innoDB ou myIsam ?

Bonjour

J'aimerais savoir quel type de format offre les meilleures performances, innoDB avec gestion des relations par index ou myIsam ?

Si je pose cette question, c'est parce que dans un programme, grâce à un événement onClick, je lance une fonction Ajax qui, par le biais d'un fichier php, effectue un simple INSERT INTO.
En retour, la fonction Ajax lance une nouvelle fonction qui met à jour le contenu d'un Div.
Cette nouvelle fonction comporte 2 requêtes SQL qui par jointure, pointe les index de mes tables innoDB.

Le principe est relativement simple et pourtant, je trouve que le temps de réponse de la deuxième fonction (celle qui met à jour le div), est relativement long (environ 2 secondes).

Mes tables comportent en moyenne 4 champs dont 1 clé primaire et 1 ou 2 index. Et le nombre d'enregistrements dans chaque table ne dépasse pas 50 lignes.

Suis-je trop exigeant ou il se peut qu'il y ait un problème d'optimisation sur ma base de données ?

On peut voir la structure de la BDD ?

Vu le faible volume de données, je pencherais quand même pour une mauvaise optimisation du code de l'application car 2 secondes, c'est effectivement trop !

InnoDB ou MyISAM devraient être capables d'exécuter leur boulot en une fraction de seconde.