Heatmap dendogramme clusters
Bonjour,
J'ai fait une heatmap avec dendogramme grace au script :
Code:
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
| png("/Users/Maryl/Desktop/Enzo.png",800,800)
dataset<-read.csv("/Users/Maryl/Desktop/Enzo.csv", sep=",")
row.names(dataset)<-dataset$Compounds
dataset<-dataset[,2:39]
data_matrix<-data.matrix(dataset)
library(RColorBrewer)
library(gplots)
data_heatmap<-heatmap.2(data_matrix,
Rowv=TRUE, Colv=NULL, distfun=dist, hclustfun = hclust, dendrogram="row", scale="none",
key=TRUE, keysize=1, density.info="none", trace="none", col=rev(brewer.pal(7,"PiYG")), xlab="Parameters", ylab="Compounds", margin=c(23,10), cexRow=0.1, cexCol=1)
graphics.off() |
J'obtiens différents groupes/clusters. Mon problème est que j'ai beaucoup de données (1400 lignes et 37 colonnes) et par conséquent, ma légende est illisible. Je ne sais pas par quel moyen selectionner chaque cluster afin de voir à quoi ils correspondent.
Est-ce que quelqu'un connait une fonction pour m'aideràa faire cela ?
Merci pour votre aide.
