Extraction de données avec awk

Bonjour à tous,

Je suis complètement novice dans les commandes shell, mais je me dis que ce serait plus rapide de scripter mon problème en shell qu'en python...

voilà : j'ai un fichier txt avec un "header" de 23 lignes puis une phrase "Result i,30" et ensuite des chiffres arrangé de maniere particuliere du type :

Citation:

---

Result i, 30
82 82 82 0
0.3871 0.000 0.000 0.000 0.000
-0.971559798 0.196499691 -0.132134137
-0.173016175 -0.970059688 -0.170439444
-0.161669298 -0.142730769 0.976468620
[...]

---

Ce que j'aimerais faire c'est récupérer la valeur de i et ensuite récuperer la derniere colonne de chiffre (-0.132134137,-0.170439444,0.976468620), et ecrire tous ca dans un fichier result.txt.

Evidement cette séquence "Result i", se reproduit n fois dans mon fichier texte.
Voilà, j'espere que le probleme est pas trop mal pose.

Je me suis dit que je pouvais essayer d'utiliser grep ou awk pour extraire les information dans un autre fichier texte.

Mais la question est comment ecrire ce awk ?

En gros il faut qu'il trouve la ligne qui aura "Grain" && "," dans la meme ligne puisqu'il saute 2 lignes et qu'il recuperer la 3eme colonne des 3 lignes suivantes.

Si j'ecris:

Code:

---

awk '{ print $3}' fichier.txt > recup.txt

---

Il me recupere bien les 3eme colonne mais evidement sans distinction entre les lignes...

Une idée ? une proposition ?

Merci pour votre aide !

Bonjour,

juste une question, le i correspond à quoi, donne un exemple ?


Sinon, en attendant ta réponse, pour récupérer la dernière colonne :

Code:

---

1 2	egrep -i "[.0-9-]{3,}$" ./fichier.txt

---

A+

Merci beaucoup pour l'aide !

Si je comprends bien la structure de egrep:
[.0-9-]: type de structure de la ligne conserné
{3,}$: imprime la troisieme colonne
./fichier.txt : applique sur le fichier.txt
A quoi sert l'option -i ?

Est-ce que c'est plus efficace que:

Code:

---

1 2	awk '{ print $3}' fichier.txt | head -739 > result.txt

---

Pour répondre à la question, i s'ingremente pour chaque série de résultat. Mon fichier est structuré comme ca:

Citation:

---

Header (23 lignes de texte)
Result 1, 30
82 82 82 0
0.3871 0.000 0.000 0.000 0.000
-0.971559798 0.196499691 -0.132134137
-0.173016175 -0.970059688 -0.170439444
-0.161669298 -0.142730769 0.976468620
[...suite de chiffre...]
Result 2, 30
82 82 82 0
0.3871 0.000 0.000 0.000 0.000
-0.971559798 0.196499691 -0.132134137
-0.173016175 -0.970059688 -0.170439444
-0.161669298 -0.142730769 0.976468620
[...suite de chiffre...]
etc

---

Salut,

Une solution avec "sed" :

Code:

---

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23

$ cat brol Header (23 lignes de texte) Result 1, 30 82 82 82 0 0.3871 0.000 0.000 0.000 0.000 -0.971559798 0.196499691 -0.132134137 -0.173016175 -0.970059688 -0.170439444 -0.161669298 -0.142730769 0.976468620 [...suite de chiffre...] Result 2, 30 82 82 82 0 0.3871 0.000 0.000 0.000 0.000 -0.971559798 0.196499691 -0.132134137 -0.173016175 -0.970059688 -0.170439444 -0.161669298 -0.142730769 0.976468620 [...suite de chiffre...] etc   $ sed -n '/^Result [0-9]\+/{n;n;n;N;N;s/^.* \(.*\)\(\n\|$\)/\1,/Mgp;}' brol -0.132134137,-0.170439444,0.976468620, -0.132134137,-0.170439444,0.976468620,   $

---

;)

+1 pour zip31 qui a la solution, il est trop fort.

Sinon, le -i pour egrep, tu peux l'enlever. le -i veut dire insensible à la casse. Mais comme tu ne manipule que des chiffres t'as pas besoin du -i du egrep.

Sinon il y a plus court :

Code:

---

1 2	egrep -o "Result [0-9]+|[.0-9-]{3,}$" ./fichier.txt

---

Si tu veux mettre le rapport dans un fichier :

Code:

---

1 2	egrep -o "Result [0-9]+|[.0-9-]{3,}$" ./fichier.txt > result.txt

---

Merci beaucoup pour vos réponses !

Alors j'ai testé vos deux solutions, mais j'ai du mal m'y prendre...

Pour la solution avec egrep.
Dans mon fichier result, j'ai bien les trois dernieres colonnes mais de toutes les lignes...

Mon fichier est un peu plus structuré entre les [...]:

Citation:

---

Result 1, 82
82 82 82 0
0.3871 0.000 0.000 0.000 0.000
-0.971559798 0.196499691 -0.132134137
-0.173016175 -0.970059688 -0.170439444
-0.161669298 -0.142730769 0.976468620

-3.342165761 -0.595175652 -0.556142395
0.675958948 -3.337005384 -0.490993853
-0.454541440 -0.586311697 3.359052108

-0.795103708 -0.847514928 10.603301415

-37.784833414 12.454223538 228.560120681

0.093339613 -0.074214672 0.079106715 0.989708051

1 829 5996 -1 -1 0
2 31 12181 -1 0 -1
.
.
.
result 2, 63
82 63 63 0
1.1763 0.000 0.000 0.000 0.000
-0.953766415 0.298959658 0.030866630
0.299204919 0.934779320 0.191478560
0.028390878 0.191861267 -0.981011321

-3.280956522 1.029264940 0.097664621
1.028421240 3.215640915 0.660002770
0.106181207 0.658686257 -3.374679001

-241.609267182 -1562.982631150 -154.837745709

-9.157386408 191.183419938 188.417321602

0.000629284 -0.152040773 0.983559488 -0.097436869

1 1421 24175 -1 -1 0
2 2016 19405 -1 0 -1

---

Et donc moi ce qui m'interesse c'est les chiffres en gras...
Mais peut etre qu'il suffit que je fasse un deuxième traitement sur le fichier qui sort de egrep...

Solution avec seq:

Ca semblait evident donc voici ce que j'ai tapé:

Code:

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1 2 3

sed -n '/^Result [0-9]\+/{n;n;n;N;N;s/^.* \(.*\)\(\n\|$\)/\1,/Mgp;}' fichier.txt

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Sauf que j'ai rien en sortie :calim2:
Qu'est ce que j'ai mal fait ?


Merci beaucoup beaucoup pour votre aide !

Citation:

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Envoyé par Loane69

Sauf que j'ai rien en sortie :calim2:
Qu'est ce que j'ai mal fait ?


Merci beaucoup beaucoup pour votre aide !

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Attention à la casse dans ton texte (Result est différent de result :?)

Chez moi en rectifiant result pour Result ça marche bien :

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48

$ cat fich Result 1, 82 82 82 82 0 0.3871 0.000 0.000 0.000 0.000 -0.971559798 0.196499691 -0.132134137 -0.173016175 -0.970059688 -0.170439444 -0.161669298 -0.142730769 0.976468620   -3.342165761 -0.595175652 -0.556142395 0.675958948 -3.337005384 -0.490993853 -0.454541440 -0.586311697 3.359052108   -0.795103708 -0.847514928 10.603301415   -37.784833414 12.454223538 228.560120681   0.093339613 -0.074214672 0.079106715 0.989708051   1 829 5996 -1 -1 0 2 31 12181 -1 0 -1 . . . Result 2, 63 82 63 63 0 1.1763 0.000 0.000 0.000 0.000 -0.953766415 0.298959658 0.030866630 0.299204919 0.934779320 0.191478560 0.028390878 0.191861267 -0.981011321   -3.280956522 1.029264940 0.097664621 1.028421240 3.215640915 0.660002770 0.106181207 0.658686257 -3.374679001   -241.609267182 -1562.982631150 -154.837745709   -9.157386408 191.183419938 188.417321602   0.000629284 -0.152040773 0.983559488 -0.097436869   1 1421 24175 -1 -1 0 2 2016 19405 -1 0 -1   $ sed -n '/^Result [0-9]\+/{n;n;n;N;N;s/^.* \(.*\)\(\n\|$\)/\1,/Mgp;}' fich -0.132134137,-0.170439444,0.976468620, 0.030866630,0.191478560,-0.981011321,   $

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Bonjour zipe31,

J'ai repris exactement ce que tu avais fait et si on copie cash effectivement ca marche aussi tres bien chez moi, mais avec le fichier que je traite ca ne fonctionne pas correctement.
Apres plusieurs test, j'ai compris que la syntaxe n'etait pas tout a fait pareil, en fait il y a des espaces entre Result et le chiffre, et comble de mal chance, leur nombre varie.

Lors qu'il y a 4 espaces la syntaxe devient :

Code:

---

1 2	sed -n '/^result[ ][ ][ ][ ][0-9]\+/{n;n;n;N;N;s/^.* \(.*\)\(\n\|$\)/\1,/Mgp;}' fich.txt

---

Comment je peux ecrire pour tenir compte des espaces variables ?

EDIT:
C'est bon j'ai trouvé !

Code:

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1 2	sed -n '/^result[ ]*[0-9]\+/{n;n;n;N;N;s/^.* \(.*\)\(\n\|$\)/\1,/Mgp;}' fich.txt

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Merci encore !
C'est trop bien cette fonction !

Salut Loane69,

Au choix, soit /^Result \+[0-9]\+/, soit /^Result *[0-9]\+/. Attention dans la seconde syntaxe il y a 2 espaces avant l'astérisque.