Recherche:

Si c'est ton AS/400 qui appelle un serveur FTP et lui envoie le fichier, il faut utiliser LOCSITE TRIM 0 pour que le fichier soit envoyé avec les blancs de fin d'enregistrement.
Est-tu sûr de ne pas...

Si je comprends bien, ton fichier à plat a bien le filler à blanc en fin de fichier.
C'est le passage sur micro qui te pose problème.
Question : Qu'utilises-tu pour transférer le fichier sur ton...