Parseur de distance

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Parseur de distance

Bonjour,
j'ai un fichier qui contient un couple CV-*** Aster-*** et des distances
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 C169v2-04488 Aster-06787 68.42 76 24 0 187 262 561 636 8e-30 125 C169v2-04488 Aster-02687 28.35 127 81 4 38 154 301 427 0.024 34.3 C169v2-04487 Aster-06725 28.38 148 96 4 92 235 216 357 8e-08 52.4 C169v2-04487 Aster-00105 38.30 47 29 0 36 82 731 777 0.25 30.8 C169v2-04487 Aster-06545 22.54 142 94 3 23 151 507 645 0.55 29.6 C169v2-04487 Aster-05903 31.91 47 29 1 97 143 283 326 1.6 28.1 C169v2-04480 Aster-06724 60.66 61 24 0 371 431 4 64 3e-14 74.7 C169v2-04480 Aster-02153 23.93 305 183 9 34 319 71 345 3e-05 44.7 C169v2-04480 Aster-06101 25.00 248 161 8 14 254 1926 2155 0.001 39.3 C169v2-04480 Aster-06101 23.48 132 83 3 117 230 438 569 3.3 28.1 C169v2-04480 Aster-01563 26.90 145 93 3 117 261 586 717 0.007 37.0 C169v2-04480 Aster-03475 23.97 292 202 8 45 330 549 826 0.012 36.2 C169v2-04480 Aster-01708 22.73 286 166 8 60 306 214 483 0.021 35.4
Et j'ai un autre fichier contenant le couple CV-*** Aster-***:
Code:

1 2 3 4 C169v2-04488 Aster-06787 C169v2-04487 Aster-06725 C169v2-04480 Aster-06724
Je dois a partir du deuxieme fichier "test.txt" aller recuperer les distances respectifs des couples,car comme vous pouvez le voir je ne peux pas regarder que CV-*** car il y a des CV-** qui reviennent souvent donc je dois me baser au couple CV-*** Aster-***, exemple:
C169v2-04488 Aster-06787 distance 187 262 561 636
C169v2-04487 Aster-06725 92 235 216 357
C169v2-04480 Aster-06724 371 431 4 64

Voici mon code mais j'ai un souci car j'arrive pas a lui dire qu'il faut la cle CV-*** Aster-**** puis recuperer dans le deuxieme fichier les distances:
Code:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 #! /usr/bin/python #coding=utf-8 d1,d2={},{} with open('test.txt') as fichier:# ouverture du fichier coco_aster, lecture de chaque ligne et comparaison des doublons.... for line in fichier: cv, aster = line.split('\t')[:2] d1[aster] = cv with open('coco_aster.txt') as fic: for line in fic: ok=line.split('\t')[1:2] print d1.keys()
Merci , si vous avez une idee de comment faire car la je suis perdu

Bonjour,
j'ai modifie un tout petit peu mon code mais j'arrive pas a aller chercher la correspondance des Aster, et mettre la bonne distance:

Code:

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#! /usr/bin/python
 
 
#coding=utf-8
d1,d2,d3={},{},{}
with open('test.txt') as fichier:
		  for line in fichier:	
     		 	 cv, aster = line.split('\t')[:2]
		  	 d1[cv] = aster
 
 
 
with open('coco_aster.txt') as fic:
	for line in fic:
		cv1=line.split('\t')[0:1]
		psositon=line.split('\t')[6:10]
		for i in d1.keys():
			if cv1 ==i:
				print i

Bonjour.

Si j'ai bien tout compris, tu cherches à obtenir les valurs des 4 colonnes qui t'intéressent pour chaque couple (CV-Aster).

Je te propose :

Code:

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#! /usr/bin/python
 
# Obtention des couples (CV-Aster) du fichier test
result = {}
fichier = open('test.txt')
for line in fichier:
	line = line.replace('\n','')
	cv, aster = line.split('\t')[:2]
	result[cv,aster]=[]
 
# Obtention des valeurs pour les couples recherches
fic = open('coco_aster.txt')
for line in fic:
	line = line.replace('\n','')
	data = line.split('\t')
	key = (data[0],data[1])
	if key in result.keys():
		result[key] = [float(data) for data in data[6:10]]
 
# Affichage des resultats
for key,value in result.items():
	print key,':',value

Et le résultat obtenu :

Code:

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('C169v2-04480', 'Aster-06724') : [371.0, 431.0, 4.0, 64.0]
('C169v2-04487', 'Aster-06725') : [92.0, 235.0, 216.0, 357.0]
('C169v2-04488', 'Aster-06787') : [187.0, 262.0, 561.0, 636.0]

Est-ce ce que tu cherchais ?
Bonne journée !

09/03/2011, 13h58
shadow19c

Oui, merci
mais je voulais savoir je voulais qu'il n y est pas les () et les , dans quelle partie je dois changer.

Merci