problème de valeur dans un tableau se trouvant dans une liste

Bonjour,

Voilà, j'ai plusieurs tableaux créés avec numpy, ensuite je crée une liste de ces tableaux, mais une fois dans la list, les tableaux n'ont plu le bon contenu.

Code:

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def set_tab_sub_column(self,matrix, id_msa, list_seq): sub_col=sub_column.Sub_column() sub_col.init_tab(len(list_seq)) i=0 j=0 while i<len(matrix[id_msa,0]): tab_column=sub_col.set_tab(matrix, i, id_msa) print tab_column self.tab_sub_column.append(tab_column) i=i+1 print self.tab_sub_column

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tab_column est un tableau créé par numpy
c dans self.tab_sub_column que je les ajoute.

Merci

Alaninho

En faite, j'ai que le dernier tableau dans la list, je ne comprend pas, pourtant j'utilise append().

Alaninho

faudrait voir toute la class ...

…Et mettre un print sur tab_sub_column dans la boucle while, histoire de voir son évolution…

Quand j'imprime tab_column j'obtiens;

[ 43. 46. 37. 34.]
[ 44. 47. 38. 35.]
[ 45. 48. 39. 36.]
[ 46. 49. 40. 37.]
[ 47. 50. 41. 38.]
[ 48. 51. 42. 39.]
[ 49. 52. 43. 40.]
[ 50. 53. 44. 41.]
[ 51. 54. 45. 42.]
[ 52. 55. 46. 43.]
[ 53. 56. 47. 44.]
[ 54. 57. 48. 45.]
[ 55. 58. 49. 46.]
[ 56. 59. 50. 47.]
[ 0.5 0.5 0.5 48. ]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]

et quand j'imprime tab_sub_column :

[array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5])]

la class sub_column :

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15

import numpy as np   class Sub_column: def __init__(self): self.tab=[]   def init_tab(self, length): self.tab=np.zeros((length))   def set_tab(self, matrix, pos_msa, id_msa): i=0 while i<len(self.tab): self.tab[i]=matrix[id_msa, i, pos_msa] i=i+1 return self.tab

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Le reste de la classe Color_msa sert pas pour cette méthode :

Code:

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1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

import numpy as np import sub_column   class Color_msa: def __init__(self): self.tab=[[]] self.tab2=[[]] self.tab_sub_column=[]   def set_tab_sub_column(self,matrix, id_msa, list_seq): sub_col=sub_column.Sub_column() sub_col.init_tab(len(list_seq)) i=0 j=0 while i<len(matrix[id_msa,0]): tab_column=sub_col.set_tab(matrix, i, id_msa) #print tab_column self.tab_sub_column.append(tab_column) i=i+1 print self.tab_sub_column

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Voila j'espère que cela vous aidera plus pour m'aider.

Alaninho

J'ai trouvé, je créai l'objet sub_column au mauvais endroit, que je suis idiot. J'ai perdu un tamps fou ç cause de ça, je dois finir mon projet vendredi.

Alaninho