Nouveau et inculte - perl conflit

Bonjour à tous,
Avant de venir poster j'ai lu la FAQ et je n'ai malheureusement pas trouvé ma réponse. Même mon ami Google ne ma pas beaucoup aidé, sans doute parce que je formule mal ma question.

EXPLICATION
J'ai un serveur Windows 2008 R2, enfin mon entreprise :). Dessus j'ai deux soft qui embarque du PERL. Le premier en perl 5.12.0 et le second en 5.8.8.

Lorsque je lance une commande du soft cela pose problème et le support de ce même soft m'annonce que c'est à cause des deux version de perl installée.

Le souci c'est que je n'est pas la possibilité de désinstaller perl puisqu'il est embarqué sur chaque soft.


MA QUESTION
Comment faire pour désinstallé la version 5.8.8 de perl ou retirer le lien qui apparemment créé le souci avec l'application.


Je vous transmet ma question comme je le peux et avec mes mots à moi, si j'ai omis des détails n'hésitez pas à me les demander.

Par avance je vous remercie de vos réponses :)

Je doute que je puisse beaucoup t'aider, n'ayant pas utilisé Perl dans un environnement Windows depuis au moins 8 ans, mais juste une ou deux pistes possibles.

D'abord, si tu tapes "perl -v" )à la console, ça t'affiche quoi?

Ensuite, as-tu essayé de lancer Perl en utilisant le chemin complet, un truc du genre: "C:\Program Files\Oracle\Oracle10\bin\perl nom_de_programme.pl" (j'ai juste donné un chemin bidon parce que je me souviens qu'au boulot, j'ai Perl pour Windows installé sur mon poste en même temps que le client Oracle, mais le chemin est sans doute différent).

lorsque je lance la commande "perl -v" cela me donne la version 5.12.0.

Mais le souci apparemment c'est le fait que PERL est intégré à l'application.
En gros j'ai deux appli qui utilisent deux versions différentes de perl.

Les chemins respectifs sont du type : c:\[nom de l'appli]\bin\perl\