Problème summary d'une anova

Bonjour à tous,

après avoir fait une régression linéaire multivariée, je souhaite pouvoir additionner les coefficients de chacunes de ces variables. Lorsque je fais le summary de ma régression linéaire (appelons la res.lm) soit summary(res.lm) :

le résultat que j'obtiens me donne l'intercept (je ne sais pas ce que signifie réellement l'intercept, j'ai cru comprendre que c'était le premier point par rapport à l'origine mais je ne vois pas vraiment ce que ça signifie), puis j'ai les résultats pour les différentes variables de ma régression . Le problème est que je n'ai pas toutes les modalités pour chaque variable :

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13

Coefficients: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) (Intercept) -5.037811 0.470745 -10.702 < 2e-16 *** PrécédentClasse 2 (risque modéré) 0.666295 0.429581 1.551 0.12297 PrécédentClasse 3 (risque élevé) 1.625639 0.774259 2.100 0.03742 * PrécédentClasse 4 (risque très élevé) 1.428841 0.302544 4.723 5.25e-06 *** WsolSEMIS DIRECT 1.591007 0.642596 2.476 0.01439 * WsolTCS 0.773452 0.284668 2.717 0.00735 ** SensibilitéVClasse 2 -0.078399 0.385679 -0.203 0.83919 SensibilitéVClasse 3 -0.440350 0.312829 -1.408 0.16128 LABOMYCSA 0.839812 0.435438 1.929 0.05564 . TraitementOUI -0.016168 0.267702 -0.060 0.95192 sPluieFlo 0.001490 0.006447 0.231 0.81757

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par exemple pour ma variable appelée "Wsol" j'ai le résultat de "SEMIS DIRECT", le résultat de "TCS", mais normalement je devrais avoir une autre modalité (qui s'appelle "LABOUR") qui n’apparaît pas ... Comment faire pour l'obtenir ?

Je suppose que ça a un lien avec l'intercept mais vu que je ne sais pas à quoi lui même il correspond ....

Merci pour votre aide

Bonjour,

Le problème ici n'est pas un problème de R mais plutôt de statistiques ;)

Je vous conseille donc de reprendre vos cours ou de regarder un peu de docs sur la méthode de l'ANOVA, notamment sur les différents paramètres qui composent le modèle.

Quelques infos cependant :

• Le paramètre "intercept" obtenu en sortie de R correpond à la constante du modèle d'anova.
• La variable "Wsol" qui est une variable qualitative à 3 modalités (d'après votre message) n'entraine la création que de 2 paramètres dans le modèle car une des modalités (ici la modalite "LABOUR", mais cela peut être spécifié dans R) est prise comme modalité de référence, afin d'assurer un nombre de degrés de liberté correct au modèle.

Bonne continuation et n'hésitez par à revenir avec des questions plus précises une fois que vous aurez déblayer le côté stats de la chose :)


Cordialement,


A.D.

Dois je comprendre que R prends pour valeur de référence la constante "intercept" ?
Ou est ce que ma modalité prise comme valeur de référence est considérée comme 0 ?

Merci

Salut,

Citation:

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Envoyé par Fnouch

Dois je comprendre que R prends pour valeur de référence la constante "intercept" ?

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Non, l'intercept est une constante qui s'ajoute à la somme des coefficients*variables quelque soit la modalité de ces dernières.

Citation:

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Ou est ce que ma modalité prise comme valeur de référence est considérée comme 0 ?

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Oui c'est ca.
La modalité de réference d'une variable est prise comme ayant un effet neutre (+0 dans la somme), et c'est à cette référence que tu peux comparer l'effet des autres modalités de la variable.

D'accord. Apparemment, R choisit la modalité de référence par ordre alphabétique ...
Mon objectif était d'additionner les coefficients des modalités selon différentes combinaisons de modalités, donc il me faut tous les coefficients de toutes les modalités... Mais j'ai bien l'impression que c'est impossible

Bonjour,

A mon avis, il faut avant tout que vous parveniez à déterminer précisément ce que vous souhaitez faire / obtenir comme résultats et ensuite décider de la méthode / du modèle à utiliser. Après, je pense que R peut faire à peu près n'importe quoi (dans le cas de modèles linéaires du moins ^^).

En effet, avec par exemple le paramètre "contrasts" de la fonction lm, vous pouvez jouer sur la forme du modèle et donc les types de paramètres obtenus en sortie.
Vous pouvez également choisir un modèle sans intercept en écrivant dans R une formule de la forme : lm( y ~ x - 1, data ) .

Le problème principal ici est donc, je pense, de déterminer précisément ce que vous souhaitez fair (en terme statistiques), et ensuite nous pourrons peut-être vous conseiller sur comment l'appliquer avec le logiciel R.


Bonne continuation :)


Cordialement,


A.D.

je voulais additionner des coefficients selon certaines combinaisons agronomiques de façon à les comparer à un indice de risque préalablement établi ...

Pour résoudre ce problème de modalité qui n’apparaît pas je pense qu'il faudrait que je crée une boucle pour que pour chacune de mes variables soient crée une variable par modalité. Pour reprendre l'exemple de la variable "Wsol" comportant 3 modalités : "LABOUR", "TCS", "SEMIS DIRECT". Il faudrait donc trois variables distinctes : "LABOUR", "TCS", "SEMIS DIRECT".


et ce, pour toutes les variables qui m’intéressent ...

Bonjour,

Je ne suis pas sûr que vous compreniez bien le fonctionnement d'un tel modèle.
En effet, il repose sur la résolution d'équations linéaires et doit donc avoir un nombre de degrés de liberté cohérent pour qu'il existe une unique solution. C'est pour cette raison que pour les variables qualitatives, on fixe une des modalités à zéro.
Le fait de créer une variable (codée en 0/1 j'imagine) pour chacune des modalités ne résoudra donc pas la problème.

Je pense qu'il faudrait que vous vous renseigniez sur la manière dont est construit l'indice de risque dont vous parlez.
Une piste peut-être, il arrive que dans certains cas, on "reconstruise" le coefficient pris comme référence comme étant l'opposé de la somme des autres coefficients.
Par exemple, avec LABOUR comme modalité de référence, cela donnerait :

Code:

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coeff(LABOUR) = - coeff(TCS) - coeff(SEMIS DIRECT)

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Après, c'est à vous de voir si c'est cohérent et également ce qui se fait dans votre domaine spécifique...

Bonne continuation :)


Cordialement,

A.D.