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Bioinformatique Perl

Forum Bioinformatique Perl

Toutes vos questions sur les scripts Perl associés à la bioinformatique, modules bioperl, projets bioinformatiques, etc ... Avant de poster, veuillez consulter les cours Perl et les critiques de livres.

  1. options du module Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw

    Créée par Jasmine80, 03/12/2010 10h37
    • Réponses: 8
    • Affichages: 2 317
    Jasmine80
    14/12/2010, 10h17 Aller au dernier message

  2. [témoignage] - Ensembl API

    Créée par Jasmine80, 21/09/2015 17h30
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 507
    Jasmine80
    14/12/2015, 10h53 Aller au dernier message

  3. problème de connexion avec Bio::DB::SwissProt

    Créée par Jasmine80, 22/07/2014 14h08
    • Réponses: 8
    • Affichages: 1 265
    Jasmine80
    28/07/2014, 16h34 Aller au dernier message

  4. analyse de contigs

    Créée par Jasmine80, 03/10/2011 13h37
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 390
    Jasmine80
    04/10/2011, 07h55 Aller au dernier message

  5. module perl et dimères d'amorces

    Créée par Jasmine80, 16/08/2011 09h20
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 294
    Jasmine80
    16/08/2011, 09h20 Aller au dernier message

  6. questions ur le software BioEdit

    Créée par Jasmine80, 16/08/2011 09h17
    • Réponses: 6
    • Affichages: 2 515
    mathgon
    07/09/2011, 10h43 Aller au dernier message

  7. Bio::Tools::Run::Ensembl et Perl API ensembl

    Créée par Jasmine80, 05/07/2011 09h10
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 449
    Jasmine80
    05/07/2011, 09h10 Aller au dernier message

  8. récupération de séquences via Bio::DB::EntrezGene

    Créée par Jasmine80, 04/07/2011 14h10
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 470
    Jasmine80
    04/07/2011, 14h10 Aller au dernier message

  9. pogramme Primer Blast

    Créée par Jasmine80, 27/06/2011 14h35
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 432
    Jasmine80
    27/06/2011, 14h35 Aller au dernier message

  10. Bio::DB::Fasta -- Fast indexed access to a directory of fasta files

    Créée par Jasmine80, 09/04/2010 15h08
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 699
    Jasmine80
    16/04/2010, 14h37 Aller au dernier message

  11. lecture de fichiers Blast

    Créée par Jasmine80, 24/03/2010 09h24
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 674
    Jasmine80
    24/03/2010, 09h24 Aller au dernier message

  12. création de contigs

    Créée par Jasmine80, 21/01/2010 08h51
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 489
    Jasmine80
    21/01/2010, 08h51 Aller au dernier message

  13. Blast module Bio::Tools::Run::StandAloneBlast

    Créée par Jasmine80, 21/12/2009 10h33
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 619
    Jasmine80
    21/12/2009, 10h33 Aller au dernier message

  14. module Bio::Tools::Primer3 .

    Créée par Jasmine80, 12/11/2009 09h01
    • Réponses: 11
    • Affichages: 3 285
    pierrot-v
    20/04/2011, 15h13 Aller au dernier message

  15. OO récupération d'informations sur GenBank

    Créée par Jasmine80, 28/09/2009 13h03
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 930
    angioedema
    03/06/2010, 11h20 Aller au dernier message

  16. OO problème d'écriture

    Créée par Jasmine80, 23/09/2009 12h28
    • Réponses: 8
    • Affichages: 1 207
    Jasmine80
    24/09/2009, 09h55 Aller au dernier message

  17. Requête sur bases de données Blast

    Créée par jb59000, 27/01/2009 09h35
    • Réponses: 12
    • Affichages: 3 236
    jb59000
    09/02/2009, 11h06 Aller au dernier message

  18. Contigage des séquences ADN

    Créée par jobim08, 24/06/2008 15h13
    • Réponses: 7
    • Affichages: 2 708
    jobim08
    03/07/2008, 10h46 Aller au dernier message

  19. Split de fichier

    Créée par jobim08, 30/06/2008 13h33
    • Réponses: 8
    • Affichages: 2 010
    jobim08
    02/07/2008, 09h48 Aller au dernier message

  20. Lancer plusieurs command lines sur Linux

    Créée par jobim08, 07/07/2008 12h19
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 613
    jobim08
    07/07/2008, 15h59 Aller au dernier message

  21. Blast avec Perl

    Créée par jobim08, 22/12/2008 16h59
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 527
    Jasmine80
    23/12/2008, 16h23 Aller au dernier message

  22. GLIBC_2.3.2 not found

    Créée par jobim08, 30/12/2008 14h44
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 042
    Arioch
    31/12/2008, 10h18 Aller au dernier message

  23. problem blast local sur serveur

    Créée par jobim08, 18/02/2009 17h02
    • Réponses: 0
    • Affichages: 911
    jobim08
    18/02/2009, 17h02 Aller au dernier message

  24. extraction d'information de resultat du BLAST

    Créée par jobim08, 16/06/2008 12h44
    • Réponses: 2
    • Affichages: 2 225
    jobim08
    16/06/2008, 16h06 Aller au dernier message

  25. GBrowse avec Perl

    Créée par jobim08, 28/08/2009 09h13
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 069
    iblis
    28/08/2009, 12h58 Aller au dernier message

  26. Utilisation GMOD, Chado

    Créée par jobim08, 15/09/2009 11h50
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 657
    MaliciaR
    15/09/2009, 13h18 Aller au dernier message

  27. détermination de position

    Créée par joyeux2000, 02/05/2011 19h43
    • Réponses: 13
    • Affichages: 2 137
    joyeux2000
    20/05/2011, 21h41 Aller au dernier message

  28. thèse bio informatique

    Créée par joyeux2000, 03/04/2011 00h15
    • Réponses: 4
    • Affichages: 4 854
    Norore
    05/04/2011, 12h45 Aller au dernier message

  29. Traitement fichier 2 go

    Créée par JP2mars, 13/10/2009 09h30
    2 Page •
    1 2
    • Réponses: 29
    • Affichages: 2 716
    JP2mars
    05/11/2009, 17h52 Aller au dernier message

  30. Redondance base de BACends

    Créée par juliej, 25/02/2010 15h26
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 689
    juliej
    06/03/2010, 16h50 Aller au dernier message

  31. bioinformatique et banques de données

    Créée par kady.bio, 09/03/2009 00h01
    • Réponses: 1
    • Affichages: 1 095
    Jasmine80
    09/03/2009, 09h05 Aller au dernier message

  32. lancer une commande R dans perl

    Créée par karaudrey88, 16/03/2012 14h09
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 924
    karaudrey88
    19/03/2012, 09h56 Aller au dernier message

  33. tests statistiques et p.value

    Créée par karaudrey88, 16/03/2012 14h52
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 821
    karaudrey88
    19/03/2012, 10h02 Aller au dernier message

  34. Integration de R dans perl

    Créée par karaudrey88, 19/03/2012 10h17
    • Réponses: 5
    • Affichages: 1 475
    mathgon
    20/03/2012, 14h19 Aller au dernier message

  35. synthese de données

    Créée par karaudrey88, 24/07/2012 14h37
    • Réponses: 14
    • Affichages: 1 663
    karaudrey88
    02/08/2012, 15h56 Aller au dernier message

  36. recuperer le meilleur hit d'un blast

    Créée par karaudrey88, 03/12/2012 16h25
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 755
    karaudrey88
    05/12/2012, 13h56 Aller au dernier message

  37. recuperer les query qui n'ont sont no hits found blast

    Créée par karaudrey88, 12/12/2012 14h48
    • Réponses: 2
    • Affichages: 2 165
    karaudrey88
    12/12/2012, 16h47 Aller au dernier message

  38. erreur bioperl avec fichier FASTA

    Créée par karaudrey88, 13/12/2012 14h54
    • Réponses: 0
    • Affichages: 1 844
    karaudrey88
    13/12/2012, 14h54 Aller au dernier message

  39. comparaison de fichiers SAM

    Créée par karaudrey88, 27/03/2013 09h51
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 744
    trex7g2
    29/03/2013, 11h49 Aller au dernier message

  40. comparaison de flags d'un fichier SAM

    Créée par karaudrey88, 05/04/2013 11h45
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 916
    karaudrey88
    09/04/2013, 10h27 Aller au dernier message
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