Automatisation d'une tache de lecture de fichiers txt puis écriture dans excel
Pré propos :
j'ai déjà posté dans la section excel de office et VBA :
http://www.developpez.net/forums/d10...criture-excel/
On m'encourage à voir ça en C++ alors me voila !
Bonjour, je connais rien à la programmation mais je me dis que me lancer ne serait pas mal!
je suis étudiant en biologie, et j'aurais besoin d'un gros coup de pouce :
J'utilise un appareillage d'analyse qui me produit des rapports d'analyse
j'aimerais automatiser la lecture de ce type de rapport puis son intégration dans excel, afin d'ensuite réaliser des calculs dans excel (qui eux aussi pourraient être automatisé ensuite, ce serait à voir dans un deuxième temps)
en ce qui concerne les fichier de rapports :
on a une organisation comme ceci :
pour chaque analyse, un dossier est crée et dans ce dossier, je trouve le fichier rapport.txt sous cette forme
Code:
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Batch Run # 9 of 40
Data File C:\CHEM32\1\DATA\RZ 10-20 2011-03-10 15-45-36\SIG1000013.D
Sample Name: C2
Instrument 1 11/03/2011 11:28:48
=====================================================================
Acq. Operator : RENE Seq. Line : 13
Acq. Instrument : Instrument 1 Location : Vial 13
Injection Date : 10/03/2011 07:04:40 Inj : 1
Inj Volume : 1 µl
Acq. Method : C:\Chem32\1\DATA\JJB\RZ 10-20 2011-03-10 15-45-36\RZ FAMES.M
Last changed : 14/02/2011 07:44:20 by Claire
Analysis Method : C:\CHEM32\1\METHODS\LF2.M
Last changed : 11/03/2011 11:13:15
=====================================================================
Area Percent Report
=====================================================================
Sorted By : Signal
Multiplier : 1.0000
Dilution : 1.0000
Use Multiplier & Dilution Factor with ISTDs
Signal 1: FID1 A, Front Signal
Peak RetTime Type Width Area Height Area
# [min] [min] [pA*s] [pA] %
----|-------|----|-------|----------|----------|--------|
1 3.505 BB 0.0491 806.85657 260.73309 5.47135
2 3.683 BB 0.0581 34.59731 8.74691 0.23461
3 4.271 BB 0.0573 2630.44409 726.19055 17.83724
4 5.153 BV 0.0698 402.81317 90.78178 2.73151
5 5.336 VB 0.0751 1749.82727 364.13791 11.86571
6 5.780 BB 0.0713 3307.15698 723.42102 22.42607
7 6.433 BB 0.0730 2319.65869 483.20779 15.72978
8 7.305 BV 0.0794 264.77740 51.10927 1.79548
9 7.502 VB 0.0766 2639.53589 499.58737 17.89889
10 7.920 BB 0.0643 244.70880 59.09523 1.65939
11 8.461 BB 0.0688 65.16162 14.68499 0.44187
12 9.197 BV 0.0778 38.39365 7.13300 0.26035
13 9.408 VB 0.0929 242.99591 40.01165 1.64777
Totals : 1.47469e4 3328.84057
=====================================================================
*** End of Report *** |
Le but serait de créer un fichier excel, dans le répertoire :
C:\CHEM32\1\DATA\RZ 10-20 2011-03-10 15-45-36\
qui contient le répertoire
SIG1000013.D contenant un rapport, mais aussi les répertoires
SIG1000012.D et SIG1000014.D etc...
Je cherche à extraire les donnée suivantes :
le nom de l'échantillon :
C2
et les données correspondantes aux colonnes :
RetTime
Area
Area %
Ces colonnes peuvent contenir un nombre de ligne différent pour chaque analyse
Je voudrais donc générer un fichier excel (ou alors à partir d'un fichier excel, créer une macro qui irait chercher toutes ces données), qui contient pour chaque analyse, une feuille qui aurait pour titre le nom de l'échantillon, et ensuite les 3 colonnes, et les valeurs correspondantes.
J'ai pour cela plusieurs questions :
A votre avis, est ce qu'il vaut mieux créer une macro directement avec excel, ou plutôt créer un script d'extraction des données et de génération d'un fichier excel correspondant ?
Sachant que :
Il faudrait explorer pour ce dossier général, dans chaque sous dossier afin de trouver le fichier texte, et si il y en a un le traiter.
En gros, j'ai 100 fichier rapport par analyse.
je pense que l'on peut développer en 2 temps qui peuvent être plus ou moins indépendantes :
1 explorer les dossiers et trouver le fichier Rapport.txt si il y en a un dans le sous dossier exploré
2 extraire les données du fichier
Merci de me présenter votre avis, et si vous avez une idée de quoi utiliser...
