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#include "A.h"
bool ArgumentsB::Init(int argc, const char* argv[])
{
using namespace Args;
ArgumentParser parser;
parser.addArgument ( "-infile=", Argument(1, true) );
parser.addArgument ( "-Tm=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-TmTol=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-TaOpt=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-TaOptTol=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MinLenAmp=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MaxLenAmp=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-HmdG3pEnd=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-HmdGIntern=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-SdmdG3pEnd=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-SdmdGIntern=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-RmLen=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-GCclamp=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-3pEndmSdG=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MabinAmp=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MppTmm=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-CdmdG3pEnd=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-CdmdGIntern=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MinLenPrim=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MaxLenPrim=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MinGC=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MaxGC=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-PrimConc=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-MgConc=", Argument(1, false) );
parser.addArgument ( "-NaConc=", Argument(1, false) );
if(!parser.Parse(argc, argv)) return false;
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-infile=");
FileName = arg.getValue(0);
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-Tm=");
if( arg.isInitiated() ) {
Tm=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-TmTol=");
if( arg.isInitiated() ) {
TmTol=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-TaOpt=");
if( arg.isInitiated() ) {
TaOpt=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-TaOptTol=");
if( arg.isInitiated() ) {
TaOptTol=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MinLenAmp=");
if( arg.isInitiated() ) {
MinLenAmp=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MaxLenAmp=");
if( arg.isInitiated() ) {
MaxLenAmp=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-HmdG3pEnd=");
if( arg.isInitiated() ) {
HmdG3pEnd=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-HmdGIntern=");
if( arg.isInitiated() ) {
HmdGIntern=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-SdmdG3pEnd=");
if( arg.isInitiated() ) {
SdmdG3pEnd=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-SdmdGIntern=");
if( arg.isInitiated() ) {
SdmdGIntern=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-RmLen=");
if( arg.isInitiated() ) {
RmLen=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-GCclamp=");
if( arg.isInitiated() ) {
GCclamp=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-3pEndmSdG=");
if( arg.isInitiated() ) {
_3pEndmSdG=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MabinAmp=");
if( arg.isInitiated() ) {
MabinAmp=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MppTmm=");
if( arg.isInitiated() ) {
MppTmm=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-CdmdG3pEnd=");
if( arg.isInitiated() ) {
CdmdG3pEnd=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-CdmdGIntern=");
if( arg.isInitiated() ) {
CdmdGIntern=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MinLenPrim=");
if( arg.isInitiated() ) {
MinLenPrim=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MaxLenPrim=");
if( arg.isInitiated() ) {
MaxLenPrim=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MinGC=");
if( arg.isInitiated() ) {
MinGC=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MaxGC=");
if( arg.isInitiated() ) {
MaxGC=arg.getInteger(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-PrimConc=");
if( arg.isInitiated() ) {
PrimConc=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-MgConc=");
if( arg.isInitiated() ) {
MgConc=arg.getDouble(0);
}
}
{
const Argument& arg=parser.getArgument("-NaConc=");
if( arg.isInitiated() ) {
NaConc=arg.getDouble(0);
}
}
return true;
} |
