Bonne pratique pour serveur Apache et virtual host

Bonjour à tous,

je me suis lancé dans l'installation et la configuration d'un serveur web sous Cent OS 7, jusqu'ici tout va bien.

Récemment, j'ai décidé de créer des sous-domaines à mon serveur web, j'ai suivi la configuration suivante :
- pour chaque sous-domaine, j'ai créé un fichier de configuration dans /etc/httpd/sites-available
- créer un lien symbolique pour chaque sous-domaine valide dans /etc/httpd/sites-enabled

Je ne sais pas si cette configuration est la meilleur, mais d'après ce que j'ai vu/lu sur le web cela semblait une bonne pratique.

Toutefois j'ai une question, qui va peut-être vous paraître bête, mais pour laquelle je n'ai pas réussi à trouver de réponse claire :
Où doit-on mettre la configuration de notre serveur principal ?
dans /etc/httpd/conf/httpd.conf ou /etc/httpd/conf.d/ssl.conf ou bien dans un fichier de configuration dans /etc/httpd/site-available ?

Pour résumer :
- j'ai mon domaine : exemple.com,
- mes sous-domaine sousdomain1.exemple.com, sousdomaine2.exemple.com

Avec les configurations :
- domaine exemple.com dans /etc/httpd/conf.d/ssl.conf
- sous-domaine : 1 fichier par sous-domaine dans /etc/httpd/site-available

En espérant être assez clair :D, merci pour votre retour.

Mickaël.
Merci pour votre retour