Somme par groupe

Version imprimable

04/12/2012, 10h37
hajarita

Somme par groupe

Bonjour je veux faire une requête à partir de cette table :

Sequence-Charge-Modification-Intensité-Replicat-Fraction-Analyse
Seq1-2-modif1-2.5-1-1-A
Seq1-2-modif1-3.5-1-2-A
Seq1-2-modif1-2.5-1-3-A
Seq1-2-modif1-0-2-1-A
Seq1-2-modif1-22.5-2-2-A
Seq1-2-modif1-12.5-2-3-A
Seq1-2-modif1-7-3-1-A
Seq1-2-modif1-5-3-2-A
Seq1-2-modif1-5.9-3-3-A
Seq1-2-modif1-29.5-1-1-B
Seq1-2-modif1-12.5-1-2-B
Seq1-2-modif1-22.5-1-3-B
Seq1-2-modif1-2.9-2-1-B
Seq1-2-modif1-7.4-2-2-B
Seq1-2-modif1-3.5-2-3-B
Seq1-2-modif1-0-3-1-B
Seq1-2-modif1-1.2-3-2-B
Seq1-2-modif1-7.7-3-3-B

Afin d’avoir un résultat comme ceci :

Sequence-Charge-Intensité dans A- Intensité dans B- Replicat
Seq1-2-modif1-8.5-64.5-1
Seq1-2-modif1-42-13.8-2
Seq1-2-modif1-17.9-8.9-3
Ou « Intensité dans A « sera la somme des intensité de toutes les Fraction par repliact dans l’analyse A et pour l’analyse B pareil

Merci d’avance
04/12/2012, 10h41
CinePhil

C'est une somme par groupage sur la colonne Fraction a priori.
Qu'as-tu essayé comme requête ?

Citation:

Envoyé par CinePhil

C'est une somme par groupage sur la colonne Fraction a priori.
Qu'as-tu essayé comme requête ?

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
 
 
SELECT a.`Sequence` AS `Sequence` , a.`Charge` AS `Charge`, a.`Modification` AS `Modification`, SUM(Aire) AS 'Intensite A',  SUM(Aire) AS 'Intensite B'
FROM Peptide a
INNER JOIN Peptide b ON a.SeqPeptide = b.SeqPeptide AND a.`Charge` = b.`Charge` AND a.`Modification` = b.`Modification` AND a.NumReplicat =  b.NumReplicat
AND b.NomAnalyse = '$NomAnalyse_A'
WHERE a.NomAnalyse = '$NomAnalyse_B'
ORDER BY NumReplicat

J'ai essayé cela mais ca ne marche pas

Voici ta requête remise en forme :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 SELECT a.`Sequence` AS `Sequence` , a.`Charge` AS `Charge`, a.`Modification` AS `Modification`, SUM(Aire) AS 'Intensite A', SUM(Aire) AS 'Intensite B' FROM Peptide a INNER JOIN Peptide b ON a.SeqPeptide = b.SeqPeptide AND a.`Charge` = b.`Charge` AND a.`Modification` = b.`Modification` AND a.NumReplicat = b.NumReplicat AND b.NomAnalyse = '$NomAnalyse_A' WHERE a.NomAnalyse = '$NomAnalyse_B' ORDER BY NumReplicat
1) Les 3 premiers alias 'Sequence', 'Charge' et 'Modification' sont inutiles puisque tu renommes ces colonnes avec le même nom ! 8O

2) Tu fais deux fois la même somme avec deux alias différents.
D'ailleurs, je ne sais pas comment le SGBD choisit entre les deux colonnes des deux instances de la table puisque tu n'as pas mis l'alias de la table en préfixe à la colonne aire dans ces sommes.
Au fait, cette colonne "aire" ne figurait pas dans ton premier message. Est-ce en fait la colonne que tu nommais "Intensite" ?

3) Tu as un mélange de colonnes et d'opérations de groupage (SUM) dans le SELECT et pas de GROUP BY. Ça ne peut pas fonctionner. :aie:

4) Tes colonnes étant correctement nommées, supprime ces saloperies d'apostrophes inversées inutiles !

5)

Citation:

ca ne marche pas

L'option boule de cristal étant désactivée sur DVP, merci d'expliquer ce qui "ne marche pas". Quels symptômes ?

6) Je pense que tu n'as pas besoin d'auto-jointure en utilisant CASE dans la somme.
Essaie comme ça :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 SELECT Sequence, Charge, Modification, NumReplicat, SUM( CASE WHEN NomAnalyse = 'A' THEN Aire ELSE 0 END ) AS Intensite_A, SUM( CASE WHEN NomAnalyse = 'B' THEN Aire ELSE 0 END ) AS Intensite_B FROM Peptide GROUP BY Sequence, Charge, Modification, NumReplicat

Citation:
Envoyé par CinePhil
Voici ta requête remise en forme :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 SELECT a.`Sequence` AS `Sequence` , a.`Charge` AS `Charge`, a.`Modification` AS `Modification`, SUM(Aire) AS 'Intensite A', SUM(Aire) AS 'Intensite B' FROM Peptide a INNER JOIN Peptide b ON a.SeqPeptide = b.SeqPeptide AND a.`Charge` = b.`Charge` AND a.`Modification` = b.`Modification` AND a.NumReplicat = b.NumReplicat AND b.NomAnalyse = '$NomAnalyse_A' WHERE a.NomAnalyse = '$NomAnalyse_B' ORDER BY NumReplicat
1) Les 3 premiers alias 'Sequence', 'Charge' et 'Modification' sont inutiles puisque tu renommes ces colonnes avec le même nom ! 8O

2) Tu fais deux fois la même somme avec deux alias différents.
D'ailleurs, je ne sais pas comment le SGBD choisit entre les deux colonnes des deux instances de la table puisque tu n'as pas mis l'alias de la table en préfixe à la colonne aire dans ces sommes.
Au fait, cette colonne "aire" ne figurait pas dans ton premier message. Est-ce en fait la colonne que tu nommais "Intensite" ?

3) Tu as un mélange de colonnes et d'opérations de groupage (SUM) dans le SELECT et pas de GROUP BY. Ça ne peut pas fonctionner. :aie:

4) Tes colonnes étant correctement nommées, supprime ces saloperies d'apostrophes inversées inutiles !

5)

L'option boule de cristal étant désactivée sur DVP, merci d'expliquer ce qui "ne marche pas". Quels symptômes ?

6) Je pense que tu n'as pas besoin d'auto-jointure en utilisant CASE dans la somme.
Essaie comme ça :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 SELECT Sequence, Charge, Modification, NumReplicat, SUM( CASE WHEN NomAnalyse = 'A' THEN Aire ELSE 0 END ) AS Intensite_A, SUM( CASE WHEN NomAnalyse = 'B' THEN Aire ELSE 0 END ) AS Intensite_B FROM Peptide GROUP BY Sequence, Charge, Modification, NumReplicat
Oui tout a fait Aire c'est l'Intensité,j'ai essayé ta requete ca marche :)

Et ,stp, si je veux qu'il m'affiche le resultat comme ceci :
Sequence-Charge-Intensité dans A- Intensité dans B
Seq1-2-modif1-8.5-64.5
Seq2-3-modif2-42-13.8
Seq3-1-modif3-17.9-8.9

ou l'intensité dans A est La moyenne des intensité des 3 replicat(dont l'intensité est la somme de l'intensité des fractions)

Car à la fain je dois calculer le ratio qui est "intensité dans A"/ "intensité dans B"/

Citation:

Envoyé par hajarita

Et ,stp, si je veux qu'il m'affiche le resultat comme ceci :
Sequence-Charge-Intensité dans A- Intensité dans B
Seq1-2-modif1-8.5-64.5
Seq2-3-modif2-42-13.8
Seq3-1-modif3-17.9-8.9

ou l'intensité dans A est La moyenne des intensité des 3 replicat(dont l'intensité est la somme de l'intensité des fractions)

Car à la fin je dois calculer le ratio qui est "intensité dans A"/ "intensité dans B"/

Attention à la pertinence des résultats !
Le ratio d'une moyenne, c'est bizarre !

De même, pour le moment, tu as la somme par Sequence, Charge, Modification, NumReplicat. Ce que tu demandes maintenant semble être la moyenne par Sequence, Charge, Modification.
C'est ça ?
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 SELECT Sequence, Charge, Modification, AVG( CASE WHEN NomAnalyse = 'A' THEN Aire END ) AS Intensite_A, AVG( CASE WHEN NomAnalyse = 'B' THEN Aire END ) AS Intensite_B FROM Peptide GROUP BY Sequence, Charge, Modification

Citation:
Envoyé par CinePhil
Attention à la pertinence des résultats !
Le ratio d'une moyenne, c'est bizarre !

De même, pour le moment, tu as la somme par Sequence, Charge, Modification, NumReplicat. Ce que tu demandes maintenant semble être la moyenne par Sequence, Charge, Modification.
C'est ça ?
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 SELECT Sequence, Charge, Modification, AVG( CASE WHEN NomAnalyse = 'A' THEN Aire END ) AS Intensite_A, AVG( CASE WHEN NomAnalyse = 'B' THEN Aire END ) AS Intensite_B FROM Peptide GROUP BY Sequence, Charge, Modification
Non, en fait, C'est pas la moyenne des Aire pour chaque sequence, je t'explique:
pour cette exemple :

Sequence_Charge_Modification-Intensité-NumReplicat-NumFraction-NomAnalyse
Seq1-2-modif1-3-1-1-A
Seq1-2-modif1-4-1-2-A
Seq1-2-modif1-0-1-3-A
Seq1-2-modif1-1-2-1-A
Seq1-2-modif1-2-2-2-A
Seq1-2-modif1-5-2-3-A
Seq1-2-modif1-1-3-1-A
Seq1-2-modif1-0-3-2-A

mon intensité de la seq1 dans Analyse A est :

Intensité = ((3+4+0)+(0+1+2)+(5+1+0))/3
Intensité = Moyenne des intensité des Replicat, et chaque intensité de replicat et la somme des intensité des fraction

Autrement dit c'est la somme par répliquat divisé par le nombre de répliquats.

Comme ceci alors peut-être ?

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
SELECT Sequence,
	Charge,
	Modification,
	AVG(Intensite_A) AS moyenne_A,
	AVG(Intensite_B) AS moyenne_B
FROM
(
	SELECT Sequence,
		Charge,
		Modification,
		NumReplicat,
		SUM(
			CASE
				WHEN NomAnalyse = 'A' THEN Aire
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_A,
		SUM(
			CASE
				WHEN NomAnalyse = 'B' THEN Aire
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_B
	FROM Peptide
	GROUP BY Sequence, Charge, Modification, NumReplicat
) tmp
GROUP BY Sequence, Charge, Modification

Citation:

Envoyé par CinePhil

Autrement dit c'est la somme par répliquat divisé par le nombre de répliquats.

Comme ceci alors peut-être ?

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
SELECT Sequence,
	Charge,
	Modification,
	AVG(Intensite_A) AS moyenne_A,
	AVG(Intensite_B) AS moyenne_B
FROM
(
	SELECT Sequence,
		Charge,
		Modification,
		NumReplicat,
		SUM(
			CASE
				WHEN NomAnalyse = 'A' THEN Aire
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_A,
		SUM(
			CASE
				WHEN NomAnalyse = 'B' THEN Aire
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_B
	FROM Peptide
	GROUP BY Sequence, Charge, Modification, NumReplicat
) tmp
GROUP BY Sequence, Charge, Modification

Oui voila, C'est exactement ça
Merci bcp pour ton aide