Utilisation avec JEE et Protégé

Bonjour tout le monde,
Je viens de créer deux ontologies en utilisant protégé
Maintenant, j'aimerais bien les utiliser dans un programme java afin que je puisse les instancier et raisonner sur elles
j'aimerais bien utiliser Jena mais j'ignore comment faire le passage???
d'après ce que j'ai lu, il faut convertir les ontologies en OWL pour pouvoir les utiliser avec Jena
mais comment réunir le tout?
Moi je travaille avec J EE pour la création d'une application basée sur le web (Je crée des JSP).
Pouvez vous m'éclaircir les choses?:calim2:
Bien Cordialement