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Bioinformatique Perl

Forum Bioinformatique Perl

Toutes vos questions sur les scripts Perl associés à la bioinformatique, modules bioperl, projets bioinformatiques, etc ... Avant de poster, veuillez consulter les cours Perl et les critiques de livres.

  1. Extraction de séquences nucléotidiques des CDS d'un fichier Genbank

    Créée par mathgon, 29/06/2010 18h20
    • Réponses: 4
    • Affichages: 3 253
    Jasmine80
    06/07/2010, 15h35 Aller au dernier message

  2. Bio::Seq => une séquence de quel chromosome ?

    Créée par dev_KooK, 04/05/2010 17h40
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 884
    dev_KooK
    28/09/2010, 17h34 Aller au dernier message

  3. Gbrowse - pb d'affichage si plus d'un référentiel

    Créée par sohnic, 05/05/2010 15h50
    2 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 377
    sohnic
    05/05/2010, 15h50 Aller au dernier message

  4. Clustering Séquences Protéique

    Créée par Leoberos, 14/05/2010 01h27
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 514
    Leoberos
    14/05/2010, 01h27 Aller au dernier message

  5. BLAST hit inverse

    Créée par Antwan76ers, 17/05/2010 16h57
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 532
    Antwan76ers
    18/05/2010, 16h59 Aller au dernier message

  6. Contig séquences répétées

    Créée par Lénou63, 19/05/2010 15h40
    1 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 7
    • Affichages: 1 707
    Jasmine80
    31/05/2010, 15h26 Aller au dernier message

  7. calcul de distance entre deux points.

    Créée par jamsgoodon, 31/05/2010 15h06
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 689
    jamsgoodon
    31/05/2010, 15h06 Aller au dernier message

  8. Script BLAST sur une DB local ou NCBI

    Créée par Camsteack, 09/06/2010 03h15
    • Réponses: 7
    • Affichages: 3 703
    mathgon
    06/07/2010, 10h09 Aller au dernier message

  9. Problème logiciel Gevalt

    Créée par chandlerbing87, 10/06/2010 14h09
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 307
    chandlerbing87
    10/06/2010, 14h09 Aller au dernier message

  10. Possible ou pas possible ? ^^

    Créée par angioedema, 10/06/2010 16h41
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 351
    angioedema
    10/06/2010, 16h41 Aller au dernier message

  11. Afficage Séquence en Fasta ds Script CGI

    Créée par Jane Home, 15/04/2010 18h44
    • Réponses: 4
    • Affichages: 2 167
    Jane Home
    16/04/2010, 15h51 Aller au dernier message

  12. problème parser fichier

    Créée par pontarose, 02/08/2010 18h10
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 416
    pontarose
    04/08/2010, 09h54 Aller au dernier message

  13. RSPerl Utilisation de R in Perl

    Créée par Jane Home, 03/08/2010 16h57
    • Réponses: 6
    • Affichages: 1 851
    Beniou
    04/08/2010, 17h57 Aller au dernier message

  14. blast sur base de données relationnelle

    Créée par horzy, 19/08/2010 13h20
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 760
    djibril
    20/08/2010, 15h28 Aller au dernier message

  15. Parser pour Jackhmmer ?

    Créée par loula427, 22/08/2010 03h54
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 572
    mathgon
    08/09/2010, 13h56 Aller au dernier message

  16. Erreurs de séquençage - Frameshift correction

    Créée par mathgon, 01/09/2010 15h56
    • Réponses: 7
    • Affichages: 2 079
    mathgon
    15/09/2010, 16h59 Aller au dernier message

  17. Cross-reference MIPS-SwissProt et SwissProt-SCOP

    Créée par sirus, 09/09/2010 00h09
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 463
    sirus
    09/09/2010, 00h09 Aller au dernier message

  18. Analyse Microarray how to ?

    Créée par Momoze, 06/10/2010 17h40
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 979
    Momoze
    11/10/2010, 09h20 Aller au dernier message

  19. install gbrowse et mac

    Créée par fripette, 18/10/2010 17h28
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 610
    fripette
    19/10/2010, 11h30 Aller au dernier message

  20. Cherche programme pour effectuer de multiples alignements (pas d'alignement multiple!)

    Créée par Cecolympe, 04/11/2010 12h52
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 909
    Cecolympe
    06/11/2010, 17h11 Aller au dernier message

  21. Amelioration perforformance pour script de filtration

    Créée par loula427, 01/02/2010 17h07
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 485
    loula427
    01/02/2010, 21h38 Aller au dernier message

  22. récupérer une séquence protéique par l' access number avec python

    Créée par Le vagabond, 10/02/2009 17h42
    • Réponses: 4
    • Affichages: 2 052
    djibril
    01/06/2010, 12h26 Aller au dernier message

  23. OO récupération d'informations sur GenBank

    Créée par Jasmine80, 28/09/2009 13h03
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 929
    angioedema
    03/06/2010, 11h20 Aller au dernier message

  24. recherche de tuto

    Créée par max1395, 23/12/2009 17h44
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 662
    angioedema
    01/03/2010, 11h09 Aller au dernier message

  25. bioedit et matrice d'identité

    Créée par poumy, 10/01/2010 17h26
    • Réponses: 2
    • Affichages: 2 051
    poumy
    10/01/2010, 18h44 Aller au dernier message

  26. Quel(s) module(s) pour des alignements?

    Créée par angioedema, 11/01/2010 11h24
    • Réponses: 9
    • Affichages: 1 524
    angioedema
    12/01/2010, 14h49 Aller au dernier message

  27. Performances de BLAT

    Créée par Fol de Dol, 18/01/2010 12h05
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 594
    Fol de Dol
    18/01/2010, 14h24 Aller au dernier message

  28. pb avec clustalW

    Créée par Bioinfoe, 19/01/2010 19h59
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 741
    angioedema
    22/01/2010, 10h50 Aller au dernier message

  29. création de contigs

    Créée par Jasmine80, 21/01/2010 08h51
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 489
    Jasmine80
    21/01/2010, 08h51 Aller au dernier message

  30. options (couleur) module clustalw

    Créée par angioedema, 27/01/2010 10h35
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 747
    angioedema
    27/01/2010, 10h35 Aller au dernier message

  31. Que fait-on réellement en bioinformatique ?!

    Créée par 4Ur3L, 22/05/2008 23h40
    • Réponses: 13
    • Affichages: 11 443
    evazal
    14/09/2010, 13h34 Aller au dernier message

  32. Bio EnsEMBL DBSQL DBAdaptor

    Créée par Jane Home, 09/02/2010 11h49
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 998
    Beniou
    10/02/2010, 23h57 Aller au dernier message

  33. tableau 2 dimensions

    Créée par angioedema, 10/02/2010 11h29
    1 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 12
    • Affichages: 2 198
    angioedema
    23/02/2010, 12h00 Aller au dernier message

  34. Demande d'avis à Bioinformaticiens..

    Créée par les petits apprentis, 22/02/2010 17h35
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 711
    les petits apprentis
    22/02/2010, 17h35 Aller au dernier message

  35. Redondance base de BACends

    Créée par juliej, 25/02/2010 15h26
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 689
    juliej
    06/03/2010, 16h50 Aller au dernier message

  36. Problème de script bioperl RemoteBlast

    Créée par Mylene0726, 01/03/2010 16h29
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 658
    Mylene0726
    07/03/2010, 20h18 Aller au dernier message

  37. problème avec mysql

    Créée par angioedema, 12/03/2010 18h31
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 555
    angioedema
    14/03/2010, 20h44 Aller au dernier message

  38. lecture de fichiers Blast

    Créée par Jasmine80, 24/03/2010 09h24
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 674
    Jasmine80
    24/03/2010, 09h24 Aller au dernier message

  39. Mapping ensemble_id actuel contre ancien

    Créée par fripette, 30/03/2010 16h35
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 408
    fripette
    30/03/2010, 16h35 Aller au dernier message

  40. Bio::DB::Fasta -- Fast indexed access to a directory of fasta files

    Créée par Jasmine80, 09/04/2010 15h08
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 699
    Jasmine80
    16/04/2010, 14h37 Aller au dernier message
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