mm bof. J'opterais pour une autre solution.
Faire un code qui fait des centaines de fois l'opération lente, le passer dans un profiler et voir où il coince :)
Reinstaller eclipse ne changerais rien.
Pas besoin de reinstaller le jdk, tu peux installer plusieurs version en //, suffit ensuite dans ton projet de choisir la jvm que tu veux.