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| <?php
$toto = '((((1:0.a1,2:a2)3:0.a3,((4:0.b1,5:0.b2)6:0.b3,(7:0.c1,8:0.c2)9:0.c3)10:0.bc3)11:0.abc3,(12:0.d1,13:0.d2):0.d3)14:0.abcd3,15:0.e2)';
$toto ='((((1:0.01,2:0.01):0.05,(5:0.02,19:0.02):0.04):0.05,(3:0.03,4:0.03):0.08):0.59,(7:0.13,20:0.13):0.57):0.14,6:0.84)';
$arbre = new Newik( $toto);
echo '<pre>';
print_r( $arbre->parse() );
print_r( $arbre->showGroups() );
Class Newik {
protected $arbre;
private $position;
private $max_leng;
private $groupes;
static $DEBUG = false;
function __construct($arbre){
$this->arbre = $arbre;
$this->init();
}
function init(){
$this->position=0;
$this->max_leng = strlen($this->arbre);
}
function debug($msg, $tampon, $flag){
if ( self::$DEBUG ) {
echo $this->arbre,"\n";
$turing = str_repeat('.',$this->max_leng)."\n";
$turing[$this->position]= "^";
echo $turing;
echo $msg,' ',$this->arbre[$this->position],' position:',$this->position,' tampon:',$tampon,' flag:',$flag,"\n\n";
}
}
function appendChild(&$resultat, $flag,$tampon){
$this->debug('naming ', $tampon, $flag );
if ( $flag == 2 ){
$last = array_pop($resultat);
$resultat[$tampon]=$last;
}
else {
$resultat[]=$tampon;
}
}
function parse(){
$flagNomGroupe = 0; // a 2 lorsque ce qui suit peut être un nom de sous groupe.
$tampon = '';
$this->debug(' begin ', $tampon, $flagNomGroupe );
$resultat=array();
while( $this->position < $this->max_leng ){
$tmp = $this->arbre[$this->position];
if( $tmp == '(' ) {
$this->debug('open ', $tampon,$flagNomGroupe );
$this->position++;
$resultat[]= $this->parse(); //passage par référence!
$flagNomGroupe = 1; //d'apres wikipedia, on peut avoir un nom de groupe apres une ), dans ce cas pas de ,
}
else if ($tmp == ')') {
//on a fini de lire le fils de droite
$this->debug('closing ', $tampon,$flagNomGroupe );
$this->appendChild($resultat, $flagNomGroupe, $tampon);
return $resultat;
}
else if( $tmp == ',' ) {
// on a fini de lire le fils de gauche
$this->debug('inter ', $tampon,$flagNomGroupe );
$this->appendChild($resultat, $flagNomGroupe, $tampon);
$flagNomGroupe = 0;
$tampon = '';
}
else {
$tampon .= $tmp;
if ( $flagNomGroupe == 1 ){
$flagNomGroupe = 2;
}
}
$this->position++;
}
// ne doit pas s'afficher.
return $resultat;
}
function showGroups(){
$this->init();
$arbre = $this->parse();
$this->groupes = array(); //c'est pourquoi c'est privé.
$this->readGroups($arbre);
return $this->groupes;
}
private function readGroups( $racine ){
$feuillage = array(); // la liste de toute les feuilles issue d'une racine !
if ( is_array($racine) ) {
// on n'est pas sur une feuille
foreach ( $racine as $tronc => $branches ){
//echo 'tronc = ', $tronc,"\n";
$feuilles = $this->readGroups( $branches );
// d'abord on prépare ceci.
$feuillage = array_merge($feuillage, $feuilles);
// ensuite, chaque fois qu'on a autre chose qu'un noeud non nommé qui a un nom non automatique
// il se trouve que les noms "automatiques" sont des entiers alors que les noms explicites des chaines...
if ( is_string( $tronc) )$this->registerGroup($tronc, $feuilles);
}
}
else {
//on est sur une feuille,
// on ajoute une feuille et rien d'autre a faire !
$feuillage[]=self::readID($racine);//ici c'est pas vraiment une branche, c'est une feuille.
}
return $feuillage;
}
//protected pour autoriser la dérivation ...
static protected function readID($string){
$tab = explode(':',$string,2);
return $tab[0];
}
//protected pour autoriser la dérivation ...
protected function registerGroup($clee, $feuilles){
//print('registering '.$clee."\n");
$tab = explode(':',$clee,2);
if( count($tab) == 2 ){
$distance = $tab[1];
if( empty($tab[0]) ) {
$nom = 'Anonymous';
}
else{
$nom = $tab[0];
}
}else { //count == 1{
$distance = 'Unknown';
$nom = 'Anonymous';
}
$this->groupes[]= array(
'Nom'=> $nom,
'Apprenants' => count($feuilles), //??
'Distance' => $distance,
'ID' => $feuilles );//??
}
} |
