Bonjour,
Je souhaite récupérer toutes les données d'un fichier EMBL en PERL.
C'est-à-dire, j'aimerais récupérer les tags et les infos séparément.
Par exemple avoir :
$tag_id = "ID";
$infos_id = "EU552783; SV 1; linear; genomic DNA; STD; VRT; 574 BP.";
Un petit bout de fichier EMBL pour illustrer :
En réalité je sais récupérer toutes les parties d'un fichier au format FASTA grâce à Bio::SeqIO en utilisant les fonctions primary_id(), desc(), seq(), je voudrais faire la même chose dans un fichier EMBL mais avec tout les tags. Savez-vous comment je dois m'y prendre ? Quel module utiliser ? Quelles fonctions à connaître ?Code:
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9 ID EU552783; SV 1; linear; genomic DNA; STD; VRT; 574 BP. XX AC EU552783; XX DT 27-APR-2008 (Rel. 95, Created) DT 27-APR-2008 (Rel. 95, Last updated, Version 1) XX DE Opisthonema oglinum voucher H98 16S ribosomal RNA gene, partial sequence; DE mitochondrial.
/!\ Je ne demande pas de faire le travail à ma place, juste de m'aiguiller sur les choses à utiliser. J'aime bien les exemples mine de rien ça aide pas mal ^^
Merci beaucoup.
PS : Etant nouveau sur ce forum je dit à tous : Bonjour !