awk et parcours de tableau (illegal reference to variable)

Bonjour, je bloque sur un message d'erreur concernant awk et le parcourt d'un tableau.

J'ai un fichier qui contient les lignes suivantes :

Code:

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1 2 3 4 5 6

>AFG01-PJ0 TGTACAAGACCCAACAACAACACAAGAAAAAGTATACATATAGGACCAGGAAGAGCA TTTTCTGCAACAGGACAAATAATAGGAAAGATAAGAGAAGCACACTGT >AFG02-M93 TGTACAAGACCCAACAACAACACAAGAAAAAGTATACATATAGGACCAGGAAGAGCA TTTTATGCAACAGGAGAAATAATAGGAAACGTAAGAGAAGCACATTGT

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Le séparateur de champs du fichier est -

voici mon script awk :

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

#! /bin/bash   nbStades=3 tabStade=('PJ0' 'M93' 'M156')   awk -F"-" -v nbStades="$nbStades" -v tab="${tabStade[*]}" '{ if($1 ~ /^>/) { print nbStades print tab for (x in tab) {print "Valeur tab : " x} } }' $1

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Lorsque j'exécute ce code avec mon fichier en argument, j'obtiens l'erreur suivante :

Code:

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awk: line 5: illegal reference to variable tab

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Et dans le cas où je supprime la ligne 10 (boucle for), mon script s'exécute correctement :

Code:

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1 2 3 4

3 PJ0 M93 M156 3 PJ0 M93 M156

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Mon tableau tabStade est donc bien déclaré dans la variable tab.
Quelqu'un voit il mon erreur, merci?

Je crois que tu confonds 2 méthode d'utilisation des tableaux.

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13

echo "Methode 1" tabStade=('PJ0' 'M93' 'M156') for ((i=0; i <${#tabStade[*]}; i++)) do echo "Valeur tab: " ${tabStade[$i]} done   echo "Methode 2" tabStade="PJ0 M93 M156" for i in $tabStade do echo "Valeur tab: " $i done

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Je regarde comment corriger ton awk ;)

Bonjour,

C'est surtout que tab n'est pas un tableau:

Code:

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1 2 3 4

$ tabStade=('PJ0' 'M93' 'M156') $ echo toto | awk -v tab="${tabStade[*]}" '{print tab[1]}' awk: {print tab[1]} awk: ^ use of non-array as array

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Bonjour,

Citation:

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Envoyé par Mesmeraf

Mon tableau tabStade est donc bien déclaré dans la variable tab.

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:aie:


ecatomb:

Code:

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1 2 3

echo "méthode #3" tableau=('PJ0' 'M93' 'M156') for i in "${tableau[@]}"; do echo "$i"; done

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;)

Euh, on m'a interrompu sur ma lancé, donc si tu veux traiter sous un tableau, voici un exemple:

Code:

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1 2	$ echo toto | awk -v vtmp="${tabStade[*]}" '{split(vtmp,tab) ; print tab[3]}' M156

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ou (avec le séparateur du split):

Code:

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1 2	$ echo toto | awk -v vtmp="${tabStade[*]}" '{split(vtmp,tab," ") ; print tab[3]}' M156

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N_BaH: Tricheur :p

Et pourquoi pas:

Code:

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1 2	echo "méthode #4" for i in "PJ0' 'M93' 'M156'"; do echo "$i"; done

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:aie:

Bon sinon j'ai du mal avec son awk...
Pas trouvé comment passer un tableau dans le awk ou l'initialiser en une seule fois ... pas taper svp ...

Voici ce que je propose :

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13

awk -F"-" -v nbStades="$nbStades" '{ BEGIN { print nbStades tab[0]="PJ0" tab[1]="M93" tab[2]="M156" }   if($1 ~ /^>/) { for (x in tab) {print "Valeur tab : " tab[x]} } }' $1

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Merci à tous les 3 pour la rapidité de vos réponses :ccool:

Je ne connaissais pas la fonction split() de awk, du coup j'ai pu l'utiliser avec succès à défaut de pouvoir intégrer un tableau comme variable externe dans awk.

Mon code donne ceci :

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

#! /bin/bash   nbStades=3 tabStade=('PJ0' 'M93' 'M156')   awk -F"-" -v nbStades="$nbStades" -v vtmp="${tabStade[*]}" '{ split(vtmp,tab," ") if($1 ~ /^>/) { print nbStades for (x in tab) {print "Valeur tab : " tab[x]} } }' $1

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et j'obtiens bien :

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8

3 Valeur tab : PJ0 Valeur tab : M93 Valeur tab : M156 3 Valeur tab : PJ0 Valeur tab : M93 Valeur tab : M156

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ça m'a permis également de remettre les choses au clair sur les tableaux en Shell que je ne maîtrisais pas vraiment :oops:

le tableau devrait n'être déclaré (split() donc) qu'une seule fois dans BEGIN.