Forum du club des développeurs et IT Pro - Calcul scientifique https://www.developpez.net/forums/ fr Wed, 03 Jun 2026 07:37:47 GMT vBulletin 15 https://forum.developpez.be/images/misc/rss.png Forum du club des développeurs et IT Pro - Calcul scientifique https://www.developpez.net/forums/ Modèle SCNN3D - images médicales https://www.developpez.net/forums/showthread.php?t=2183647&goto=newpost Sun, 10 May 2026 14:31:17 GMT Bonjour à vous, Je... Bonjour à vous,

Je développe actuellement un modèle hybride (CoxPh sur données cliniques + SCNN3D) qui vise à prédire le risque (0/1) de décès chez des patients atteints d'un cancer.

Voici le split de mes patients post-nettoyage : Train: 185 | Val: 47 | Test: 32. (n_total_patients =300)

Mon modèle prédit le risque sur des images de CT scan 3D, sans espacement.

Voici l'analyse Z-score de mes images du split Train :

GLOBAL_MEAN : -63.7447
GLOBAL_STD : 211.1289
Tumor voxels used : 7,367,361

Voici les résultats de mon test de vérification (pré-Pytorch DataLoader) :

Train | n=185 | event_rate=0.524 | median_time=638.0 | std_time=725.9
Val | n=47 | event_rate=0.532 | median_time=642.0 | std_time=625.4
Test | n=32 | event_rate=0.594 | median_time=742.0 | std_time=654.8

Mon modèle SCNN3D donne une bonne prédiction (selon la littérature, C-index = 0,67) en fonction des hyperparamètres obtenus par recherche bayésienne.

Voici mes hyperparamètres :
{'lr': 2.8378342556804952e-05, 'weight_decay': 0.00010034458104565712, 'dropout': 0.11279484657933202, 'spatial_dropout': 0.10571074333255012, 'dense_units': 64, 'filters1': 16, 'filters2': 16}

Sur mon évaluation finale, j'ai remarqué que l'apprentissage de mon modèle est quasi-constant. C'est-à-dire qu'il n'apprend pas. Mes courbes de loss train, loss_val, loss_lr, loss_c-index sont soit irrégulières, soit non adaptées à l'apprentissage.

Mon modèle devrait prendre en compte le volume, la taille de la tumeur, le mask et l'intensité. J'utilise 3D Augmenter pour diminuer le risque d'un overfitting.

Je suis IR en recherche clinique. C'est la première fois que je travaille sur un modèle SCNN3D. Je suis novice en modèles de convolution.

Quelqu'un aurait une technique pour lancer un diagnostic et voir ce qui ne va pas ?

Par expérience, avez-vous des erreurs classiques et récurrentes que j'aurais involontairement pu commettre ?

Si je procède maintenant à la fusion entre mon CoxPh et SCNN3D, cela pourrait résoudre le problème ?

En vous souhaitant une bonne journée,

Thomas, ]]> Calcul scientifique ThomG https://www.developpez.net/forums/d2183647/autres-langages/python/calcul-scientifique/modele-scnn3d-images-medicales/ gestion des arrays avec numpy https://www.developpez.net/forums/showthread.php?t=2177511&goto=newpost Sun, 15 Jun 2025 14:24:16 GMT Bonjour, je souhaite résoudre... Bonjour, je souhaite résoudre un système de deux équations différentielles avec la méthode d'Euler vectorielle mais j'ai une erreur concernant la taille des arrays (je crois...) . Pourriez-vous m'aider ? Merci !
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]]> Calcul scientifique lilouklousky https://www.developpez.net/forums/d2177511/autres-langages/python/calcul-scientifique/gestion-arrays-numpy/