Garder en mémoire un dictionnaire

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Bonjour à tous,

Je dispose d'un fichier excel avec deux colonnes, je le lis, puis je crée un dictionnaire qui contient en clé les valeurs de la première colonne, et en valeurs les "valeurs" de la seconde colonne.

Mon but est d'assimiler les clés de ce dictionnaire à une colonne de données présente dans un autre fichier (ces données correspondent aux valeurs de mon dictionnaire).
Seulement lorsque je lis mon autre fichier et que je fais ma boucle, je perds les données de mon dictionnaire et la comparaison n'a pas lieu, je ne sais pas si je suis très clair :aie: le code sera peu être plus parlant :
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 File = open("mart_export-1.txt","r") # r indique lecture File2 = open("BIOGRID-ORGANISM-Homo_sapiens-3.1.81.tab2.txt","r") # r indique lecture dico={} for ligne in File.readlines(): ligne = ligne.rstrip('\n') # on retire le dernier caractere (retour chariot) cols = ligne.split(',') # Decoupage de la ligne pour recuperer les differents elements if dico.has_key(cols[0])==False: #si la valeur lue n'est pas une cle du dico, alors on l'ajoute dico[cols[0]]= cols[3] # on attribut a cette cle la valeur situee dans la colonne 3 (IDENTREZ) else: pass for ligne2 in File2.readlines(): ligne2 = ligne2.rstrip('\n') # on retire le dernier caractere (retour chariot) cols2 = ligne2.split(' ') # Decoupage de la ligne pour recuperer les differents elements if dico.values() == cols2[1]: # si la valeur de la colonne correspond a la valeur de mon dico : ok print "ok"
Je n'ai pas de soucis de compilation, mais le dico que j'utilise dans ma seconde boucle est "vidé" de ses valeurs, ma comparaison ne me renvoie donc aucun "ok". Je voudrais donc savoir comment réutiliser mon dico dans le nouveau fichier de lecture.

J'espère avoir été clair je m'y perds moi même parfois :roll:

Merci à vous

Bonjour,

Vous rendez vous compte que votre première boucle n'est pas finie ?
Code:

1 2 3 4 for ... premier traitement for .... on ne travaille que sur le premier résultat.
Ce n'est pas plutot:
Code:

1 2 3 4 for ... traitement for .... traitement.
@+

17/12/2011, 15h48
afranck64

Je pense que tout à été dit. +2**0 PauseKawa :mouarf:
17/12/2011, 15h51
tom77380

En effet vous avez raison mon indentation était incorecte, seulement je n'ai toujours pas de retour sur la comparaison (alors que je suis sur que des valeurs sont bien équivalentes), cette ligne là est'elle corecte ?

Code:

if dico.values() == cols2[1]:

Je compare bien la valeur de mon dico aux valeurs de la colonne de mon fichier de lecture ?
17/12/2011, 15h57
afranck64

Citation:

Envoyé par tom77380

Code:

if dico.values() == cols2[1]:

Je compare bien la valeur de mon dico aux valeurs de la colonne de mon fichier de lecture ?

Euh, je me questionne à ce niveau.

Code:

dico[cols[0]]= cols[3] # on attribut a cette cle la valeur situee dans la colonne 3 (IDENTREZ)

Pourriez vous nous présenter une sortie à coup de "print" de cols?

Bonjour,

Citation:

Pourriez vous nous présenter une sortie à coup de "print" de cols?

désolé je ne suis pas sur d'avoir compris, voici ce que me renvoie les différents print de cols lorsque je suis dans ma première boucle
cols[0]

Code:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
 
ENSG00000090975                       
ENSG00000090975
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000090989
ENSG00000091009
ENSG00000091009
ENSG00000091009
ENSG00000091010
ENSG00000091010
ENSG00000091010
ENSG00000091010
ENSG00000091010
ENSG00000091039
ENSG00000091039

cols[3]

Code:

j'ai également affiché mon dico pour voir qu'il avait été rempli correctement:

Code:

1
2
 
ENSG00000165502': '6166', 'ENSG00000188779': '390598', 'ENSG00000160345': '138162', 'ENSG00000072832': '1400', 'ENSG00000128594': '64101', 'ENSG00000026751': '57823', 'ENSG00000128591': '2318', 'ENSG00000128590': '4189', 'ENSG00000184887': '90135', 'ENSG00000100744': '51527', 'ENSG00000129353': '57153', 'ENSG00000100211': '25776', 'ENSG00000033327': '9846', 'ENSG00000142173': '1292', 'ENSG00000100968': '4776', 'ENSG00000206395': '23564', 'ENSG00000100218': '27156', 'ENSG00000120235': '3443', 'ENSG00000100749': '7443', 'ENSG00000151623': '4306', 'ENSG00000196378': '80778', 'ENSG00000121579': '80218', 'ENSG00000181927': '81300', 'ENSG00000130830': '4354', 'ENSG00000107779': '657', 'ENSG00000125551': '5342', 'ENSG00000204983': '5644', 'ENSG00000143457': '55204', 'ENSG00000134256': '9398', 'ENSG00000134255': '10390', 'ENSG00000166348': '159195', 'ENSG00000134253': '80263', 'ENSG00000143452': '84072', 'ENSG00000134250': '4853', 'ENSG00000097033': '51100', 'ENSG00000134259': '4803', 'ENSG00000134258': '79679', 'ENSG00000185432': '25840', 'ENSG00000197153': '8350', 'ENSG00000124935': '10647', 'ENSG00000186187': '84937', 'ENSG00000124939': '4246'}

Biensûr il a des dizaines de millier de lignes en tout.

EDIT: et un extrait de cols2[1]

Code:

17/12/2011, 16h07
PauseKawa

Citation:

Envoyé par afranck64

Pourriez vous nous présenter une sortie à coup de "print" de cols?

Et là tout est dit: pensez à faire un print de vos valeurs, vous trouverez l'erreur.

@+ et bon code.

Note: if cols[0] not in dico

Edit: grilled
17/12/2011, 16h11
tom77380

D'accord merci pour vos conseils je vais regarder tout ça
17/12/2011, 16h12
PauseKawa

Ce n'est pas if cols2[1] in dico.values() ?
17/12/2011, 16h14
tom77380

Citation:

Ce n'est pas if cols2[1] in dico.values() ?

Merci à vous :), ma synthaxe était mauvaise. (je ne comprends pas comment était interprétée ma ligne puisque je n'avais pas de message d'erreurs).
17/12/2011, 16h18
PauseKawa

J'adore l''aircoding' :mouarf:
Pensez à utiliser in lorsque c'est possible, c'est puissant ;)
17/12/2011, 16h21
afranck64

Au vu du "log" je pense avoir trouvé le soucis. Il me semble que les "clés" apparaissent plusieurs fois dans votre premier fichier.

Citation:

a,bla,toto
b,bla,rah
a,bla,tata

Vous donne le dico:

Code:

{'a':'toto','b':'rah'

En supposant votre second fichier soit "identique" au précédent, votre liste cols2 sera:

Code:

cols2 = ['toto','rah','tata']

et puis la comparaison sera toujours fausse.
17/12/2011, 16h24
PauseKawa

Citation:

Envoyé par tom77380

je ne comprends pas comment était interprétée ma ligne puisque je n'avais pas de message d'erreurs

Et bien dico.values() vous retourne la liste (un objet dict_values en Python 3, ce n'est pas le cas ici) des valeurs de dico et vous le comparez à une valeur: donc ce n'est pas une erreur mais c'est False.
17/12/2011, 16h31
afranck64

:aie: La solution y était déjà:

Citation:

Envoyé par PauseKawa

Ce n'est pas if cols2[1] in dico.values() ?
17/12/2011, 16h32
tom77380

Je comprends mieux, merci de m'avoir accordé de votre temps :)