyer valeurs_Imp1 entre 900 et 1000 ?

Pour lire des fichiers binaires (avec fread et fseek) il faut connaitre le format des données qui y sont écrites.

Si je comprends bien, chaque fichier est simplement constitué d'une suite de valeurs numériques. Avec quelle précision sont-elles écrites ? Voir la documentation de la fonction fread

Oui Dut, merci, c'est bien ce format qui joue. Et bien, pour résumé, déjà le code que j'ai mis dans le edit fonctionne bien mais j'ai l'impression d'être "chanceux".

Ensuite voici comment j'ai procédé dès le départ : au départ, j’ai un fichier .CSV que je lis d'une certaine manière avec un autre programme que celui dont je parle ici et je stocke dans des .int les données qui m'intéresse dedans.

Code:

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fwrite(fid0,S2(1),'short');

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fid0 est le fichier .int à créer et S2(1) ce qui m'intéressait dans le .CSV et que j'écris donc dans ce .int, à savoir un vecteur colonne en l'occurence. Et c'est tout. Ensuite je peux passer directement à la lecture comme je viens de le faire :

Code:

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function X=lire_50(repertoire,debut,fin) nomfichier0=strcat('C:\MATLAB701\work\IMP\DATA\',repertoire,'\',repertoire,'-50\','Imp1.int'); fid0=fopen(nomfichier0); fseek(fid0,2*(debut-1),'bof'); valeurs_Imp1=fread(fid0,(fin-debut),'short');

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En mettant bien debut-1 dans le fseek et fin-debut dans le fread, je lis effectivement le contenu du .int entre les bornes debut et fin comme je le voulais. Si je ne mets pas 2*(debut-1) cela ne marche pas évidemment. Bref, je ne comprends pas très bien pourquoi mais bon.

Tu es obligé de multiplier par 2 car fseek prend comme argument une position en octets et que les valeurs dans le fichier sont codées en short donc sur 2 octets.

Pour le début-1, c'est logique puisque la valeur doit correspondre à la position du curseur dans le fichier avant lecture.

Si tu veux lire la première valeur du fichier, il faut faire :

Code:

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fseek(fid,0,'bof')

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Si tu veux lire la deuxième valeur du fichier, il faut faire :

Code:

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fseek(fid,2,'bof')

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Si tu veux lire la troisième valeur du fichier, il faut faire :

Code:

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fseek(fid,4,'bof')

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...

D'accord, pour le 2 je pensais également avoir compris : short correspond à 16 bits d'après l'aide ici http://www.mathworks.fr/fr/help/matlab/ref/fread.html et comme tu dis que fseek travaille sur 1 octet=8Bits, on multiplie donc bien par 2.

Ensuite, si je comprends bien la position "0" existe dans fseek et indique le curseur afin d'arriver sur la position "1", début de la lecture. Ceci me trouble car en Matlab je ne crois pas qu'il existe d'indice 0, par exemple sur un vecteur X(0) renvoie une erreur. Est-ce donc ici une sorte d'exception ? Le comportement semble similaire à un pointeur qui se place où on le souhaite dans le fichier à lire et qui aurait une position "0" que je qualifierait de "position par défaut" hors pointage.

C'est écrit dans la documentation :

Citation:

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offset : Number of bytes to move from origin. Can be positive, negative, or zero. The n bytes of a given file are in positions 0 through n-1.

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Pour se placer au début du fichier, il faut bien dire à MATLAB de se déplacer avec fseek de 0 octet, non ?