Gestion d'une variable absente dans un fichier netCDF

Bonjour à tous,

Je dois lire plusieurs milliers de fichiers netCDF contenant des variables 'Temperature', 'Salinité', etc.
Or il se peut qu'une variable soit absente dans un des fichiers.
Comment puis-je tester l'existence ou pas de cette variable avant d'exécuter la commande :

Code:

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varid= netcdf.inqVarID(ncid,'Temperature');

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?

Le message d'erreur obtenu est le suivant :

Code:

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1 2 3 4 5

??? Error using ==> netcdflib Library failure "NetCDF: Variable not found".   Error in ==> inqVarID at 22 varid = netcdflib('inqVarID', ncid, varname);

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Merci d'avance,

Salut Habasque,
à la lecture de la doc je ne vois pas de méthode permettant de tester l'existence d'une variable dans un netcdf, je pense donc que le plus simple est de passer par un try catch

Code:

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try varid= netcdf.inqVarID(ncid,'Temperature'); disp('Temperature ok'); catch e disp('Temperature absente'); end

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Je ne connais pas bien ces fonctions mais essaie ceci :

Code:

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S = ncinfo(...);   if any(strcmp({S.Variables.Name},'Temperature'))   varid = netcdf.inqVarID(ncid,'Temperature')   else   varid = [];   end

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Effectivement je passe par un Try Catch, je ne vois pas d'autres solutions pour le moment via les commandes de la librairie netcdf.

@DUT : je n'ai pas de commande ncinfo

Désolé

Voici une solution de contournement qui devrait fonctionner avec ta version de MATLAB (R2010b) :

Code:

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ncid = netcdf.open(...,'NC_NOWRITE');   [ndims,nvars] = netcdf.inq(ncid);   for n = 0:nvars varname{n} = netcdf.inqVar(ncid,n); end   if any(strcmp(varname,'Temperature')) ... end

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A tester

A vérifier, mais je pense que si tu dois lire plusieurs milliers de fichier, le try catch sera plus rapide que la lecture au préalable de toutes les variables de chaque fichier.

Les 2 solutions fonctionnent mais j'ai choisi d'utiliser Try Catch a priori plus rapide :

Code:

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try varid= netcdf.inqVarID(ncid,'Temperature'); % recuperation du numero d'id a partir du nom temperature=netcdf.getVar(ncid,varid); catch e ... end

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Merci à vous !