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T'en es ou maintenant ? t'as réussi à désinstaller et installer bioperl ?

Si si j'utilise trouchelle, c'est d'ailleurs un très bon repository. C'est juste que j'avais testé plusieurs versions de perl donc fait des désinstallations et installations pour diverses raisons. Du...

Bon je pense que j'ai la solution pour ton souci. Enlève le repository de trouchelle également. Fait tes installations de bioperl. Et ensuite remets trouchelle.

Je n'ai pas eu ce soucis sous perl 5.8 et perl 5.10. Essaye ce que j'ai mis dans mon post précédent.

Fait les choses pas à pas.
- Ouvre ppm
- désinstalle tout les modules bioperl.
- supprime les repo bioperl
- ferme ppm
- ouvre une console dos
- essaye de désinstaller bioperl au cas ou.
-...

en console essaye
uninstall bioperl et ressaye de l'installer via la console dos avec l'option -f

Essaye d'afficher la colonne des repositories :

en effet, bizarre. Dans ce cas, ouvre une console dos et essaye

ppm install BioPerl -f

Es tu sûr que tu n'as pas un bioperl installé depuis trouchelle ?

c'est le même lien.
http://bioperl.org/DIST/ pointe vers http://bioperl.org/DIST/package.xml dans ppm.

Donc tu peux le garder. rajoute celui d'update http://bioperl.org/DIST/RC si tu ne l'as pas....

Oui, tous les modules bioperl, même Bundle-Bioperl-Run.

Salut,

Voici une petite explication pour ceux qui sont sous Windows et ont besoin de mettre à jour Bioperl. Beaucoup de personnes utilisent Bioperl version 1.5 sans s'en rendre compte (vieille...