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Bonjour,

J'ai le code R suivant qui me permet de faire une heatmap :


library(ggplot2)
library(ggtext)

test_data <- read.csv("/home/veillat/Bureau/heatmap.csv")
test_data$Species <-...

Merci à tous pour vos retours ! Ça m'aide énormément, je n'y connais pas grand chose en lignes de commandes...

Pour répondre aux interrogations, je confirme qu'il n'y a bien qu'un seul mot par...

Bonjour à tous,

J'ai le fichier METABAT.txt suivant :

c_000000001
c_000000002
c_000000003
c_000000004
c_000000005
c_000000006

Bonjour à tous,

Comme indiqué dans le titre, j'essaie de colorier les nœuds de mon graphe en fonction de leur centralité d'intermédiarité (le graphe doit être fait en directed force) et suis...

Bonjour,

j'ai les données suivantes:



Clostridium occurence virus
Clostridium Groupes orthologues

Bonjour,

J'ai un extrait de texte suivant :

KX664695_p223 NC_020079_p234 KX552041_p224
NC_031043_p110 NC_031007_p109 NC_021531_p106
MG252693_p6 MG765276_p9 KU052488_p49...

Cela fonctionne, merci beaucoup !

Merci beaucoup pour cette réponse !

Juste un petit détail, pour la colonne 'GC', il faudrait que je fasse une moyenne (et non la somme) des valeurs numériques pour les virus de même nom.
Comment...

Bonjour à tous,

J'ai les données suivantes :

509609

Il faudrait que je réunisse les différents segments des virus segmentés en une seule ligne par virus en faisant la somme de leur taille,...

Bonjour à tous,
J'ai le fichier suivant :


LOCUS MK559245 402 bp DNA linear BCT 30-JUN-2019
DEFINITION Bradyrhizobium sp. strain 83012 ThrA (thrA) gene, partial...

Bonjour,

J'utilise le module NetWorkx afin de trouver toutes les chaines les plus courtes entre deux points d'un graphe.

Tout fonctionne bien à un détail prés; dès qu'il n'existe pas de...

J'ai l'impression que le "get" va prendre uniquement la première lettre de la protéine.
Cela viens du "get" je suppose. Il faut donc que je trouve une autre fonction pour remplacer le get ?

J'ai continué mon script :


import sys
sys.setrecursionlimit(1000000)
from collections import defaultdict
dd = defaultdict(set)
L=[]

proteine1 = (input("Enter the first protein in the...

Certes, l'ordre des protéines changent dans le dictionnaire, mais cela ne modifie pas le parcours du graphe ? les chemins restent bien les mêmes ? je ne vois pas en quoi cela bloque l'algorithme...

Bonjour à tous,

J'avais réussi à terminer ce fameux code, il faut maintenant que j'y apporte quelques modifications:

je dois maintenant demander deux protéines (chiffres) à l'utilisateur. Le...

Merci à tous, le problème est résolu ! :)

C'est bien ça, il faut que j'affiche la chaîne (ou les si il y en a plusieurs de même longueur max) la plus longue (dans le sens ou elle contient le plus de chiffres)
Par exemple la chaine ('6 8 15...

Merci c'est exactement ce que je recherche !
Cependant dans mon fichier il ne s'agit pas de mots, mais de suite de chiffres ce qui complique encore l'affaire...


L1=['66 1 4', '66 1 4 9', '66 1...

Bonjour à tous,

Je travaille sur un script et j'ai un soucis lors de l'affichage de mes résultats

J'ai une liste avec différents mots, je dois afficher les mots de taille maximum. J'y arrives...

Bonjour à tous,

Je dois "réécrire" un script python qui a été codé en python 3.

Il faut que je le réécrive afin qu'il soit interprétable en python 2.7

Cette partie de mon code me pose...

Merci pour la réponse rapide :)

Presque :) Il reste encore la virgule qui apparait...

TNFRSF18, TNFRSF25
TNFRSF18, UTS2
TNFRSF18, TNFRSF9
LMTK2, AFF3
ect...

Bonjour à tous,

J'ai le script suivant (à titre informatif, je ne pense pas qu'il soit très important pour résoudre mon soucis)



L2=[]
L=[]
with open...

Merci pour la réponse,

Oui je savais bien faire comme cela, je voulais surtout savoir si il existait une méthode plus rapide (du même style que L[:2] par exemple pour les intervalles) mais...

Bonjour,

J'ai par exemple une liste L=[78, 25, 69, 2, 5, 123, 58]
Et je souhaite parcourir tout les éléments de cette liste sauf le 69 donc L[2]
Savez vous comment faire cela ?

Merci :)

Etes vous sur qu'elles ne sont pas bloquées ? Si je prends 4-9-33 et que je ne l'autorise pas à reprendre un chiffre déjà utilisé, alors elle doit bien s'arréter là non ?

Je cherche depuis hier...